[發明專利]一種平菇菌種鑒別的方法及專用DNA條形碼片段有效
| 申請號: | 201610554693.8 | 申請日: | 2016-07-14 |
| 公開(公告)號: | CN105950776B | 公開(公告)日: | 2018-02-06 |
| 發明(設計)人: | 趙鵬;紀森鵬;周軍輝;高興喜 | 申請(專利權)人: | 魯東大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司11245 | 代理人: | 關暢,白艷 |
| 地址: | 264025 山東*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 菌種 鑒別 方法 專用 dna 條形碼 片段 | ||
1.一種專用DNA條形碼在鑒別或輔助鑒別平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種中的應用。
所述專用DNA條形碼為序列3第21-375位核苷酸所示的DNA片段。
2.檢測平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種基因組中是否含有權利要求1中所述專用DNA條形碼的物質在鑒別平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種中的應用。
3.根據權利要求2所述的應用,其特征在于:所述物質為如下1)或2):
1)用于擴增所述專用DNA條形碼的引物對;
2)含有所述引物對的PCR試劑或試劑盒。
4.根據權利要求3所述的應用,其特征在于:所述引物對由引物1和引物2組成;所述引物1序列表中序列1所示的單鏈DNA分子;所述引物2為序列表中序列2所示的單鏈DNA分子;
所述PCR試劑中,所述引物1和所述引物2的摩爾比為1:1;所述引物1和所述引物2的濃度均為10 μmol/L。
5.一種鑒別或輔助鑒別平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種的方法,包括如下步驟:檢測待測樣品中是否含有權利要求1中所述專用DNA條形碼;如果含有,則待測樣品為或候選為平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種;如果不含有,則待測樣品不為或候選不為平菇(Pleurotus cornucopiae)菌種。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于:
所述檢測待測樣品中是否含有權利要求1中所述專用DNA條形碼的方法包括如下步驟:
1)用序列表中序列1所示的單鏈DNA分子和序列表中序列2所示的單鏈DNA分子組成的引物對對待測樣品進行PCR擴增,得到PCR擴增產物;
2)測序所述PCR擴增產物,將所述PCR擴增產物的序列與所述DNA片段進行比對,若同源性大于99%,則待測樣品中含有所述DNA片段,若同源性小于等于99%,則待測樣品中不含有所述DNA片段。
7.根據權利要求5或6所述的方法,其特征在于:
所述PCR擴增的模板為待測樣品的基因組DNA。
8.檢測平菇菌種基因組中是否含有權利要求1中所述專用DNA條形碼的物質,其為如下1)或2):
1)用于擴增所述專用DNA條形碼的引物對;
2)含有所述引物對的PCR試劑或試劑盒。
9.根據權利要求8所述的物質,其特征在于:
所述引物對由引物1和引物2組成;所述引物1序列表中序列1所示的單鏈DNA分子;所述引物2為序列表中序列2所示的單鏈DNA分子;
所述PCR試劑中,所述引物1和所述引物2的摩爾比為1:1;所述引物1和所述引物2的濃度均為10 μmol/L。
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