[發(fā)明專利]一種數(shù)字病理圖像標(biāo)注的方法和系統(tǒng)

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710576906.1
• 申請日: 2017-07-14
• 公開（公告）號: CN107516005A
• 公開（公告）日: 2017-12-26
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 谷朝臣;吳開杰;關(guān)新平;趙姝馨
• 申請（專利權(quán)）人: 上海交通大學(xué)
• 主分類號: G06F19/00
• 分類號: G06F19/00;G06F17/30;G06F3/0484
• 代理公司: 上海漢聲知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司31236
• 代理人: 郭國中

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及圖像處理技術(shù)領(lǐng)域，具體地，涉及一種數(shù)字病理圖像標(biāo)注的方法和系統(tǒng)。

背景技術(shù)

病理圖像的標(biāo)注和信息錄入是病理專家累積專業(yè)診斷經(jīng)驗的重要工具和渠道，其蘊含的豐富、寶貴的專業(yè)數(shù)據(jù)信息，可以為智能病理診斷、病理信息化教學(xué)、病理診斷相關(guān)科學(xué)研究提供大量參考信息。

隨著信息化技術(shù)的發(fā)展，數(shù)字病理診斷相關(guān)的科學(xué)研究，尤其是基于深度學(xué)習(xí)的數(shù)字病理圖像研究，需要大量的數(shù)字病理圖像標(biāo)注信息和分類樣本數(shù)據(jù)，然而目前數(shù)字化的病理圖像標(biāo)注信息非常稀缺。各醫(yī)療單位間的數(shù)字病理圖像標(biāo)注信息不能共享，缺乏一個系統(tǒng)專業(yè)的病理圖像標(biāo)注數(shù)據(jù)庫，嚴(yán)重限制了深度學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)挖掘等科學(xué)手段在智能病理診斷研究中的進一步應(yīng)用。

同時，各醫(yī)療機構(gòu)的數(shù)字病理圖像標(biāo)注方法通常自成體系，缺乏統(tǒng)一的標(biāo)注規(guī)范，不利于數(shù)字病理圖像標(biāo)注的協(xié)同和數(shù)據(jù)共享，從而限制了標(biāo)注的效率和標(biāo)注信息的充分應(yīng)用。

申請?zhí)枮?013104394563的專利“一種標(biāo)注醫(yī)學(xué)圖像的方法、裝置和系統(tǒng)”提出的醫(yī)學(xué)圖像標(biāo)注方法中，由各用戶自由提供各種標(biāo)注，標(biāo)注不具有規(guī)范性和專業(yè)化，無法添加類型(專業(yè)詞條)等語義標(biāo)注信息，且沒有提出已標(biāo)注醫(yī)學(xué)圖像的標(biāo)注區(qū)域數(shù)據(jù)批量導(dǎo)出的方法，標(biāo)注信息無法形成專業(yè)的醫(yī)學(xué)圖像標(biāo)注數(shù)據(jù)庫，無法進一步發(fā)揮更大的作用和價值。申請?zhí)枮?015109671608的專利“一種數(shù)字病理切片的標(biāo)注方法及標(biāo)注裝置”提出的數(shù)字病理切片的標(biāo)注方法中，用戶可提供的標(biāo)注類型只有圖形標(biāo)注和文字描述類標(biāo)注，該專利的主要意義在于標(biāo)注過的病理切片可便于其他用戶或用戶后續(xù)查看，僅適用與個人或小范圍內(nèi)用戶的使用，不能進行數(shù)字病理圖像標(biāo)注的協(xié)同工作和數(shù)據(jù)共享，同時標(biāo)注的形式較為隨意，不具有規(guī)范化和專業(yè)化的特點。

因此，開發(fā)一套專業(yè)化、規(guī)范化、系統(tǒng)化的靈活易用的數(shù)字病理圖像標(biāo)注工具及系統(tǒng)是病理行業(yè)的迫切需求。

發(fā)明內(nèi)容

針對現(xiàn)有技術(shù)中的缺陷，本發(fā)明的目的是提供一種數(shù)字病理圖像標(biāo)注的方法及系統(tǒng)，以實現(xiàn)病理圖像標(biāo)注的規(guī)范化、統(tǒng)一化，提高標(biāo)注效率，為數(shù)據(jù)挖掘、深度學(xué)習(xí)等科學(xué)研究提供病理圖像標(biāo)注數(shù)據(jù)庫。

根據(jù)本發(fā)明提供的一種數(shù)字病理圖像標(biāo)注的方法，包括：

標(biāo)注步驟：采用基于病理術(shù)語庫的標(biāo)準(zhǔn)圖形標(biāo)注工具，對待標(biāo)注的數(shù)字病理圖像進行標(biāo)注；

標(biāo)注信息管理步驟：基于XML格式對已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像上的的病理標(biāo)注信息進行格式化的管理；

決策融合步驟：將已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像分配給至少三人審核，將審核通過后的已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像存儲至標(biāo)注數(shù)據(jù)庫，并將標(biāo)注數(shù)據(jù)庫內(nèi)的數(shù)據(jù)傳輸至機器學(xué)習(xí)樣本庫進行機器學(xué)習(xí)。

優(yōu)選的，標(biāo)注步驟中所述病理術(shù)語庫采用XML格式進行表示和存儲若干詞條子集。

優(yōu)選的，標(biāo)注信息管理步驟中所述病理標(biāo)注信息包含坐標(biāo)信息、鏈接信息、分類和統(tǒng)計信息，以XML文本存儲和表示。

優(yōu)選的，所述標(biāo)注信息管理步驟還包括：

將已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像按照標(biāo)注區(qū)域，以圖像塊附加標(biāo)注信息的方式導(dǎo)出到標(biāo)注數(shù)據(jù)庫存儲，并進行分類。

優(yōu)選的，標(biāo)注信息管理步驟還包括：

將數(shù)字病理圖像上的病理標(biāo)注信息根據(jù)一定規(guī)則劃分為不同的層。

根據(jù)本發(fā)明提供的一種數(shù)字病理圖像標(biāo)注的系統(tǒng)，包括：

標(biāo)注模塊：采用基于病理術(shù)語庫的標(biāo)準(zhǔn)圖形標(biāo)注工具，對待標(biāo)注的數(shù)字病理圖像進行標(biāo)注；

標(biāo)注信息管理模塊：基于XML格式對已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像上的的病理標(biāo)注信息進行格式化的管理；

決策融合模塊：將已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像分配給至少三人審核，將審核通過后的已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像存儲至標(biāo)注數(shù)據(jù)庫，并將標(biāo)注數(shù)據(jù)庫內(nèi)的數(shù)據(jù)傳輸至機器學(xué)習(xí)樣本庫進行機器學(xué)習(xí)。

優(yōu)選的，標(biāo)注模塊中所述病理術(shù)語庫采用XML格式進行表示和存儲若干詞條子集。

優(yōu)選的，標(biāo)注信息管理模塊中所述病理標(biāo)注信息包含坐標(biāo)信息、鏈接信息、分類和統(tǒng)計信息，以XML文本存儲和表示。

優(yōu)選的，所述標(biāo)注信息管理模塊還包括：

將已標(biāo)注的數(shù)字病理圖像按照標(biāo)注區(qū)域，以圖像塊附加標(biāo)注信息的方式導(dǎo)出到標(biāo)注數(shù)據(jù)庫存儲，并進行分類。

優(yōu)選的，所述標(biāo)注信息管理模塊還包括：

將數(shù)字病理圖像上的病理標(biāo)注信息根據(jù)一定規(guī)則劃分為不同的層。

與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明具有如下的有益效果：