[發明專利]一種隴東絨山羊羊絨性狀相關的分子標記物及其應用

有效

• 申請號: 201711115898.7
• 申請日: 2017-11-13
• 公開（公告）號: CN107815497B
• 公開（公告）日: 2020-11-17
• 發明（設計）人: 王繼卿;羅玉柱;車隴杰;郝志云;胡江;劉秀;李少斌
• 申請（專利權）人: 甘肅農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京中恒高博知識產權代理有限公司 11249
• 代理人: 陸菊華

本發明公開了一種隴東絨山羊羊絨性狀相關的分子標記物，所述分子標記物為山羊KRTAP20?2基因的部分DNA序列；所述分子標記物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No：1?SEQ ID No：3所示；并提供了其擴增引物和應用。本發明的有益效果為：本發明提供KRTAP20?2的基因型和等位基因對隴東絨山羊的產絨量和絨層高度有極顯著或顯著影響。含有等位基因A的個體的產絨量較缺失等位基因A的個體高38g，含有等位基因B的個體的產絨量和絨層高度分別較缺失等位基因B的個體低30g和0.1cm。因此，對隴東絨山羊的產絨量進行選種時，應選留含有等位基因A的個體，淘汰含有等位基因B的個體，以達到提高隴東絨山羊產絨量的目的。

技術領域

本發明涉及隴東絨山羊羊絨性狀相關的分子標記育種技術，具體涉及一種隴東絨山羊羊絨性狀相關的分子標記物及其應用。

背景技術

山羊絨指山羊被毛中直徑在25um及以下的毛纖維，是由山羊皮膚中的次級毛囊形成的無髓毛纖維，在國際市場上稱為“開士米”(Cashmere)。由于其具有細而柔軟、光澤良好、保暖性能強等諸多優點，山羊絨的價格昂貴，被稱為“軟黃金”。甘肅省是中國山羊絨的主產區之一，分布有河西絨山羊和隴東絨山羊2個甘肅省特有的絨山羊品種。在所有的羊絨性狀中(例如產絨量、絨層高度、細度、凈絨率等)，產絨量和羊絨細度是最重要的2個性狀，直接決定了羊絨的銷售價格。羊絨性狀主要受到遺傳因素和非遺傳因素(例如年齡、性別、營養等)的影響。研究證明，在遺傳因素中，基因對羊絨性狀起到了重要的調控作用。由于產絨量和羊絨細度是不能早期度量的性狀，且羊絨細度的度量難度較大、成本較高。因此，利用常規育種方法(表型選擇+后裔測定)對羊絨性狀的改良難以在短期內取得良好的效果。分子標記輔助選擇是改良此類性狀的有效方法，可以明顯縮短世代間隔，達到“早選、準選”目的，但前提是尋找到調控羊絨性狀的關鍵基因。

角蛋白(Keratins)和角蛋白關聯蛋白(Keratin-associated proteins，KAPs；其編碼基因標識為KRTAPs)是羊絨纖維的主要蛋白成分，約占羊絨重量的90％。這2類蛋白決定了羊絨纖維的理化特性。KAPs蛋白的典型特征是結構中含有高含量的半胱氨酸或甘氨酸/酪氨酸殘基。根據氨基酸含量，KAPs蛋白可被分為三類，分別是：①高硫KAPs蛋白(high-sulfur KAPs，HS-KAPs，半胱氨酸的含量≤30％)；②超高硫KAPs蛋白(ultra-high-sulfurKAPs，UHS-KAPs，半胱氨酸的含量大于30％)；③高甘氨酸/酪氨酸KAPs蛋白(high glycine/tyrosine KAPs，HGT-KAPs，甘氨酸和酪氨酸的含量占35～60％)。根據氨基酸序列的同源性，KAPs蛋白能被進一步分類為蛋白家族。

目前為止，KRTAPs基因的研究主要集中在人類和綿羊上。例如，在人類和綿羊中，分別有80個KRTAPs基因(屬于25個基因家族)和29個KRTAPs基因(屬于13個基因家族)被鑒別出來。但在山羊中只鑒別出10個KRTAPs基因，包括KRTAP1-1、KRTAP1-4、KRTAP6-2、KRTAP7-1、KRTAP8-1、KRTAP8-2、KRTAP9-2、KRTAP11-1、KRTAP13-1和KRTAP13-3，這表明大量的山羊KRTAPs基因還有待進一步鑒定。

雖然只在山羊中鑒別出少量的KRTAPs基因，但這些基因明顯影響了山羊的羊絨性狀。例如，KRTAP13-1和KRTAP13-3的核苷酸序列變異與絨山羊的產絨量、羊絨直徑和絨層高度顯著相關。在近緣物種—綿羊上，KRTAP1-2、KRTAP6-1、KRTAP6-3、KRTAP8-2和KRTAP22-1的核苷酸變異影響了包括產毛量在內的諸多重要的羊毛性狀。這表明鑒別新的山羊KRTAPs基因以及研究基因多態性對羊絨性狀的影響具有重要的意義，能為絨山羊的遺傳改良提供理論依據和指導。