[發(fā)明專利]一種針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法

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• 申請?zhí)枺?/td>: 201710140287.1
• 申請日: 2017-03-10
• 公開（公告）號: CN108570492A
• 公開（公告）日: 2018-09-25
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 劉雷;侯文洪;魏衛(wèi)衛(wèi);徐峰
• 申請（專利權(quán)）人: 上海美迪維康生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6851
• 分類號: C12Q1/6851;C12Q1/6886
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及一種針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法。本發(fā)明中首先以標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)療樣本采集流程收集冰凍的新鮮癌癥組織樣本，對選取目的基因共21個基因進(jìn)行實時熒光定量PCR技術(shù)檢測基因的表達(dá)量數(shù)值，根據(jù)這些數(shù)值以不同種類基因編好的運算公式進(jìn)行風(fēng)險值的計算，并進(jìn)行評估。本發(fā)明能夠提供一種更為精確的針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物領(lǐng)域，特別涉及一種針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法。

背景技術(shù)

乳腺癌是一種常見的女性惡性腫瘤，嚴(yán)重威脅女性身心健康。統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明，乳腺癌每年造成45.8萬人死亡，其發(fā)病率在世界范圍內(nèi)呈上升趨勢。近年來中國的乳腺癌發(fā)病率在迅速上升，并有年輕化的趨勢。乳腺癌成為了中國女性最常見的癌癥，中國每年乳腺癌新發(fā)數(shù)量和死亡數(shù)量分別占全世界的12.2％和9.6％。據(jù)統(tǒng)計，美國乳腺癌五年生存率是89％，中國乳腺癌患者五年生存率是73.1％。隨著人們對腫瘤早診意識的覺醒，尤其是在40歲以上的女性人群中大力推廣乳腺癌篩查，大量的I，II期乳腺癌能夠在腫塊小于5cm，腋下淋巴結(jié)為陰性被檢出。這類病人的預(yù)后較好，經(jīng)術(shù)前輔助治療，手術(shù)切除或放化療之后，5年生存率得到大幅提升。

乳腺癌的治療主要通過手術(shù)和化療或者放療。常規(guī)的治療是手術(shù)盡量切除腫瘤病灶。但是，并不是所有的乳腺癌患者都需要接受化療，化療對于某些乳腺癌患者效益并不明顯。研究表明，有將近一半的病人承受了額外的化療之苦。

目前臨床上仍是以腫瘤病人的臨床病理特征來作為主要標(biāo)準(zhǔn)區(qū)分不同預(yù)后的患者，例如腫瘤越大，數(shù)目越多，則認(rèn)為病人越需要化療，已經(jīng)出現(xiàn)腋下淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的病人比沒有轉(zhuǎn)移的病人更需要化療，相應(yīng)的有在線平臺Adjuvant。然而，這種分類方法相對比較粗放，臨床實踐過程中也發(fā)現(xiàn)該種分類準(zhǔn)確性有限，有相當(dāng)一部分被認(rèn)為是低復(fù)發(fā)風(fēng)險的患者后期也出現(xiàn)了復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移。在這種情況下，急需一種更精確的針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法。

發(fā)明內(nèi)容

鑒于以上問題，本發(fā)明提供了一種精確的針對亞洲乳腺癌21基因檢測方法。

為了實現(xiàn)上述發(fā)明目的，本發(fā)明提供以下技術(shù)方案，本發(fā)明中的乳腺癌21基因檢測方法，包括如下步驟：

S1：樣本采集

以標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)療樣本采集流程收集冰凍的新鮮癌癥組織樣本；

S2：實時熒光定量PCR技術(shù)檢測基因的表達(dá)量數(shù)值

選取目的基因共21個基因，包括16個腫瘤相關(guān)基因和5個參考基因，其中腫瘤相關(guān)基因包括：HER2相關(guān)基因有GRB7、ERBB2，雌激素相關(guān)基因有ESR1、PGR、BCL2、SCUBE2，增殖相關(guān)基因有BIRC5、MKI67、CCNB1、MYBL2、AURKA，侵襲相關(guān)基因有MMP11、CTSL2，還包括GSTM1、CD68、BAG1，對所選目的基因按照操作手冊依次進(jìn)行cDNA合成和實時熒光定量PCR，獲得21基因表達(dá)量數(shù)值；

S3：風(fēng)險值的計算

首先對基因表達(dá)值標(biāo)準(zhǔn)化處理，使基因表達(dá)值在0到15之間，其計算公式為：

gene_x＝(x_i-Min_gene)*15/(Max_gene-Min_gene)

gene_x表示標(biāo)準(zhǔn)化后到值，x_i表示實驗測出來的表達(dá)值，Min_gene是此基因在已有患者中的最小表達(dá)值，Max_gene是此基因在已有患者中的最大表達(dá)值。

根據(jù)上述步驟計算復(fù)發(fā)風(fēng)險值，計算各組別算法如下：

HER2分組值＝0.9*GRB7+0.1*HER2；如果結(jié)果小于8，把分值設(shè)為8。