[發(fā)明專利]一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的方法及系統(tǒng)有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201711059447.6 | 申請(qǐng)日: | 2017-11-01 |
| 公開(公告)號(hào): | CN108122235B | 公開(公告)日: | 2020-11-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 陳磊;方陸明;吳超;徐愛俊;唐麗華;樓雄偉 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 浙江農(nóng)林大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G06T7/11 | 分類號(hào): | G06T7/11;G06T7/187 |
| 代理公司: | 寧波市鄞州盛飛專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 33243 | 代理人: | 龍洋 |
| 地址: | 311300 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 層級(jí) 結(jié)構(gòu) 信息 構(gòu)建 細(xì)胞 分割 區(qū)域 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的方法,其特征在于,包括步驟:
S1、定義相差顯微鏡細(xì)胞圖像中的細(xì)胞主要信息、細(xì)胞中間信息及細(xì)胞次要信息;具體地,通過相差顯微鏡成像系統(tǒng),獲取所述相差顯微鏡細(xì)胞圖像;采用多類別最大類間方差算法將所述相差顯微鏡細(xì)胞圖像劃分為深暗區(qū)域、高亮區(qū)域及高亮區(qū)域內(nèi)部的封閉區(qū)域;定義深暗區(qū)域?yàn)榧?xì)胞主要信息,高亮區(qū)域?yàn)榧?xì)胞次要信息,高亮區(qū)域內(nèi)部的封閉區(qū)域?yàn)榧?xì)胞中間信息;
S2、基于所述細(xì)胞主要信息,擴(kuò)展所述細(xì)胞中間信息;
S3、基于細(xì)胞的灰度層級(jí)結(jié)構(gòu)信息,檢測(cè)與分析細(xì)胞之間各自獨(dú)立與相互粘連的情況;
S4、基于已檢測(cè)到的相關(guān)信息,通過區(qū)域塊分離與分組方法,不斷擴(kuò)展細(xì)胞信息以構(gòu)建細(xì)胞最終的分割結(jié)果。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的方法,其特征在于,步驟S2具體包括:
通過幀間關(guān)聯(lián)或者手動(dòng)標(biāo)記的方式確定圖像中各個(gè)細(xì)胞的主要信息;
將可利用的中間信息局部區(qū)域塊與細(xì)胞主要信息相互融合以擴(kuò)展細(xì)胞的檢測(cè)與分割區(qū)域;
若擴(kuò)展區(qū)域范圍時(shí)產(chǎn)生粘連情況,運(yùn)用目標(biāo)對(duì)分離與分組算法進(jìn)行處理。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的方法,其特征在于,步驟S3具體包括:
采用獨(dú)立細(xì)胞與粘連細(xì)胞檢測(cè)方法和粘連細(xì)胞的粘連方式檢測(cè)方法分別對(duì)細(xì)胞關(guān)系進(jìn)行分析檢測(cè)。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的方法,其特征在于,步驟S4具體包括:
采用所述細(xì)胞次要信息進(jìn)行分離與分組算法對(duì)所述細(xì)胞次要信息進(jìn)行合理地分離與分組;
基于分離與分組后的細(xì)胞層級(jí)結(jié)構(gòu)信息,近似估計(jì)目標(biāo)凸集區(qū)域作為最終的目標(biāo)分割結(jié)果。
5.一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的系統(tǒng),其特征在于,包括:
定義模塊,用于定義相差顯微鏡細(xì)胞圖像中的細(xì)胞主要信息、細(xì)胞中間信息及細(xì)胞次要信息;所述定義模塊具體包括:圖像獲取單元,用于通過相差顯微鏡成像系統(tǒng),獲取所述相差顯微鏡細(xì)胞圖像;區(qū)域分類單元,用于采用多類別最大類間方差算法將所述相差顯微鏡細(xì)胞圖像劃分為深暗區(qū)域、高亮區(qū)域及高亮區(qū)域內(nèi)部的封閉區(qū)域;信息分類單元,用于定義深暗區(qū)域?yàn)榧?xì)胞主要信息,高亮區(qū)域?yàn)榧?xì)胞次要信息,高亮區(qū)域內(nèi)部的封閉區(qū)域?yàn)榧?xì)胞中間信息;
擴(kuò)展模塊,用于基于所述細(xì)胞主要信息,擴(kuò)展所述細(xì)胞中間信息;
檢測(cè)模塊,用于基于細(xì)胞的灰度層級(jí)結(jié)構(gòu)信息,檢測(cè)與分析細(xì)胞之間各自獨(dú)立與相互粘連的情況;
分割模塊,用于基于已檢測(cè)到的相關(guān)信息,通過區(qū)域塊分離與分組方法,不斷擴(kuò)展細(xì)胞信息以構(gòu)建細(xì)胞最終的分割結(jié)果。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的系統(tǒng),其特征在于,所述擴(kuò)展模塊具體包括:
標(biāo)記單元,用于通過幀間關(guān)聯(lián)或者手動(dòng)標(biāo)記的方式確定圖像中各個(gè)細(xì)胞的主要信息;
融合單元,用于將可利用的中間信息局部區(qū)域塊與細(xì)胞主要信息相互融合以擴(kuò)展細(xì)胞的檢測(cè)與分割區(qū)域;
處理單元,用于若擴(kuò)展區(qū)域范圍時(shí)產(chǎn)生粘連情況,運(yùn)用目標(biāo)對(duì)分離與分組算法進(jìn)行處理。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的系統(tǒng),其特征在于,所述檢測(cè)模塊具體包括:
分析檢測(cè)單元,用于采用獨(dú)立細(xì)胞與粘連細(xì)胞檢測(cè)方法和粘連細(xì)胞的粘連方式檢測(cè)方法分別對(duì)細(xì)胞關(guān)系進(jìn)行分析檢測(cè)。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于層級(jí)結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建細(xì)胞分割區(qū)域的系統(tǒng),其特征在于,所述分割模塊具體包括:
分離分組單元,用于采用所述細(xì)胞次要信息進(jìn)行分離與分組算法對(duì)所述細(xì)胞次要信息進(jìn)行合理地分離與分組;
構(gòu)建分割單元,用于基于分離與分組后的細(xì)胞層級(jí)結(jié)構(gòu)信息,近似估計(jì)目標(biāo)凸集區(qū)域作為最終的目標(biāo)分割結(jié)果。
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