[發明專利]用于檢測Htert基因的啟動子中的突變的方法,序列,組合物和試劑盒在審
| 申請號: | 201680038603.8 | 申請日: | 2016-05-02 |
| 公開(公告)號: | CN109790580A | 公開(公告)日: | 2019-05-21 |
| 發明(設計)人: | 安娜·保拉·蘇亞雷斯·迪亞斯·費雷拉;雨果·若奧·馬奎斯·普拉茲雷斯;卡塔里娜·米格爾·阿爾維斯·薩爾加多;魯伊·佩德羅·蒙泰羅·巴蒂斯塔;若奧·佩德羅·里科·德·奧利韋拉·比納格雷 | 申請(專利權)人: | 艾帕特瑪普(波爾圖大學分子病理學和免疫學研究所) |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 北京市萬慧達律師事務所 11111 | 代理人: | 王蕊;李軼 |
| 地址: | 葡萄牙*** | 國省代碼: | 葡萄牙;PT |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 突變 啟動子 試劑盒 探針 引物 檢測 膀胱癌 鱗狀上皮細胞癌 檢測生物樣品 反應組合物 分子生物學 人類遺傳學 神經膠質瘤 方法使用 肝細胞癌 基因分型 基因序列 甲狀腺癌 擴增引物 生物化學 早期檢測 黑素瘤 基細胞 靈敏性 種檢測 痕量 復發 鑒別 疾病 監測 醫學 預測 治療 表現 | ||
1.一組核苷酸序列,用于檢測基因hTERT的啟動子中的突變c.-124 C>T和/或c.-146 C>T,其特征在于其包含SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2和至少SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4和/或SEQ ID NO.5至SEQ ID NO.6。
2.一種用于PCR擴增和雜交的組合物,其用于檢測基因hTERT的啟動子中突變C.-124 C>T和/或c.-146 C>T,其特征在于除了用于PCR的試劑溶液之外,還包括權利要求1所述的核苷酸序列SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2和至少SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4和/或SEQ IDNO.5至SEQ ID NO.6。
3.根據前述權利要求的組合物,其特征在于SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.6中的至少一種以400nm-1600nM的最終濃度存在于這種組合物中。
4.根據前述權利要求的組合物,其特征在于SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.6核苷酸序列中的至少一種以800nm-1600nM的最終濃度存在于這種組合物中。
5.根據前述權利要求的組合物,其特征在于SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.5核苷酸序列以250nm-500nM最終濃度存在于這種組合物中,并且其特征在于SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.6核苷酸序列以800nm-1600nM的最終濃度存在于這種組合物中。
6.根據前述權利要求的組合物,其特征在于其包含以下濃度的SEQ ID NO.3至SEQ IDNO.6:
i)250nM-500nM的SEQ ID NO.3,400nm-1600nM的SEQ ID NO.4,250nM-500nM的SEQ IDNO.5和400nm-1600nM的SEQ ID NO.6,或者
ii)250nM-500nM的SEQ ID NO.3,800nm-1600nM的SEQ ID NO.4,250nM-500nM的SEQ IDNO.5和800nm-1600nM的SEQ ID NO.6。
7.一種用于檢測基因hTERT的啟動子中的突變c.-124 C>T和c.-146 C>T的組合物,其特征在于其除了獲自體外生物樣品的人類DNA之外,還包括至少一種如權利要求2-6中任一項所述的用于PCR擴增和雜交的組合物。
8.根據前述權利要求的組合物,其特征在于在所述組合物中,所包含的測試樣品的DNA的量的最終濃度小于500ng、小于100ng、小于50ng和大于1ng。
9.一種試劑盒,其用于檢測基因hTERT的啟動子中的突變c.-124 C>T和/或C.-146 C>T,其包含至少一種權利要求7-8中任一項所述的用于檢測突變的組合物。
10.根據前述權利要求的試劑盒,其特征在于其還包含至少一種DNA樣品,其含有基因hTERT的啟動子中的突變c.-124 C>T和/或c.-146 C>T。
11.一種用于檢測基因hTERT的啟動子中的突變c.-124 C>T和/或C.-146 C>T的體外方法,其特征在于包含以下步驟:
a)通過以下方式制備權利要求7-8中所述的用于檢測的組合物:促使從生物樣品提取的用于測試所述突變的DNA,與權利要求2-6中所述的用于PCR擴增和雜交的組合物進行接觸,
b)通過PCR反應來擴增和雜交檢測組合物的DNA樣品,
c)分析(b)中獲得的擴增曲線,和驗證熒光信號的指數擴增的存在,其對應于所分析的樣品中的基因hTERT啟動子的啟動子中c.-124 C>T突變和/或c.-146 C>T突變的存在呈陽性。
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