[發明專利]與大口黑鱸“優鱸1號”快速生長相關的SNP標記及其應用

有效

• 申請號: 201611155670.6
• 申請日: 2016-12-14
• 公開（公告）號: CN106701931B
• 公開（公告）日: 2020-09-18
• 發明（設計）人: 李勝杰;樊佳佳;姜鵬;王俊杰;胡婕
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院珠江水產研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 鄭瑩;胡輝

1.與大口黑鱸“優鱸1號”快速生長相關的SNP標記，所述SNP標記分別如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位堿基為C或A；所述SEQID NO.2自5’端起第327位堿基為A或G；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位堿基為A或G。

2.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，序列為SEQ ID NO.1的SNP標記的CC基因型個體的生長速度顯著高于AA基因型個體。

3.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，序列為SEQ ID NO.2的SNP標記的AA基因型個體的生長速度顯著高于GG基因型個體。

4.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，序列為SEQ ID NO.3的SNP標記的AA基因型個體的生長速度顯著高于GG基因型個體。

5.檢測權利要求1-4任一項所述的SNP標記的特異性引物在檢測大口黑鱸“優鱸1號”樣本生長性狀中的應用。

6.用于快速檢測權利要求1-4任一項所述的SNP標記的引物對，其特征在于，用于檢測SEQ ID NO.1所示SNP標記的引物對如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示；用于檢測SEQ IDNO.2所示SNP標記的引物對如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示；用于檢測SEQ ID NO.3所示SNP標記的引物對如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。

7.一種用于篩選快速生長大口黑鱸樣本的試劑盒，其包括權利要求6所述的引物對。

8.一種快速生長大口黑鱸樣本的篩選方法，其特征在于，對大口黑鱸樣本SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3SNP標記進行檢測，所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位堿基為C或A，所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位堿基為A或G，所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位堿基為A或G，選擇SEQ ID NO.1SNP標記為CC基因型和/或SEQ ID NO.2SNP標記為AA基因型和/或SEQ ID NO.3SNP標記為AA基因型的個體。

9.根據權利要求8所述的篩選方法，其特征在于，包括如下步驟：

(1)提取待檢樣品基因組DNA；

(2)以提取得到的DNA為模板，利用權利要求6所述的引物對進行PCR擴增，得到PCR產物；

(3)對PCR擴增產物進行測序，根據測序結果確定樣品的SNP標記的基因型來篩選快速生長樣本。