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[發明專利]一種ampC基因的實時熒光定量PCR快速檢測系統在審

專利信息
申請號: 201710118279.7 申請日: 2017-03-01
公開(公告)號: CN107012206A 公開(公告)日: 2017-08-04
發明(設計)人: 李盛;劉贊贊 申請(專利權)人: 濟寧神康生物科技有限公司
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 濟南舜源專利事務所有限公司37205 代理人: 許靜
地址: 272023 山*** 國省代碼: 山東;37
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 ampc 基因 實時 熒光 定量 pcr 快速 檢測 系統
【說明書】:

技術領域

發明涉及一種ampC基因的實時PCR快速檢測系統,屬于實時PCR應用技術領域。

背景技術

耐藥菌的危害已遍及全球,耐藥性問題成為世界性的新的研究熱點。自從第一個抗生素——青霉素發現以來,人類研制、開發了多種抗菌藥物,成功地控制和治療了由細菌引起的感染性疾病。然而,隨著抗生素的不斷應用,細菌的耐藥性問題越來越突出,越來越嚴重。2000年6月12日路透社報道世界衛生組織的觀點:假若人們繼續濫用抗生素,對一切藥物產生抵抗的“超級細菌”將把人類帶回到舊時代,一些小小的感染也會使人喪命。耐藥菌產生之快、傳播之迅速、耐藥率之高引起世界性廣泛關注。耐藥菌的危害十分嚴重,它不僅使藥物療效減弱,藥物劑量極大,療程延長,復發率升高,治療費用增加,有時還引起并發癥,某些情況下甚至會使抗生素失去療效導致病人死亡率升高。細菌耐藥性的出現和耐藥細菌的感染常使經驗型治療難以奏效,給臨床抗感染治療帶來極大的挑戰。因此,及時準確地檢測細菌的耐藥性,對細菌耐藥性的變遷和某些重點的耐藥細菌進行長期的監測和分析,可為臨床抗感染治療方案的擬定提供有益幫助。

在臨床病原菌的各種耐藥問題中,以青霉素和頭孢菌素為代表的β-內酰胺類抗生素的耐藥問題尤其突出,給臨床治療感染性疾病帶來極大困難。β- 內酰胺類抗生素是現有的抗生素中使用最廣泛的一類,它系指化學結構中具有β-內酰胺環的一大類抗生素,主要包括青霉素類、頭孢菌素類、頭霉素類、碳青霉烯類、單環β-內酰胺類。β-內酰胺類抗生素通過抑制細菌胞壁的粘肽合成酶,阻礙細胞壁的合成而起到殺菌作用。針對β-內酰胺類抗生素,細菌在進化與繁殖過程中也產生了一套防衛機制,其中最重要的方式是產生β- 內酰胺酶。β-內酰胺酶可以水解β-內酰胺環中的酰胺鍵,使之轉化成為無活性的衍生物而失去殺菌作用,這是革蘭陰性桿菌耐β-內酰胺類抗生素的主要機制。

β-內酰胺酶種類繁多、特性各異,目前已發現的β-內酰胺酶超過300 種,其中頭孢菌素酶(AmpC酶)是臨床較為常見的β-內酰胺酶,具有重要的檢測意義。質粒AmpC酶高水平持續表達,且可通過轉化、接合等方式轉移給其它菌種,造成耐藥性的廣泛傳播。目前,在大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌、產酸克雷伯菌、奇異變形桿菌、沙門氏菌屬中都已發現質粒介導的AmpC酶。質粒AmpC酶危害嚴重,這是因為一種質粒可同時攜帶多個耐藥基因,使得產 AmpC酶的菌株表現出多重耐藥性,而且耐藥譜呈現擴大趨勢。另一方面,質粒的可傳遞性,使耐藥問題越來越嚴峻,容易引起醫院感染的暴發流行。

要減緩和控制耐藥菌株的產生,建立一種可靠的檢測方法是關鍵,而如何快速、準確的檢測質粒介導的AmpC酶是目前臨床實驗室面臨的一個普遍難題。目前用于實驗研究和臨床檢測的常見方法主要有以下幾種:頭孢西丁紙片法、頭孢西丁三維試驗、等點聚焦電泳/抑制試驗和基因檢測方法。前三種方法是利用耐藥表型篩選法或抑制劑篩選法對AmpC酶進行檢測,其缺點是耗時、特異性差、操作繁瑣、檢測結果易受環境因素影響,所以假陽性率高。基因檢測方法可以有效彌補表型檢測的缺點,目前使用比較多的是傳統PCR 方法和DNA芯片方法。傳統PCR方法根據質粒ampC基因的同源性設計群特異性引物,通過PCR對質粒ampC基因進行擴增。但該方法需要對PCR產物進行電泳分析,開管操作易產生氣溶膠污染,導致假陽性結果出現。DNA芯片方法通過PCR過程對擴增產物進行標記,若標記的產物與DNA芯片上的探針發生雜交,即可證明有耐藥基因的存在。DNA芯片技術雖然在檢測通量上有很大優勢,但卻需要PCR擴增、雜交、洗脫、檢測熒光等一系列操作步驟,而且成本高,難以在臨床實驗室推廣。由于上述種種原因,很多臨床實驗室很難準確及時的檢出質粒介導的AmpC酶。

發明內容

針對上述問題,本發明提供了一種ampC基因的實時熒光定量PCR快速檢測系統,具體涉及質粒ampC基因的檢測。本發明可以有效彌補現有檢測方法的不足。本發明提供了一種簡便、準確的檢測質粒ampC基因的快速檢測系統。本發明的技術方案如下:

一種ampC基因的實時熒光定量PCR快速檢測系統,其中,分子信標探針是一種含有“莖-環”結構,分子信標探針的核苷酸序列如SEQ NO.1所示;

本發明的特異性引物為:

上游引物F:5’-ATAGTATTGGAATACGTTATTA-3’;

下游引物F:5’-TATGCACTAGAATATGAGTC-3’。

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