[發明專利]自身免疫疾病的診斷和治療方法

在審

• 申請號: 201780051046.8
• 申請日: 2017-06-20
• 公開（公告）號: CN109790203A
• 公開（公告）日: 2019-05-21
• 發明（設計）人: 邁克爾·威廉·羅;西奧多·邁克爾·塔拉索;喬納森·斯科特·梅爾尼克
• 申請（專利權）人: 健康之語公司
• 主分類號: C07K14/00
• 分類號: C07K14/00;C40B30/04;G01N33/53;G01N33/574;G01N33/68
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 賀淑東

本文提供了用于檢測和診斷自身免疫疾病(包括系統性紅斑狼瘡)的方法、測定和裝置。本文提供的方法、測定和裝置分析肽陣列上外周血抗體的結合模式，該肽陣列與當前的系統性紅斑狼瘡臨床評估標準良好地相關。

交叉引用

本專利申請要求于2016年6月20日提交的序號為62/352,519的美國申請以及于2016年11月11日提交的序號為62/421,185的美國申請的權益；這兩篇美國申請均通過引用整體并入本文。

背景技術

自身免疫疾病患者可經歷慢性活動性疾病、波動的緩解和突發循環，或長時間的靜止期。準確地檢測和確定患者的狀態對于開出適當的藥物方案、評價治療結果、確定患者亞組以及早期檢測突發至關重要，以便改善自身免疫疾病患者的治療結果。

發明內容

本文提供了用于確定或診斷受試者中免疫介導的疾病活動性的方法、測定和裝置。免疫介導的疾病活動性包括但不限于自身免疫疾病活動性、傳染病活動性、癌癥活動性和糖尿病活動性。

因此，本文公開了用于確定受試者的自身免疫疾病活動性的方法、測定和裝置，所述方法包括：使來自受試者的樣品與肽陣列接觸，該肽陣列在該陣列的不同特征上包含多個不同的肽；檢測所述樣品中存在的抗體與所述肽陣列上的一組肽的結合，以獲得結合信號的模式，其中該組肽指示自身免疫疾病活動性；以及將所述結合信號與從具有一系列疾病活動性的參考組中的多個受試者獲得的參考結合信號進行比較，以確定所述受試者中的自身免疫疾病活動性的存在和/或嚴重程度。

在一些實施方案中，所述肽陣列包含至少10,000個不同的肽、至少50,000個不同的肽或至少100,000個不同的肽。在其他實施方案中，所述陣列上的不同的肽是沉積的。在另外其他實施方案中，所述陣列上的不同的肽是原位合成的。在額外其他實施方案中，肽的原位合成包含少于20種不同的氨基酸。在一些實施方案中，在所述肽陣列的合成過程中排除半胱氨酸、甲硫氨酸、異亮氨酸和蘇氨酸。

在一個實施方案中，所述自身免疫疾病包括系統性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、舍格倫綜合征、多發性硬化、潰瘍性結腸炎、銀屑病關節炎、硬皮病和/或I型糖尿病。在其他實施方案中，所述自身免疫疾病是系統性紅斑狼瘡(SLE)。在其他實施方案中，參考樣品中指示SLE的一組肽的結合信號在使用SLEDAI或SLEDAI-SELENA評分系統時評分至少為12的參考組受試者中較高。在另外其他實施方案中，參考樣品中指示SLE的一組肽的結合信號在使用SLEDAI或SLEDAI-SELENA評分系統時評分小于2的參考受試者中較低。在一個實施方案中，參考樣品中指示SLE的一組肽的結合信號在使用SLEDAI或SLEDAI-SELENA評分系統時評分至少為12的參考組受試者中較低。在另一個實施方案中，參考樣品中指示SLE的一組肽的結合信號在使用SLEDAI或SLEDAI-SELENA評分系統時評分小于2的參考組受試者中較低。在另一個實施方案中，參考樣品中指示SLE的一組肽對于圖13A-13G所列的一種或多種序列基序或氨基酸而言富集超過100％。在另外其他實施方案中，參考樣品中指示自身免疫病癥的一組肽的平均結合信號在來自具有高疾病活動性的所述參考組的受試者中低于來自具有更高疾病活動性的所述參考組受試者的所述肽的平均結合信號。

在其他實施方案中，與肽陣列中的其余肽相比，指示SLE的一組肽對于至少一種或多種氨基酸而言富集至少150％。在其他實施方案中，該組肽包含至少10種肽、至少20種肽、至少30種肽、至少40種肽、至少50種肽、至少60種肽、至少70種肽、至少80種肽、至少90種肽或至少100種肽，指示自身免疫疾病活動性。在一個實施方案中，所獲得的結合信號模式對選自低疾病活動性、中度疾病活動性和嚴重疾病活動性的所述自身免疫疾病活動性進行分類。在另一個實施方案中，在0.60至0.70、0.70至0.79、0.80至0.89或0.90至1.0范圍內的所計算的受試者工作特征(ROC)曲線下面積(AUC)確定所述受試者中自身免疫疾病活動性的存在和/或嚴重程度。