[發(fā)明專利]實驗動物個體溯源方法及裝置

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710058772.4
• 申請日: 2017-01-23
• 公開（公告）號: CN106909631B
• 公開（公告）日: 2019-10-08
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 馬欽;范夢揚;張亞;張秦川;崔雪蓮
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號: G06F16/583
• 分類號: G06F16/583;G06T5/00;G06T7/11;C12Q1/68
• 代理公司: 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 王慶龍

1.一種實驗動物個體溯源方法，其特征在于，包括：

獲取采集的實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像；

對所述實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像進行DNA指紋信息提取；

根據(jù)提取的所述DNA指紋信息為所述實驗動物建立DNA指紋數(shù)據(jù)庫；

根據(jù)建立的所述DNA指紋數(shù)據(jù)庫對待測實驗動物進行個體DNA指紋溯源；

其中，所述根據(jù)提取的所述DNA指紋信息為所述實驗動物建立DNA指紋數(shù)據(jù)庫，包括：

根據(jù)提取的所述DNA指紋信息確定并存儲實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)和實驗動物DNA指紋判別數(shù)據(jù)；

所述根據(jù)提取的所述DNA指紋信息確定實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)和實驗動物DNA指紋判別數(shù)據(jù)，包括：

將所述實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)表中的字段設(shè)置為包括以下內(nèi)容：

實驗動物編號、實驗引物編號、實驗組號、泳道號、分子量1、分子量2、分子量3、分子量4、分子量5、分子量6、分子量7、分子量8、指紋分類號；

將所述實驗動物DNA指紋判別數(shù)據(jù)表中的字段設(shè)置為包括以下內(nèi)容：

實驗動物編號、實驗引物編號、實驗組號、泳道號、平均分子量1、判別數(shù)1、平均分子量2、判別數(shù)2、平均分子量3、判別數(shù)3、平均分子量4、判別數(shù)4、平均分子量5、判別數(shù)5、平均分子量6、判別數(shù)6、平均分子量7、判別數(shù)7、平均分子量8、判別數(shù)8、指紋分類號；

存儲實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)和實驗動物DNA指紋判別數(shù)據(jù)，包括：

將獲取的所述原始樣本DNA分子量按由大到小的順序排列，并將相關(guān)數(shù)據(jù)存入所述實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)表，且對于DNA分子量數(shù)據(jù)不足8個的，將不足的部分記為0；

根據(jù)提取的所述DNA指紋信息為所述實驗動物建立DNA指紋數(shù)據(jù)庫進一步還包括：

提取所述實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)表中實驗動物編號、實驗引物編號和實驗組號相同的記錄，并計算相同編號的分子量的平均值，以得到平均分子量1、平均分子量2、平均分子量3、平均分子量4、平均分子量5、平均分子量6、平均分子量7、平均分子量8；

提取所述實驗動物DNA指紋原始數(shù)據(jù)表中，實驗動物編號、實驗引物編號、實驗組號相同的記錄，并計算編號相同的分子量中的最大值與對應(yīng)的平均分子量之差，得到判別數(shù)；

根據(jù)建立的所述DNA指紋數(shù)據(jù)庫對待測實驗動物進行個體DNA指紋溯源的步驟具體包括：

將待測樣本的DNA分子量由大到小順序排序，分別與判別數(shù)據(jù)表中的平均分子量1-8求差，并得到絕對值1-8；

將所述絕對值1-8分別與判別數(shù)1-8進行對比，若絕對值1-8均不大于判別數(shù)1-8，則認為所述待測樣本DNA片段與標準樣一致，讀取標準樣對應(yīng)的實驗動物編號，并停止對比；

若絕對值1-8中至少一個大于判別數(shù)1-8，則認為待測樣本DNA片段與標準樣存在不一致，與下一組判別數(shù)進行比較，直至出現(xiàn)比對一致。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述對所述實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像進行DNA指紋信息提取，包括：

對所述實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像進行圖像預(yù)處理；

對經(jīng)過所述圖像預(yù)處理的實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片進行圖像分割；

對經(jīng)所述分割得到的實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像進行DNA指紋信息提取。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述對所述實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像進行圖像預(yù)處理，包括：

截取所述實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片圖像的有效處理區(qū)域；其中，所述有效處理區(qū)域中包含全部有效條帶和至少兩個位于同泳道的標準條帶Marker；

對所述有效處理區(qū)域的圖像進行小波降噪和圖像增強處理。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，所述對經(jīng)過所述圖像預(yù)處理的實驗動物的SDS-PAGE電泳膠片進行圖像分割，包括：

采用閾值分割法對所述有效處理區(qū)域進行分割，得到電泳條帶的粗二值化圖像；

對所述粗二值化圖像進行掃描，去除尺寸小于預(yù)設(shè)大小像素的圖斑，得到最終的電泳條帶二值化圖像。