[發明專利]PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型及其構建方法和構建系統在審
| 申請號: | 201710576979.0 | 申請日: | 2017-07-14 |
| 公開(公告)號: | CN109504750A | 公開(公告)日: | 2019-03-22 |
| 發明(設計)人: | 戴勇;眭維國;吳炎;杜冬;甘晴;曾君 | 申請(專利權)人: | 戴勇;眭維國;甘晴;吳炎 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C40B50/06 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
| 地址: | 541000 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 構建 差異性表達 圖譜模型 圍手術期 環狀RNA 肝移植 移植術 差異數據 對比數據 構建系統 疾病 肝功能恢復 外周血標本 微陣列芯片 數據分析 特異表達 早期診斷 提取RNA 表達譜 預后 篩查 相異 脫離 治療 分析 健康 | ||
一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型及其構建方法和構建系統,其中,構建方法包括如下步驟:設置疾病組與對照組,每組包括若干份相異人體的已經脫離人體的外周血標本;分別提取RNA;采用circRNA微陣列芯片分析疾病組和對照組RNA溶液中的circRNA表達譜,得到circRNA差異數據;采用RT?PCR驗證疾病組和對照組中circRNA的表達情況,得到對比數據;對circRNA差異數據及對比數據進行數據分析,構建PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型。上述構建方法,通過比較未實施肝移植術前患者與實施肝移植術后患者、健康對照者之間差異性表達的circRNA,篩查PLC特異表達的circRNA以及移植術后早期肝功能恢復相關的circRNA,為PLC早期診斷、預后以及治療提供新的信息。
技術領域
本發明涉及生物醫學技術領域,特別是涉及一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型及其構建方法和構建系統。
背景技術
原發性肝癌(Primary Liver Cancer,PLC)是我國最常見的肝臟惡性腫瘤,該病臨床表現復雜,好發于40至50歲的男性,由多種因素相互影響,例如包括微量元素的化學元素、環境因素和病毒感染,所以其發病機制復雜一直未能闡明,這也給PLC的治療帶來了困難。目前肝移植是治療PLC最有效、最徹底的方法,它將肝臟整個癌變組織切除,換上匹配的健康肝臟組織,使腫瘤盡可能得到清除以及減少復發,同時也有助于肝功能的恢復。由于肝移植是異體移植,不可避免的,患者或多或少會產生免疫排斥反應,保守估計,大約10%的患者可發展為慢性排斥反應。
環狀RNA(circular RNA,circRNA)作為最近被發現的一種特殊的新型內源非編碼RNA,是RNA研究領域的研究熱點。生物體內普遍存在著不能翻譯為蛋白的功能性RNA分子,稱為非編碼RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)。其中circRNA是一類通過反向剪接將3′和5′末端連接起來形成的環形RNA分子。按照剪接來源的不同,circRNA可分為內含子來源環狀RNA以及外顯子來源環狀RNA,主要參與轉錄及轉錄后基因表達的調節。circRNA可能在疾病的發生和發展中發揮著重要的作用,有望成為某些疾病過程的潛在的生物標志物。圍繞環狀RNA進行深入而系統的研究具有較強的創新與現實性意義。
同種異體肝移植是目前治療PLC最徹底、有效的方法,但如何提高供肝利用率和受者生存率一直也是醫療界所面臨的問題。因此,迫切需要發現用于PLC早期診斷和肝移植術后功能恢復相關的新生物標記物。
發明內容
基于此,有必要提供一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型及其構建方法和構建系統。
一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型的構建方法,包括如下步驟:設置疾病組與對照組,每組包括若干份相異人體的已經脫離人體的外周血標本;分別提取各所述外周血標本中的RNA,得到RNA溶液;采用circRNA微陣列芯片分析疾病組和對照組RNA溶液中的circRNA表達譜,得到circRNA差異數據;采用RT-PCR驗證疾病組和對照組中circRNA的表達情況,得到對比數據;對circRNA差異數據及對比數據進行數據分析,構建PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型。
一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型,由如上任一實施例中所述的構建方法制備得到。
一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型的構建系統,采用如上任一實施例中所述的構建方法實現。
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