[發明專利]PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型及其構建方法和構建系統在審
| 申請號: | 201710576979.0 | 申請日: | 2017-07-14 |
| 公開(公告)號: | CN109504750A | 公開(公告)日: | 2019-03-22 |
| 發明(設計)人: | 戴勇;眭維國;吳炎;杜冬;甘晴;曾君 | 申請(專利權)人: | 戴勇;眭維國;甘晴;吳炎 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C40B50/06 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
| 地址: | 541000 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 構建 差異性表達 圖譜模型 圍手術期 環狀RNA 肝移植 移植術 差異數據 對比數據 構建系統 疾病 肝功能恢復 外周血標本 微陣列芯片 數據分析 特異表達 早期診斷 提取RNA 表達譜 預后 篩查 相異 脫離 治療 分析 健康 | ||
1.一種PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型的構建方法,其特征在于,包括如下步驟:
設置疾病組與對照組,每組包括若干份相異人體的已經脫離人體的外周血標本;
分別提取各所述外周血標本中的RNA,得到RNA溶液;
采用circRNA微陣列芯片分析疾病組和對照組RNA溶液中的circRNA表達譜,得到circRNA差異數據;
采用RT-PCR驗證疾病組和對照組中circRNA的表達情況,得到對比數據;
對circRNA差異數據及對比數據進行數據分析,構建PLC圍手術期肝移植患者環狀RNA差異性表達譜圖譜模型。
2.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,分別提取各所述外周血標本中的RNA,得到RNA溶液,具體為:
各取2ml外周血標本,加入1mL TRIzol,用移液管反復吹打多次,得到第一樣品;
將第一樣品于15℃~30℃放置5min后,加入0.2mL的氯仿,震蕩15s后,15℃~30℃孵育2min~3min;
4℃,12,000g離心15min,吸取上層水相;
將水相轉移到新離心管中,加入異丙醇,混勻后15℃~30℃孵育10min,得到第二樣品,其中,異丙醇的加入量為制備第一樣品時加入Trizol試劑量的1/2;
將第二樣品于4℃,12,000g離心10min,使RNA形成RNA沉淀,棄上清;
加入75%乙醇,振蕩混勻后,4℃,7500g離心5min,棄上清;
將RNA沉淀干燥;
加入無RNA酶的水溶解RNA沉淀,55℃~60℃孵育10min,得到總RNA溶液。
3.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,分別提取各所述外周血標本中的RNA,得到RNA溶液,具體為:
將外周血標本使用淋巴分離液分離出單個核細胞;
向單個核細胞沉淀中加入TRIzol,用移液管反復吹打多次,得到第一樣品;
將第一樣品于15℃~30℃放置5min后,加入0.2mL的氯仿,震蕩15s后,15℃~30℃孵育2min~3min;
4℃下12,000g離心15min,吸取上層水相;
將水相轉移到新離心管中,加入異丙醇,混勻后15℃~30℃孵育10min,得到第二樣品,其中,異丙醇的加入量為制備第一樣品時加入Trizol試劑量的1/2;
將第二樣品于4℃,12,000g離心10min,使RNA形成RNA沉淀,棄上清;
加入75%乙醇,振蕩混勻后,4℃,7500g離心5min,棄上清;
將RNA沉淀干燥;
加入無RNA酶的水溶解RNA沉淀,55℃~60℃孵育10min,得到總RNA溶液。
4.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,在分別提取各所述外周血標本中的RNA,得到RNA溶液之后,以及在采用circRNA微陣列芯片分析疾病組和對照組RNA溶液中的circRNA表達譜,得到circRNA差異數據之前,所述構建方法還包括如下步驟:
對總RNA進行純化,并測定總RNA中RNA含量。
5.根據權利要求4所述的構建方法,其特征在于,在對總RNA進行純化,并測定總RNA中RNA含量之后,以及在采用circRNA微陣列芯片分析疾病組和對照組RNA溶液中的circRNA表達譜,得到circRNA差異數據之前,所述構建方法還包括如下步驟:
檢測純化后的總RNA是否合格,是則執行后續步驟,其中,總RNA合格的標準為OD260/OD280比值應為1.8~2.1,且OD260/OD230比值要大于1.8。
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