[發明專利]利用形態標構建狗牙根核心種質的方法和裝置

有效

• 申請號: 201710769189.4
• 申請日: 2017-08-31
• 公開（公告）號: CN107577920B
• 公開（公告）日: 2020-10-13
• 發明（設計）人: 黃春瓊;劉國道;白昌軍
• 申請（專利權）人: 中國熱帶農業科學院熱帶作物品種資源研究所
• 主分類號: G16B20/00
• 分類號: G16B20/00;G16B40/00
• 代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350
• 代理人: 趙蕊紅

1.一種利用形態標記構建狗牙根核心種質的方法，其特征在于，包括：

根據形態標記，測定狗牙根試驗材料中狗牙根的性狀，獲得狗牙根原始種質的表型數據；

將取樣方法、總體取樣比例、聚類方法和遺傳距離中包含的子策略進行兩兩組合，組合成的策略對所述原始種質進行種質的選取，獲得狗牙根核心種質子集；

根據評價參數將每一個核心種質子集包含的種質的表型數據與原始種質的表型數據進行對比分析，從所述取樣方法、所述總體取樣比例、所述聚類方法和所述遺傳距離中選取出相應的最優子策略；

將組內取樣比例包含的子策略與所述選取出的四種類型最優的子策略進行組合，組合成的策略對分組后的原始種質的每一個小組進行種質的選取，并根據所述評價參數將所選取到的種質的表型數據與原始種質的表型數據進行對比分析，篩選出組內取樣比例的最優子策略；

根據選取出的五種類型的最優子策略，從所述原始種質進行種質的選取，構建成狗牙根核心種質；

所述取樣方法的子策略包括多次聚類優先取樣法、多次聚類變異度取樣法和不聚類完全隨機法；

所述總體取樣比例的子策略包括5％、10％、15％、20％、25％、30％和35％；

所述聚類方法的子策略包括最短距離法、最長距離法、中間距離法、不加權類平均法和離差平方和法；

所述遺傳距離的子策略包括歐氏距離、馬氏距離和主成分距離；

所述組內取樣比例的子策略包括簡單比例、平方根比例和對數比例；

所述評價參數包括均值差異百分率、方差差異百分率、極差符合率和變異系數變化率。

2.如權利要求1所述的利用形態標記構建狗牙根核心種質的方法，其特征在于，所述選取出的五種類型的最優子策略為：所述取樣方法為多次聚類優先取樣法，所述總體取樣比例為20％，所述聚類方法為不加權類平均法，所述遺傳距離為馬氏距離，以及所述組內取樣比例為平方根比例。

3.如權利要求1所述的利用形態標記構建狗牙根核心種質的方法，其特征在于，對所述原始種質進行分組的方法為：

根據植物學分類將所述原始種質分成相應的組類；

根據地理來源將每一組類內的原始種質進行劃分，完成對所述原始種質的分組。

4.一種利用形態標記構建狗牙根核心種質的裝置，其特征在于，包括：

表型數據測定模塊，用于根據形態標記，測定狗牙根試驗材料中狗牙根的性狀，獲得狗牙根原始種質的表型數據；

核心種質子集模塊，用于將取樣方法、總體取樣比例、聚類方法和遺傳距離中包含的子策略進行兩兩組合，組合成的策略對所述原始種質進行種質的選取，獲得狗牙根核心種質子集；

第一策略選取模塊，用于根據評價參數將每一個核心種質子集包含的種質的表型數據與原始種質的表型數據進行對比分析，從所述取樣方法、所述總體取樣比例、所述聚類方法和所述遺傳距離中選取出相應的最優子策略；

第二略選取模塊，用于將組內取樣比例包含的子策略與所述選取出的四種類型最優的子策略進行組合，組合成的策略對分組后的原始種質的每一個小組進行種質的選取，并根據所述評價參數將所選取到的種質的表型數據與原始種質的表型數據進行對比分析，篩選出組內取樣比例的最優子策略；

核心種質構建模塊，用于根據選取出的五種類型的最優子策略，從所述原始種質進行種質的選取，構建成狗牙根核心種質；

所述取樣方法的子策略包括多次聚類優先取樣法、多次聚類變異度取樣法和不聚類完全隨機法；

所述總體取樣比例的子策略包括5％、10％、15％、20％、25％、30％和35％；

所述聚類方法的子策略包括最短距離法、最長距離法、中間距離法、不加權類平均法和離差平方和法；

所述遺傳距離的子策略包括歐氏距離、馬氏距離和主成分距離。

所述組內取樣比例的子策略包括簡單比例、平方根比例和對數比例。

所述評價參數包括均值差異百分率、方差差異百分率、極差符合率和變異系數變化率。

5.如權利要求4所述的利用形態標記構建狗牙根核心種質的裝置，其特征在于，所述選取出的五種類型的最優子策略為：所述取樣方法為多次聚類優先取樣法，所述總體取樣比例為20％，所述聚類方法為不加權類平均法，所述遺傳距離為馬氏距離，以及所述組內取樣比例為平方根比例。

6.如權利要求4所述的利用形態標記構建狗牙根核心種質的裝置，其特征在于，還包括用于對所述原始種質進行分組的種質分組模塊，所述種質分組模塊包括：

植物學分組單元，用于根據植物學分類將所述原始種質分成相應的組類；

地理來源分組單元，用于根據地理來源將每一組類內的原始種質進行劃分，完成對所述原始種質的分組。