[發(fā)明專利]草莓屬植物的四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物及其利用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201680015403.0
• 申請(qǐng)日: 2016-03-18
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN107406887A
• 公開(kāi)（公告）日: 2017-11-28
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 小石原弘明;榎宏征;村松正善;西村哲;由比進(jìn);本城正憲
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 豐田自動(dòng)車株式會(huì)社
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;A01H1/02;C12N15/09
• 代理公司: 中國(guó)國(guó)際貿(mào)易促進(jìn)委員會(huì)專利商標(biāo)事務(wù)所11038
• 代理人: 鄭天松

【技術(shù)領(lǐng)域】

本發(fā)明涉及可挑選顯示四季產(chǎn)果性的草莓屬植物系統(tǒng)的四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物及其利用方法。

【背景技術(shù)】

隨著DNA標(biāo)志物(也稱為遺傳標(biāo)志物或基因標(biāo)志物)的開(kāi)發(fā)，在植物的品種改良中，能變得迅速地并且有效率地判別有用表型或不良表型的有無(wú)。DNA標(biāo)志物的開(kāi)發(fā)不僅是擬南芥或稻等的模型植物，在各種各樣的實(shí)用植物中也進(jìn)展，在品種改良中大大有用。

在草莓中，已知在秋的低溫/短晝形成花芽，翌春開(kāi)花－結(jié)果實(shí)的一季產(chǎn)果性品種，和由于長(zhǎng)晝/高溫也自然分化花芽，除了春之外經(jīng)夏至秋也結(jié)果實(shí)的四季產(chǎn)果性品種。作為后者，已知例如“夏莓”等的品種。四季產(chǎn)果性品種因?yàn)榭蓪?duì)應(yīng)于不能收獲一季產(chǎn)果性品種的時(shí)期的需要，要求更優(yōu)良的四季產(chǎn)果性品種的開(kāi)發(fā)。

在非專利文獻(xiàn)1及2中，使用使作為四季產(chǎn)果性品種的“Ever Berry”和作為一季產(chǎn)果性品種的“豐之香”交配而得到的F1后代而鑒定了關(guān)于與四季產(chǎn)果性相關(guān)的基因的RAPD標(biāo)志物。但是，在非專利文獻(xiàn)1及2中公開(kāi)的RAPD標(biāo)志物有與四季產(chǎn)果性基因的連鎖程度弱，挑選效率差，不便實(shí)用等的問(wèn)題。

另外，在專利文獻(xiàn)1中，公開(kāi)了坐落于草莓的四季產(chǎn)果性基因的近旁的DNA標(biāo)志物、用于擴(kuò)增該標(biāo)志物的引物、利用該標(biāo)志物的簡(jiǎn)便地判斷四季產(chǎn)果性和一季產(chǎn)果性的方法。在專利文獻(xiàn)1中公開(kāi)的DNA標(biāo)志物是ISSR標(biāo)志物，有簡(jiǎn)便性或判別精度差的問(wèn)題。例如，擴(kuò)增在專利文獻(xiàn)1中公開(kāi)的DNA標(biāo)志物，則每1個(gè)受試體出現(xiàn)多個(gè)條帶。但是，有目的條帶和其以外的條帶非常地接近而難以判讀的問(wèn)題，再者，由于對(duì)于四季產(chǎn)果性的表現(xiàn)型連鎖程度也不強(qiáng)，有挑選精度低的問(wèn)題。

再者，在非專利文獻(xiàn)3中，公開(kāi)了與四季產(chǎn)果性強(qiáng)連鎖的SSR標(biāo)志物。在非專利文獻(xiàn)3中公開(kāi)的SSR標(biāo)志物的解析需要高價(jià)的高精度電泳裝置，有無(wú)法通過(guò)簡(jiǎn)便的檢查利用的問(wèn)題。

【現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)】

【非專利文獻(xiàn)】

非專利文獻(xiàn)1：Sugimoto et al.(2005)Plant Breeding 124:498-501

非專利文獻(xiàn)2：山元等(2003)近畿中國(guó)四國(guó)農(nóng)業(yè)研究2：42-44

非專利文獻(xiàn)3：本城等(2011)育種學(xué)研究13(別2):265

【專利文獻(xiàn)】

專利文獻(xiàn)1：特開(kāi)2006-42622號(hào)公報(bào)

【發(fā)明內(nèi)容】

【發(fā)明要解決的技術(shù)課題】

然而，關(guān)于草莓屬植物中的四季產(chǎn)果性的DNA標(biāo)志物技術(shù)，說(shuō)不上LOD值或貢獻(xiàn)率高，無(wú)法評(píng)價(jià)為優(yōu)良的標(biāo)志物。

從而，本發(fā)明鑒于上述的實(shí)情，對(duì)于多倍數(shù)性且復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu)的草莓屬植物而開(kāi)發(fā)了多種DNA標(biāo)志物，旨在提供通過(guò)使用這些多種DNA標(biāo)志物可高精度判斷四季產(chǎn)果性的四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物及其利用方法。

【解決課題的技術(shù)方案】

本發(fā)明人為了解決上述課題而重復(fù)銳意探討的結(jié)果，準(zhǔn)備在草莓屬植物中的多數(shù)的標(biāo)志物，由雜交后代系統(tǒng)中的量的表型和標(biāo)志物的連鎖解析發(fā)現(xiàn)與四季產(chǎn)果性連鎖的標(biāo)志物，從而完成本發(fā)明。

本發(fā)明包含以下技術(shù)方案。

(1)草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物，其由草莓屬植物的染色體中的被夾在SEQ ID NO:1所示的堿基序列及SEQ ID NO:5所示的堿基序列之間的連續(xù)的核酸區(qū)域構(gòu)成。

(2)(1)所述的草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物，其特征在于，上述核酸區(qū)域含選自SEQ ID NO:1～5之任1個(gè)堿基序列或所述堿基序列的一部分。

(3)(1)所述的草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物，其特征在于，上述核酸區(qū)域位于在草莓屬植物的染色體中的被夾在SEQ ID NO:3所示的堿基序列和SEQ ID NO:4所示的堿基序列之間的區(qū)域。

(4)顯示四季產(chǎn)果性的草莓屬植物系統(tǒng)的制造方法，其包括：提取至少一方的親本是草莓屬植物的后代植物的染色體及/或所述親本的草莓屬植物的染色體的工序，及

判斷在上述中得到的染色體中的上述(1)至(3)之任一項(xiàng)所述的草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物的存在與否的工序。

(5)(4)所述的草莓屬植物系統(tǒng)的制造方法，其特征在于，在上述判斷工序中，由使用特異性地?cái)U(kuò)增上述草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物的引物的核酸擴(kuò)增反應(yīng)判斷所述草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物的存在與否。

(6)(4)所述的草莓屬植物系統(tǒng)的制造方法，其特征在于，在上述判斷工序中，使用具備對(duì)應(yīng)于上述草莓屬植物四季產(chǎn)果性關(guān)聯(lián)標(biāo)志物的探針的DNA芯片。