[發明專利]一種篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法及其專用試劑盒

有效

• 申請號: 201611107445.5
• 申請日: 2016-12-06
• 公開（公告）號: CN106755359B
• 公開（公告）日: 2019-12-31
• 發明（設計）人: 景蕊蓮;張斌;劉霞;徐偉娜;昌小平
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 11245 北京紀凱知識產權代理有限公司
• 代理人: 關暢;何葉喧

本發明公開了一種篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法及其專用試劑盒。本發明所提供的篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法，包括如下步驟：檢測待測小麥基于TaSPL21?6A基因的基因型為基因型HapI、基因型HapII還是基因型HapIII，基因型HapI的小麥的株高>基因型HapIII的小麥的株高>基因型HapII的小麥的株高。實驗證明，本發明所提供的方法通過檢測待測小麥基于TaSPL21?6A基因的基因型，可以篩選小麥株高性狀，在小麥分子育種具有重要的應用價值。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，尤其涉及一種篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法及其專用試劑盒。

背景技術

小麥是世界上主要的糧食作物之一，占全球糧食作物種植面積的17％，養活了世界40％的人口，為人類提供了20％的食物能量和蛋白質，全世界35-40％的人口以它為主要的食物來源。因此，小麥產量直接關系到世界的糧食安全。目前，在有限耕地面積的情況下，選育單產突出的小麥新品種是穩定和提高小麥產量最經濟有效的途徑。小麥產量受多種因素(如穗數、穗粒數和粒重)的影響，各個因素的協調是小麥高產的關鍵。株高是影響小麥產量的重要因素之一，其表現為：在一定范圍內，隨著株高的增加，小麥產量也相應增加；但超出一定范圍，隨著株高的增加，小麥產量反而下降，主要原因為葉面積系數已達到最佳值、易倒伏、收割困難等等。因此，挖掘控制小麥株高相關性狀的優良等位變異，并且開發相應等位變異的功能標記對高產小麥品種的分子標記輔助育種具有重要的意義。

單核甘酸多態性(Single nucleotide polymorphism，SNP)是指在基因組水平上由單個核苷酸變異所引起的DNA序列的多態性。隨著技術的發展，SNP檢測方法越來越多，檢測費用也越來越經濟，使它成為繼SSR之后的新一代分子標記。目前在小麥基因組研究過程中，SNP標記已被應用于小麥遺傳圖譜的構建、小麥重要農藝性狀相關基因的定位和基因組關聯分析等方面。

酶切擴增多態性序列標記(Cleaved amplified polymorphism sequence，CAPS)主要是對PCR擴增的DNA片段進行限制性酶切分析。根據基因序列設計特異引物，將特異PCR擴增與限制性酶切兩種方法相結合用來檢測核酸序列多態性的一種分子標記技術。它的基本原理是利用己知位點的DNA序列設計一對特異的PCR引物,然后用該引物特異擴增DNA片段,之后用特定的限制性內切酶酶切消化所得到的PCR擴增產物,最后通過凝膠電泳分離檢測酶切產物。

發明內容

本發明所要解決的技術問題是如何篩選或輔助篩選不同株高的小麥。

為解決上述技術問題，本發明首先提供了篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法。

本發明所提供的篩選或輔助篩選不同株高小麥的方法，具體可為方法一，可包括如下步驟：檢測待測小麥基于TaSPL21-6A基因的基因型為基因型HapI、基因型HapII還是基因型HapIII，基因型HapI的小麥的株高>基因型HapIII的小麥的株高>基因型HapII的小麥的株高；

所述基因型HapI的小麥為基于T125C SNP位點的基因型為TT純合型、基于T160CSNP位點的基因型為CC純合型且基于C169G SNP位點的基因型為CC純合型的小麥；所述基因型HapII的小麥為基于T125C SNP位點的基因型為CC純合型、基于T160C SNP位點的基因型為TT純合型且基于C169G SNP位點的基因型為GG純合型的小麥；所述基因型HapIII的小麥為基于T125C SNP位點的基因型為CC純合型、基于T160C SNP位點的基因型為TT純合型且基于C169G SNP位點的基因型為CC純合型的小麥；

所述“T125C SNP位點”為小麥基因組中序列表中的序列9自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160C SNP位點”為小麥基因組中序列表中的序列9自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169G SNP位點”為小麥基因組中序列表中的序列9自5′末端起第169位核苷酸。