[發明專利]一種用于鑒定西瓜果實形狀的插入缺失標記位點、引物及應用

有效

• 申請號: 201710943458.4
• 申請日: 2017-10-11
• 公開（公告）號: CN107619875B
• 公開（公告）日: 2021-05-28
• 發明（設計）人: 劉文革;趙勝杰;路緒強;何楠;豆峻嶺
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院鄭州果樹研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京輕創知識產權代理有限公司 11212
• 代理人: 楊立;陳璐

本發明公開了一種用于鑒定西瓜果實形狀的插入缺失標記位點、引物及應用，屬于生物技術領域。所述的插入缺失位點位于西瓜基因組97103的第3號染色體的第26847023位核苷酸到第26847181位核苷酸共計159bp的區域，插入缺失區域的序列如SEQ.ID.NO.1所示。本發明還公開了一種用于鑒定西瓜果實形狀的PCR擴增引物對，一種鑒定西瓜果實形狀的方法及其應用。本發明的插入缺失標記位點，是基于候選基因開發出來的與果實長圓緊密連鎖的插入缺失分子標記，利用該插入缺失標記能夠在苗期準確快速的鑒定出西瓜果實形狀，具有檢測方便、擴增產物穩定的優點。

技術領域

本發明涉及一種用于鑒定西瓜果實形狀的插入缺失標記位點、引物及應用，屬于生物技術領域。

背景技術

選擇是育種中最重要的環節之一，它是指在一個群體中選擇符合要求的基因型來進行后續的培育。然而在傳統的育種過程中，由于很難獲知后代的基因型，因此選擇的依據通常是植株的表現型而非基因型。這種選擇往往耗時較長且可能與基因型有偏差，造成選擇的不準確性和效率低下。而利用分子標記輔助育種可以快速檢測到目標基因或者與目標性狀基因緊密連鎖的位點，達到選擇目標性狀的目的，具有快速、準確、不受環境條件干擾的優點。可作為鑒別親本親緣關系，回交育種中數量性狀和隱性性狀的轉移、雜種后代的選擇、雜種優勢的預測及品種純度鑒定等各個育種環節的輔助手段。

西瓜是世界十大水果之一，而我國是世界第一西瓜生產大國，然而現階段我國西瓜育種主要仍是以傳統育種為主，分子標記輔助育種應用較少。早在上世紀四十年代Weetman等人通過分離群體試驗認為西瓜果實長圓受單基因控制。Yao Cheng等人通過構建西瓜遺傳連鎖圖譜，將西瓜長圓定位到第5號連鎖群，但遺傳圖譜和物理圖譜有一定差異，因此未得到控制果實長圓的候選基因，也未開發出緊密連鎖的標記(詳見：Yao Cheng，etal.Construction of a genetic linkage map of watermelon(Citr ullus lanatus)using CAPS and SSR markers and QTL analys is for fruit qualitytraits.Scientia Horticulturae[J]，2016,202:25-31)。若得到相關性狀的候選基因，基于候選基因開發的分子標記將大大提高分子標記輔助選擇的準去性和有效性。因為分子標記輔助選擇有兩個重要的前提，首先必須得到與目標性轉緊密連鎖的標記，其次檢測要求自動化，由于分子標記輔助選擇要求對大規模群體進行，因此檢測應當快速、低成本、準確性高。

目前，園藝作物中關于果實形狀的研究大多都是定位到某一個位點，未能得到候選基因，而西瓜中關于果實長圓的研究鮮有報道。西瓜果實形狀的選育大多還是通過傳統的雜交育種來進行表型鑒定，選育效率低下。因此開展西瓜果實長圓的研究，確定控制西瓜果實長圓的候選基因，基于候選基因開發緊密連鎖的標記可以為西瓜分子輔助育種提供有效的幫助，同時大大縮短育種進程并提高選擇的準確性。

發明內容

本發明的目的之一，是提供一種用于鑒定西瓜果實形狀的插入缺失標記位點。本發明的插入缺失標記位點，是基于候選基因開發出來的與果實長圓緊密連鎖的插入缺失分子標記，利用該插入缺失標記能夠在苗期準確快速的鑒定出西瓜果實形狀，通過其在育種進程中的運用可以大大加快西瓜果實形狀選擇育種的進程，具有檢測方便、擴增產物穩定的優點。

本發明解決上述技術問題的技術方案如下：一種用于鑒定西瓜果實形狀的插入缺失標記位點，所述的插入缺失位點位于西瓜基因組97103的第3號染色體的第26847023位核苷酸到第26847181位核苷酸共計159bp的區域，插入缺失區域的序列如SEQ.ID.NO.1所示。

本發明的插入缺失標記位點能夠對西瓜果實形狀進行大規模鑒定，不僅快速有效，而且在苗期就可以進行鑒定，大大縮短了育種的周期，可以在生產中大規模應用。

在上述技術方案的基礎上，本發明還可以做如下改進。