[發明專利]裸鼴鼠微衛星標記位點、引物及其應用

有效

• 申請號: 201610158113.3
• 申請日: 2016-03-18
• 公開（公告）號: CN105695455B
• 公開（公告）日: 2019-02-12
• 發明（設計）人: 崔淑芳;林麗芳;程繼帥;楊文靜;肖邦;叢薇;趙善民;余琛琳
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍第二軍醫大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6888
• 代理公司: 上海元一成知識產權代理事務所(普通合伙) 31268
• 代理人: 趙青

本發明屬于生物技術檢測領域，具體涉及裸鼴鼠微衛星標記位點、引物及其應用。本發明建立的裸鼴鼠微衛星位點達45個，可用于裸鼴鼠群落的遺傳多態性檢測，為裸鼴鼠的微衛星多態性檢測奠定堅實的基礎。

技術領域

本發明屬于生物技術檢測領域，具體涉及裸鼴鼠微衛星標記位點，該些微衛星標記位點引物，為裸鼴鼠封閉群遺傳多態性的鑒定奠定了基礎。

背景技術

作為一種新型實驗動物，近年來裸鼴鼠得到國際上的廣泛重視。已有報道表明，人工飼養野外捕獲的裸鼴鼠中，百分之八十的壽命超過24年，即使16歲的年齡段以后，其死亡率也沒有顯著的上升，而且沒發現有癌癥的發生。與大多數別的哺乳動物不同，1歲到24歲之間的裸鼴鼠骨密度沒有明顯的變化。且在5歲到20歲的年齡這段時間，裸鼴鼠的基本代謝，胃腸道吸收，身體組成成分并沒有隨年齡的增加而發生變化。裸鼴鼠的生理學特征表明裸鼴鼠具有顯著的抗衰老能力和抗腫瘤能力。目前對于裸鼴鼠的研究報道來自中國、美國、日本、英國、非洲等，各個地方的裸鼴鼠遺傳背景不同，勢必對研究結果造成影響。因此研究裸鼴鼠的遺傳背景，使其規范化使用迫在眉睫。但是目前對于裸鼴鼠的遺傳學報道較少。至今為止，裸鼴鼠的微衛星位點僅見12個位點的報道，遠遠不能滿足裸鼴鼠的遺傳多態性鑒定需要。

微衛星DNA是由2-6bp堿基組成的一個多次串聯重復序列，又稱為短序列重復(short tandemrepeat，STR)、簡單重復序列(Single sequencerepeats，SSR)，普遍存在于真核生物的基因組中，平均每10kb就出現一個STR位點。通過其可以對多態信息含量(PIC)、群體雜合度分析、遺傳距離分析等進行準確的測定，已廣泛應用于群體遺傳學分析、基因圖譜分析及親緣關系等研究。

目前微衛星位點檢測方法有瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳、毛細管電泳。其中毛細管電泳最為靈敏，且可實現高通量檢測，操作過程相對簡單，結果可靠，是判斷的最終標準。近年來本實驗室在建立裸鼴鼠封閉群并進行一系列生物學特性研究的基礎上，進一步篩選裸鼴鼠高度多態性微衛星位點，為裸鼴鼠的遺傳學檢測奠定基礎。

發明內容

為了解決上述檢測技術的不足，本發明篩選并建立了多個具多態性的裸鼴鼠微衛星標記位點，以及相應的微衛星引物，為鑒定裸鼴鼠封閉群遺傳多態性程度奠定了基礎。

本發明的目的通過以下技術方案來實現：

本發明的第一目的在于提供一種裸鼴鼠微衛星標記位點，使用多態性較高的SMMU2016001等45個位點構成種群檢測體系，所述微衛星標記位點在UCSC基因庫中對應的編號位置如下所示，

本發明的第二目的在于提供上述45個微衛星標記位點對應的引物對，核苷酸序列如下：

SMMU2016001F：5’-ATACCCTGGTTTCCTGAT-3’，SEQ ID NO：1；

SMMU2016001R：5’-GAATGGTTTTATTGCATAG-3’，SEQ ID NO：2；

SMMU2016002F：5’-TTACTGCTGGTGTTCTGA-3’，SEQ ID NO：3；

SMMU2016002R：5’-ACCGCTGACTTACATTCC-3’，SEQ ID NO：4；

SMMU2016003F：5’-GGGTAGCAGGGCCAAGTT-3’，SEQ ID NO：5；

SMMU2016003R：5’-GGTAAAGGTCCTCGCATC-3’，SEQ ID NO：6；

SMMU2016004F：5’-AACGACGCAAGTTCAATC-3’，SEQ ID NO：7；