[發明專利]一種快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒及方法

在審

• 申請號: 201710115928.8
• 申請日: 2017-03-01
• 公開（公告）號: CN108531561A
• 公開（公告）日: 2018-09-14
• 發明（設計）人: 石宏
• 申請（專利權）人: 云南序源生物技術開發有限公司
• 主分類號: C12Q1/6858
• 分類號: C12Q1/6858
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種快速檢測Y染色體SNP特征位點用于法醫學確定Y染色體單倍型譜系的試劑盒，其特征在于所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒包括用于擴增檢測Y染色體SNP特征位點所對應的引物和代表SNP位點兩種突變類型序列特征的探針。

2.根據權利要求1所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒，其特征在于所述的用于擴增檢測Y染色體SNP特征位點所對應的上下游引物以2個為一組進行復合擴增。

3.根據權利要求1所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒，其特征在于所述的Y染色體SNP特征位點都對應一對上、下游引物和兩條突變類型序列特征的探針。

4.根據權利要求3所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒，其特征在于所述的Y染色體SNP特征位點對應的上、下游引物以及探針的序列如下：rs2267802，上下游引物SEQ ID：No.1~2，探針SEQ ID：No.3~4；rs3212291，上下游引物SEQID：No.5~6，探針SEQ ID：No.7~8；rs9306841，上下游引物SEQ ID：No. 9 ~10，探針SEQ ID：No.11~12；rs35284970，上下游引物SEQ ID：No. 13 ~14，探針SEQ ID：No.15~16；rs2032597，上下游引物SEQ ID：No. 17 ~18，探針SEQ ID：No.19~20； rs9341278，上下游引物SEQ ID：No. ,21~22，探針SEQ ID：No.23~24； rs16981290，上下游引物SEQ ID：No. ,25~26，探針SEQ ID：No.27~28；rs72613040，上下游引物SEQ ID：No. 29~30，探針SEQ ID：No.31~32； rs13447443，上下游引物SEQ ID：No. 33~34，探針SEQ ID：No.35~36； rs78149062，上下游引物SEQ ID：No. 37~38，探針SEQ ID：No.39~40；rs3898，上下游引物SEQ ID：No. 41~42，探針SEQ ID：No.43~44。

5.根據權利要求1所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒，其特征在于所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒包括用于擴增檢測Y染色體SNP特征位點所對應的引物的濃度為10μM。

6.一種權利要求1~5任一所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒的使用方法，其特征在于包括以下步驟：

1）將PCR反應體系混合好之后，樣品加入96或384孔板放在PCR儀進行擴增反應；

2）完成擴增之后，將板子放入帶SDS掃描功能的定量PCR儀中讀取熒光信號；

3）儀器據熒光信號自動分析樣本的Y-SNP單倍型，以電子表格形式輸出結果。

7.根據權利要求6所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒的使用方法，其特征在于所述的PCR反應體系由如下組成：PCR上下游引物（0.125 μl +0.125 μl）+ 代表兩種單倍型的探針（0.1 μl + 0.1 μl）+ 2xTaqMan Fast qPCR MasterMix（2.5 μl） + DNA模版1-20ng（1 μl） + 去離子水（2.05 μl）= 6 μl。

8.根據權利要求6所述的快速檢測用于鑒定Y染色體單倍型譜系的SNP特征位點的試劑盒的使用方法，其特征在于擴增反應的條件為：擴增預變性：95℃、4min；擴增循環：95℃、7S，60℃、 40S， 72℃、1S循環40次。