[發明專利]一個輔助選擇水稻粒重基因qGW1LEYD的分子標記GW1C

在審

• 申請號: 201711186548.X
• 申請日: 2017-11-22
• 公開（公告）號: CN108004341A
• 公開（公告）日: 2018-05-08
• 發明（設計）人: 曾宇翔;胡依君;楊長登;季芝娟;梁燕;陳淵;曹妮
• 申請（專利權）人: 中國水稻研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發明公開了一個輔助選擇水稻粒重基因qGW1LEYD的分子標記GW1C。GW1C的序列為上游序列：5’?AGCGTTCGCAACTTCG?3’，以及下游序列：5’?ATCCGTTCCGCTTCCA?3’。GW1C標記應用于檢測水稻品種Lemont和水稻品種揚稻4號組配獲得的分離群體后代單株，無需等到水稻成熟期進行粒重鑒定，只需在分離群體的苗期即可檢測出某一個單株在qGW1LEYD座位攜帶的粒重等位基因，在苗期即可選擇不同粒重的水稻單株，可大大提高育種效率。

技術領域

本發明涉及一個輔助選擇水稻粒重基因qGW1LEYD的分子標記GW1C，GW1C的序列為上游序列：5’-AGCGTTCGCAACTTCG-3’，以及下游序列：5’-ATCCGTTCCGCTTCCA-3’。

背景技術

水稻是重要的糧食作物。水稻生產關乎我國的糧食安全。我國水稻育種選育不同粒重水稻的傳統方法均是通過表型鑒定進行的，即在水稻成熟后對粒重進行測量并作出選擇。通過分子標記對水稻粒重相關基因進行選擇可以在水稻苗期即對粒重進行選擇，可以大大提高育種效率。水稻的粒重是一個數量性狀，受多個數量性狀基因座位(QTL)控制。為了有效的提高育種效率，加快育種進程，本發明提出一個輔助選擇水稻粒重基因qGW1LEYD的分子標記GW1C，GW1C的序列為上游序列：5’-AGCGTTCGCAACTTCG-3’，以及下游序列：5’-ATCCGTTCCGCTTCCA-3’。本發明相比傳統的表型選擇方法可大大加快育種效率。例如，傳統方法是在水稻成熟后對粒重進行鑒定并作出選擇，確定了候選單株之后，再利用候選單株在下一代進行雜交或作其他用途；而本發明公開的方法可在水稻苗期即通過分子標記確定不同粒重的候選單株，在當代即可進行雜交或作其他用途，大大提高了育種效率。

發明內容

本發明公開了一個輔助選擇位于水稻第1染色體的粒重基因qGW1LEYD的分子標記GW1C。GW1C的序列為上游序列：5’-AGCGTTCGCAACTTCG-3’，以及下游序列：5’-ATCCGTTCCGCTTCCA-3’。GW1C標記應用于檢測水稻品種Lemont和水稻品種揚稻4號組配獲得的分離群體Fn(n≥2)的單株，利用GW1C標記與qGW1LEYD基因連鎖的特點，無需等到水稻成熟期進行粒重的測量，在分離群體的苗期即可檢測出某一個單株在qGW1LEYD座位攜帶的粒重等位基因，在苗期即可選擇不同粒重的水稻單株，可大大提高育種效率。

具體實施方式

實施例1：在水稻品種Lemont和水稻品種揚稻4號雜交組配的F7代分離群體中，GW1C標記的應用。

將水稻品種Lemont作母本，與水稻品種揚稻4號作父本進行雜交并構建F7代分離群體(Lemont為來自美國的粳稻品種，揚稻4號為來自江蘇的秈稻品種，Lemont和揚稻4號由中國水稻研究所國家水稻種質資源中期庫提供)，這個包括219個單株在內的F7分離群體于2014年5月播種在杭州市富陽區中國水稻研究所試驗場。

1.利用標記GW1C對這個219個單株的分離群體每一單株進行PCR檢測，利用標記GW1C與基因qGW1LEYD連鎖的特點，可檢測出哪個單株在qGW1LEYD座位攜帶Lemont的等位基因(用GW1C標記擴增Lemont的帶型來追蹤qGW1LEYD座位的Lemont等位基因)；哪個單株在qGW1LEYD座位攜帶揚稻4號的等位基因(用GW1C標記擴增揚稻4號的帶型來追蹤qGW1LEYD座位的揚稻4號等位基因)。

2.選擇攜帶不同等位基因的單株以獲得平均千粒重不同的水稻材料(表1)。

表1.在F7世代利用GW1C標記進行選擇得到的攜帶不同等位基因的單株的平均千粒重，該F7群體于2014年5月播種于杭州