[發(fā)明專利]從稻種中快速檢測水稻惡苗病病菌的LAMP法及試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710316754.1 | 申請日: | 2017-05-08 |
| 公開(公告)號: | CN107022624B | 公開(公告)日: | 2021-06-11 |
| 發(fā)明(設計)人: | 張傳清;張書亞;李玲;祝倩菲;朱國念 | 申請(專利權)人: | 浙江農林大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州中成專利事務所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 311300 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 稻種 快速 檢測 水稻 惡苗病 病菌 lamp 試劑盒 | ||
1.用于檢測水稻惡苗病病菌的環(huán)介導等溫擴增方法,利用了用于水稻惡苗病病菌快速檢測方法的LAMP特異性引物組合物,其特征在于:
所述LAMP特異性引物組合物由上下游外引物、上下游內引物這四條引物組成;
上游外引物(F3):5’—CGGCCCTTATACCCCATTC—3’;
下游外引物(B3):5’—GCGCCACTATTGCTGTCT—3’;
上游內引物(FIP):5’—ACTTGCGCTGGAAAGACCAGAACATCCGCCACCTCACTGA—3’;
下游內引物(BIP):5’—GGTCACCAATCCTCGGCTACAGCCCTAGGAGATGGTCGCTTA—3’;
LAMP反應體系為25μL,為:8U/μL Bst DNA聚合酶0.5μL、10×ThermoPol Buffer 2.5μL、20μM FIP 2.0μL、20μM BIP 2.0μL、10μM F3 0.5μL、10μM B3 0.5μL、25mM MgCl2 4.0μL、10mM dNTPs 2.5μL、5M甜菜堿3.0μL、3.75mM羥基萘酚藍1μL、水稻惡苗病病菌DNA模板1μL,雙蒸水補足至25μL;
擴增條件為63℃條件下溫育60min,80℃反應10min。
2.根據(jù)權利要求1所述的環(huán)介導等溫擴增方法,其特征在于:
利用所述25μL檢測反應體系進行LAMP擴增反應,選擇以下任一方法:
方法一、先在擴增前加入染料羥基萘酚藍作為反應指示劑,以HNB的顏色變化做為結果判定標準,然后進行LAMP擴增反應;反應結束后,顏色發(fā)生變化,即顯色結果觀察到天藍色判斷為陽性,即判定為待測水稻含水稻惡苗病病菌;顏色沒有發(fā)生變化,顯色結果仍為藍紫色判斷為陰性,即判定為待測水稻無水稻惡苗病病菌、或待測水稻所含水稻惡苗病病菌含量未達檢測的最低檢測濃度0.01ng/μL;
方法二、取5~10μL擴增產物,用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,如果出現(xiàn)梯形條帶判斷為陽性,即判定為待測水稻含水稻惡苗病病菌;如果無擴增條帶則判斷為陰性,即判定為待測水稻無水稻惡苗病病菌,或待測水稻所含水稻惡苗病病菌未達最低檢測濃度10fg/μL。
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