[發明專利]梨果皮全紅芽變性狀位點的分子標記及其引物和應用

在審

• 申請號: 201710294106.0
• 申請日: 2017-04-28
• 公開（公告）號: CN106929594A
• 公開（公告）日: 2017-07-07
• 發明（設計）人: 薛華柏;李秀根;楊健;王龍;王蘇珂;蘇艷麗;張慧蓉;曹玉芬
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院鄭州果樹研究所;中國農業科學院果樹研究所
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 鄭州大通專利商標代理有限公司41111
• 代理人: 陳大通

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及梨遺傳育種技術領域，具體涉及梨果皮全紅芽變性狀位點的分子標記及其引物和應用。

技術背景

梨是國際性的大宗水果，也是我國的主要水果之一，其果實營養豐富，味美多汁，香甜可口，深受人民的喜愛。果皮顏色是最能吸引人們注意的果實性狀之一，是果實品質和商品性的重要組成部分。近年來，健康消費的觀念日益深入人心，紅色梨被認為具有更高的健康價值而受到市場的青睞，紅色梨品種的選育也日益受到各國梨育種研究機構的重視。在我國，紅皮梨種植面積較小，現有紅皮梨資源多為幼果期不著色、在果實發育中后期著色，著色狀況受環境條件影響較大的陽面紅暈類型；而西洋梨品種‘巴梨’的全紅型芽變品種‘紅巴梨’以及我國‘早酥’梨的全紅型芽變品種‘紅早酥’的果實在幼果期即全面著紅色，且能一直保持，受環境條件影響較小，利用這些全紅型芽變品種做親本，可望選育出在我國北方和南方均能著色良好的紅皮梨新品種。

目前，在梨育種工作中主要采用的是傳統的雜交育種手段，雜交種子培育成苗，并度過數年的童齡期結果之后，再對所有雜種單株生長結果性狀進行后期評價，根據評價結果決定留下和淘汰的雜種單株。該方法的育種周期長、占地面積大、耗時耗力，育種效率低。近年來，分子生物學迅速發展并與作物遺傳育種相結合，產生了分子標記輔助選擇育種技術，使得對傳統雜交育種獲得的雜交單株進行提早選擇和高效選擇成為可能。梨全紅型芽變品種的紅皮性狀分子標記用于分子標記輔助選擇育種，則可以大大提高以該類型品種為親本的紅皮梨育種選擇效率，節約雜交單株種植養護和調查考種的成本，促進我國梨育種由常規育種向分子育種手段轉變。

發明內容

為了實現上述目的，本發明提供了一種梨果皮全紅芽變性狀位點及與該位點緊密連鎖的分子標記，設計了其引物，并在以該類型品種為親本的紅皮梨育種選擇中進行了應用，為紅皮梨的鑒定提供了新方法，提高了紅皮梨育種的準確性和選擇效率。

本發明是通過以下技術方法實現的

一種梨果皮全紅型芽變性狀位點的InDel分子標記，該InDel分子標記為In1579-1，所述的分子標記In1579-1的InDel位點位于梨基因組登錄號為NW_008988579.1的組裝scaffold上的23081bp處，插入缺失序列為ATTATTTTTTTA或ATTATTTTTTTATTTTTTTA(插入缺失的兩個序列可能只出現一個也可能兩個同時出現)。

上述梨果皮全紅型芽變性狀位點的InDel分子標記，所述分子標記In1579-1的擴增產物序列為：CATGTTACAGGTCCAACCTTCTTTCCTTTTATTATTTTTTTAAATGTTTTTGGATTCTGGATTTCAGATTGCAATAGG(78)以及CATGTTACAGGTCCAACCTTCTTTCCTTTTATTATT TTTTTATTTTTTTAAATGTTTTTGGATTCTGGATTTCAGATTGCAATAGG(86)中的一個或兩個。雜種后代在In1579-1標記位點的標記基因型為78/86(擴增出78bp和86bp兩條帶)即為紅皮后代，標記基因型為78/78(只擴增出一條78bp的條帶)即為綠皮后代。

一種上述梨果皮全紅型芽變性狀位點的InDel分子標記的引物，所述InDel分子標記In1579-1的引物序列為：

上游引物序列為(SEQ ID NO.11)：5'-CATGTTACAGGTCCAACCTT-3'，

下游引物序列為(SEQ ID NO 12)：5'-CCTATTGCAATCTGAAATCC-3'。

一種梨果皮全紅型芽變性狀位點的InDel分子標記，該InDel分子標記為In1400-1，所述的分子標記In1400-1的InDel位點位于梨基因組登錄號為NW_008988400.1的scaffold上的161533bp處，插入缺失序列為G或GTTA(插入缺失的兩個序列可能只出現一個也可能兩個同時出現)。