[發明專利]PNA探針

有效

• 申請號: 201780055378.3
• 申請日: 2017-07-12
• 公開（公告）號: CN109790542B
• 公開（公告）日: 2023-01-10
• 發明（設計）人: 休·亞歷山大·伊萊恩;胡安·J·迪亞斯-莫喬;薩爾瓦托雷·佩爾納加略;馬維斯·塔夫勞·查維斯;馬里奧·安東尼奧·法拉
• 申請（專利權）人: 德斯蒂娜基因組有限公司
• 主分類號: C07K14/00
• 分類號: C07K14/00;C12Q1/6834
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司 11021
• 代理人: 張瑩

1.PNA寡聚體，其中所述PNA寡聚體具有通式：

其中：G是帶電部分，或能夠在預定pH下攜帶電荷的部分；

NB是核堿基；和

l≥1；m≥1；n≥0。

2.權利要求1的PNA寡聚體，其中n≥1。

3.權利要求1的PNA寡聚體，其中所述寡聚體中PNA單元的總數(l+m+n)在12-24的范圍內。

4.權利要求1的PNA寡聚體，其中在其各自的γ位包含帶電部分或能夠在預定pH下攜帶電荷的部分的重復單元的數目，和/或式(V)中具有“G”部分的單元的數目在3-5的范圍內。

5.權利要求1的PNA寡聚體，其中在其各自的γ位包含帶電部分或能夠在預定pH下攜帶電荷的部分的重復單元的數目和/或式(V)中具有“G”部分的單元的數目與重復單元的總數的比例在1:10-1:2的范圍內。

6.權利要求1的PNA寡聚體，其中m＝1。

7.權利要求1的PNA寡聚體，其中PNA分子與固體支持物共價連接。

8.PNA單體，其具有通式：

其中：G是帶電部分，或能夠在預定pH下攜帶電荷的部分；

P₁是保護基團P；

P₃是氫或是保護基團P。

9.權利要求8的PNA單體，其中所述PNA單體具有通式：

其中：Fmoc是芴基甲氧基羰基。

10.權利要求1的PNA寡聚體，其中G為帶電部分。

11.權利要求10的PNA寡聚體，其中G包含一個或多個帶負電荷的基團，選自由羧酸鹽或酯、磺酸鹽或酯、硫酸鹽或酯、膦酸鹽或酯、磷酸鹽或酯組成的組。

12.權利要求10的PNA寡聚體，其中G包含一個或多個帶正電荷的基團，選自由胍鎓、季銨、鏻、锍組成的組。

13.權利要求10的PNA寡聚體，其中G包含一個或多個中性基團，所述中性基團在第一pH下不帶電荷，但能夠在第二或預定pH下攜帶電荷。

14.權利要求13的PNA寡聚體，其中G選自胺、酰肼、肼、胍、烷氧基胺、磺酸和/或其衍生物、和/或膦酸和/或其衍生物。

15.權利要求10的PNA寡聚體，其中G是能夠在6-8的pH范圍內帶電荷的基團。

16.根據權利要求1至7中任一項的PNA寡聚體在遺傳分析方法中的用途。

17.用于制備根據權利要求8或9任一項的PNA單體的方法，該方法包括：

提供根據式(A3)的化合物；

使式(A3)化合物與保護基團P反應；和

水解；

其中G是帶電部分，或能夠在預定的pH下攜帶電荷的部分，和

其中P₁是保護基團。

18.用于制備根據權利要求1至7中任一項的PNA寡聚體的方法，該方法包括使根據權利要求8或9的一種或多種所述PNA單體反應以形成所述PNA寡聚體。

19.根據權利要求18所述的方法，所述方法包括通過其C-末端將PNA單體共價鍵合在固體支持物上的預備步驟。

20.表征核酸序列中的核苷酸的方法，所述方法包括以下步驟：

(a)使核酸與根據權利要求1至7中任一項的肽核酸(PNA)寡聚體接觸，所述PNA寡聚體能夠與核酸的一部分雜交以形成核酸/PNA雙鏈；和

(b)使所述核酸/PNA雙鏈與選自下組的一種或多種修飾堿基接觸：

其中Y是能夠可逆共價反應的官能團；

X₁-X₄是可檢測標簽、間隔-標簽組合或氫；和

Z是碳或氮；

其中PNA寡聚體包含能夠與官能團Y可逆地反應的部分，并且其中與核酸/PNA雙鏈整合的修飾堿基與待表征核苷酸的堿基互補，所述核苷酸通過質譜法或通過修飾堿基的可檢測標簽來表征。