[發明專利]一種影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記及應用

有效

• 申請號: 201710696954.4
• 申請日: 2017-08-15
• 公開（公告）號: CN107365853B
• 公開（公告）日: 2019-04-19
• 發明（設計）人: 吳珍芳;楊杰;丁榮榮;鄭恩琴;蔡更元
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣東廣信君達律師事務所 44329
• 代理人: 楊曉松

本發明屬于分子標記輔助選擇及動物遺傳育種技術領域，具體涉及一種影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記及應用。所述的影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記是通過全基因組關聯分析得到，其SNP位點對應于國際豬基因組10.2版本參考序列10號染色體上第39602384個核苷酸位點T>C突變。本發明還提供了一直用于鑒定上述影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記的引物對，通過上述分子標記和引物對，可建立高效準確的分子標記輔助育種技術，將其應用于種豬有效總乳頭數性狀遺傳改良中，從而提高后代豬的有效總乳頭數，進而提高仔豬的成活率，提高企業利潤，增加核心競爭力。

技術領域

本發明屬于分子標記輔助選擇及動物遺傳育種技術領域，具體涉及一種影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記及應用。

背景技術

近些年，在豬中，隨著豬產仔數性狀的不斷遺傳改良，豬產仔數性狀得到快速提高。產仔數的提高甚至已經超過了母豬能夠正常飼養的能力范圍，然而寄養等手段治標不治本，反而增加了管理的難度。因此，豬乳頭數性狀的遺傳改良工作刻不容緩。乳頭數更多的母豬意味著可以哺乳更多的仔豬，在許多種豬場的選留種豬時，均將乳頭數作為一個重要的參考指標，以此獲取更多的經濟效益。然而，乳頭數作為中等遺傳力性狀，傳統的選育方法僅僅單純的對表型進行選擇如人為的將乳頭數量較少的個體本身進行淘汰或者盡量不選擇將其同胞和半同胞留種，實際收效甚微。分子標記輔助育種成為改良這一性狀的不錯選擇。

目前，利用候選基因法和QTL定位兩種方法已經確定了不少與乳頭數相關的候選基因和QTL。候選基因有松弛素基因(Relaxin Gene，RLN)、促卵泡激素β亞基(Follicle-Stimulating Hormone Beta Subunit，FSHβ)、雌激素受體(Estrogen Receptor，ESR)、淋巴增強子結合因子1(Lymphoid Enhancer Binding Factor 1，LEF1)等，QTL數量更是接近200個。但是，候選基因法的由于候選基因的選擇具有一定的隨機性，可能是主效基因，也可能是與實際QTL處于緊密連鎖不平衡狀態中間接對性狀起作用的基因，這給家畜育種帶來了部分風險，此外候選基因法的選擇還具有群體異質性；而QTL定位獲得的QTL遺傳距離跨度很大，往往包含上百個基因，這極大地限制了QTL定位方法在家畜重要經濟性狀的遺傳改良中的應用。如今，全基因組關聯分析(Genome-wide Association Study，GWAS)已經逐步在復雜性狀的遺傳改良方面顯示出獨特的優勢，如提高奶牛產奶量等。相對候選基因法和QTL定位，GWAS可以更準確的定位和識別新基因。

此外，不少研究均表明，乳頭數性狀與部分繁殖性狀如窩產仔數、泌乳力和斷乳窩重之間有中等程度的表型相關和遺傳相關，乳頭數性狀的遺傳規律改良對母豬繁殖性能和提高生產效率同樣具有重要意義。

發明內容

為了克服現有技術的不足與缺點，本發明的首要目的在于提供一種影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記。

本發明的另一目的在于提供上述影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記的應用。

本發明的再一目的在于提供一種鑒定上述影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記的引物對。

本發明的第四個目的在于提供上述引物對的應用。

本發明的第五個目的在于提供一種豬的遺傳改良的方法。

本發明的目的通過下述技術方案實現：

一種影響豬有效總乳頭數性狀的分子標記，其SNP位點對應于國際豬基因組10.2版本參考序列10號染色體上第39602384個核苷酸位點T>C突變；

所述分子標記的SNP位點的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是T或C(SEQ IDNO.1序列標注位置為236的T236-C236的核苷酸突變)，導致豬有效總乳頭數性狀的不同；