[發(fā)明專利]一種與母豬產(chǎn)仔性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記及其檢測方法和應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710199992.9 | 申請日: | 2017-03-30 |
| 公開(公告)號: | CN106995843A | 公開(公告)日: | 2017-08-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 李平華;黃瑞華;張倩;李衛(wèi)東 | 申請(專利權(quán))人: | 江蘇康樂農(nóng)牧有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 212300 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 母豬 產(chǎn)仔 性狀 相關(guān) snp 標(biāo)記 及其 檢測 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種與母豬產(chǎn)仔性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記,其特征在于,所述SNP標(biāo)記的位點(diǎn)為國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上g. 95537674
核苷酸位點(diǎn),且存在G/T多態(tài)性,所述SNP標(biāo)記與母豬窩產(chǎn)活仔數(shù)極顯著相關(guān)。
2.一種基于權(quán)利要求1所述的SNP開發(fā)分子標(biāo)記的方法,其特征在于以含有權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記的核苷酸序列為基礎(chǔ)序列,設(shè)計引物對,以母豬基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,使權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記轉(zhuǎn)化為分子標(biāo)記。
3. 根據(jù)權(quán)利要求21所述的方法,其特征在于所述的引物對序列為上游引物:SEQ ID NO:2,下游引物:SEQ ID NO:3;所述的分子標(biāo)記序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位點(diǎn)位于第255位,存在G/T多態(tài)性。
4.按照權(quán)利要求2或3的方法得到的分子標(biāo)記。
5. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的分子標(biāo)記,其特征在于分子標(biāo)記序列如SEQ ID NO:1所示,所述的SNP位點(diǎn)位于第255位,存在G/T多態(tài)性。
6. 一種用于檢測權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記的引物對,其特征在于上游引物為:SEQ ID NO:2,下游引物為:SEQ ID NO:3。
7.一種檢測權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記的方法,其特征在于包含PCR擴(kuò)增母豬基因組中含有權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記的一段序列,對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序,判讀該位點(diǎn)的G/T多態(tài)。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于包括以下步驟:
取一頭母豬的耳組織樣品并提取總DNA;
用已提取的母豬基因組DNA為模板,使用權(quán)利要求5所述的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;
擴(kuò)增產(chǎn)物測序,分析測序結(jié)果,判讀在SEQ ID NO:1第255位的G/T多態(tài)性。
9.權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記、權(quán)利要求4或5所述的分子標(biāo)記、權(quán)利要求6所述的引物在篩選高產(chǎn)母豬品系中的應(yīng)用。
10. 一種篩選高產(chǎn)母豬品系的方法,其特征在于包括檢測母豬g. 95537674核苷酸位點(diǎn)的基因型,選育g. 95537674核苷酸位點(diǎn)的TT型個體作為種豬。
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