[發明專利]用于癌癥中免疫治療的基因標簽

在審

• 申請號: 201680052646.1
• 申請日: 2016-07-21
• 公開（公告）號: CN108138236A
• 公開（公告）日: 2018-06-08
• 發明（設計）人: 提摩西·戴維森;祖德·奧唐奈;馬克斯·比勒舍;菲奧努阿拉·帕特森;史蒂夫·德哈羅;勞拉·A·希爾;凱瑟琳·E·基廷;維塔利·普勞茨基;丹尼斯·保羅·哈金;理查德·肯內迪;尼古拉斯·戈法爾;史蒂文·瓦爾克;勞拉·塔格特;艾琳·帕克斯
• 申請（專利權）人: 阿爾麥克診斷有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 鄭斌;彭鯤鵬

1.預測針對抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性的方法，其包括：

確定來自對象的樣品中選自表2B、2A或1的至少一種基因的表達水平，其中所確定的表達水平用于預測針對抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

2.權利要求1所述的方法，其中所述至少一種基因的表達水平提高預測具有針對抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

3.權利要求1或2所述的方法，其包括確定至少兩種所述基因的表達水平，并且所確定的表達水平用于生成組合測試評分，其中陽性組合測試評分(一般高于閾值，但是可等于或高于閾值)預測具有針對抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

4.前述權利要求中任一項所述的方法，其包括：

(i)推導捕獲所述表達水平的組合測試評分；

(ii)提供包含使所述組合測試評分與響應性相關聯之信息的閾值評分；

(iii)以及將所述組合測試評分與所述閾值評分進行比較；其中當所述組合測試評分超過所述閾值評分時，預測具有響應性。

5.預測針對與DNA損傷治療劑組合的抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性的方法，其包括：

確定來自對象的樣品中選自表2B、2A或1的至少一種基因的表達水平，其中所確定的表達水平用于預測針對與DNA損傷治療劑組合的抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

6.權利要求5所述的方法，其中所述至少一種基因的表達水平提高預測具有針對與DNA損傷治療劑組合的抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

7.權利要求5或6所述的方法，其包括確定至少兩種所述基因的表達水平，并且所確定的表達水平用于生成組合測試評分，其中陽性組合測試評分(一般高于閾值，但是可等于或高于閾值)預測具有針對與DNA損傷治療劑組合的抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑的響應性。

8.權利要求5至7中任一項所述的方法，其包括：

(i)推導捕獲所述表達水平的組合測試評分；

(ii)提供包含使所述組合測試評分與響應性相關聯之信息的閾值評分；

(iii)以及將所述組合測試評分與所述閾值評分進行比較；其中當所述組合測試評分超過所述閾值評分時，預測具有響應性。

9.鑒定可用抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑有效治療的癌癥的方法，其包括：

確定來自對象的樣品中選自表2B、2A或1的至少一種基因的表達水平，其中所確定的表達水平用于鑒定可用抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑有效治療的癌癥。

10.權利要求9所述的方法，其中所述至少一種基因的表達水平提高鑒定為可用抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑有效治療的癌癥。

11.權利要求9或10所述的方法，其包括確定至少兩種基因的表達水平，并且所確定的表達水平用于生成組合測試評分，其中陽性組合測試評分(一般高于閾值，但是可等于或高于閾值)鑒定為可用抑制性免疫檢查點的拮抗劑和/或刺激性免疫檢查點的激動劑有效治療的癌癥。

12.權利要求9至11中任一項所述的方法，其包括：

(i)推導捕獲所述表達水平的組合測試評分；

(ii)提供包含使所述組合測試評分與響應性相關聯之信息的閾值評分；

(iii)以及將所述組合測試評分與所述閾值評分進行比較；其中當所述組合測試評分超過所述閾值評分時，鑒定為可有效治療的癌癥。