[發(fā)明專利]一種基于高通量測序的雙歧桿菌快速檢測方法及應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201711111254.0 | 申請日： | 2017-11-13 |
| 公開（公告）號： | CN107653306B | 公開（公告）日： | 2020-05-08 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 陳衛(wèi);陸文偉;胡陸軍;翟齊嘯;趙建新;張灝 | 申請（專利權(quán)）人： | 江南大學(xué) |
| 主分類號： | C12Q1/6869 | 分類號： | C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12Q1/06 |
| 代理公司： | 哈爾濱市陽光惠遠(yuǎn)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 23211 | 代理人： | 張勇 |
| 地址： | 214122 江*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 一種 基于 通量 桿菌 快速 檢測 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種鑒定雙歧桿菌的方法，其特征在于，以groEL基因為標(biāo)記物，以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列為引物，擴(kuò)增獲得標(biāo)記物基因片段的菌株為雙歧桿菌，所述標(biāo)記物基因片段的大小為400～600bp。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述擴(kuò)增是對含有微生物基因組的對象進(jìn)行擴(kuò)增。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述對象包括基因組DNA、菌懸液或單菌落。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述擴(kuò)增是以含待測混合物的基因組DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增。
5.一種鑒定復(fù)雜樣品中雙歧桿菌亞種組成的方法，其特征在于，所述方法包括：(1)構(gòu)建雙歧桿菌groEL基因數(shù)據(jù)庫；(2)以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列為引物，對復(fù)雜樣品基因組中g(shù)roEL基因序列進(jìn)行擴(kuò)增；(3)將擴(kuò)增結(jié)果回收、建庫、測序；(4)將測序結(jié)果與雙歧桿菌groEL基因數(shù)據(jù)庫比對，鑒定雙歧桿菌亞種；所述雙歧桿菌groEL基因數(shù)據(jù)庫含有Genbank數(shù)據(jù)庫中可檢索到的groEL基因序列。
6.一種篩選雙歧桿菌的方法，其特征在于，將待篩選的樣品制成菌懸液，稀釋、涂布于固體培養(yǎng)基上，培養(yǎng)至形成單菌落，再以SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示序列為引物，對groEL基因的序列進(jìn)行擴(kuò)增，擴(kuò)增獲得大小為400～600bp基因片段的菌株為雙歧桿菌。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其特征在于，所述固體培養(yǎng)基包括MRS培養(yǎng)基、BS培養(yǎng)基或BBL培養(yǎng)基。
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