[發明專利]SNP標記及其應用、檢測方法

有效

• 申請號: 201610096189.8
• 申請日: 2016-02-22
• 公開（公告）號: CN105525027B
• 公開（公告）日: 2019-01-08
• 發明（設計）人: 陳曉;石巍;陳超;劉之光;王慧華;郭海坤
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院蜜蜂研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 趙青朵

本發明涉及生物技術領域，特別涉及SNP標記及其應用、檢測方法。本發明采用全基因組測序對中國西域黑蜂大量個體進行全基因組測序，獲得了中國西域黑蜂中21個特有的SNP信息，成為鑒定中國西域黑蜂的標志SNP位點。本發明提供的中國西域黑蜂蜜蜂特有的SNP位點在中國西方蜜蜂與其它地區西方蜜蜂的分化及中國西方蜜蜂對本地環境的適應性進化具有重要作用。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，特別涉及SNP標記及其應用、檢測方法。

背景技術

我國蜜蜂飼養歷史悠久，蜜蜂種質資源豐富，但是長久以來，我國境內僅發現存在東方蜜蜂，并無西方蜜蜂。東方蜜蜂采集能力稍次于西方蜜蜂，伴隨著西方蜜蜂的引進，我國養蜂者越來越多的開始飼養西方蜜蜂，我國原生蜂種質資源受到威脅。如果能夠在我國境內找到原生的西方蜜蜂對我國蜜蜂種質資源有著重要意義。中國蜜蜂種質資源委員會主任石巍老師與新疆自治區蜂業管理站工作人員一直從事加強對新疆原有伊犁黑蜂保護的工作，經過多年的努力，首次在中國新疆伊犁境內發現歐洲黑蜂自然種群，并且與目前國際上已知的西方蜜蜂亞種至少存在9萬年的分化，證明中國也是西方蜜蜂的原產地，結束了我國沒有西方蜜蜂自然種群分布的歷史，這在畜禽資源研究方面具有很大的突破性意義。中國西域黑蜂個體較大、越冬性能好、抗逆性強、抗螨能力十分突出，而且蜂王產卵力強，能維持強群和蜂群極大的采集能力，既可作為推廣普及的新品種，也可以作為育種素材，作進一步的深入育種研究，具有很好的發展前景。

中國發現西方蜜蜂，在國內外產生了較大的影響，為了更加深入的保護中國西域黑蜂，有效的利用中國西域黑蜂為我國蜜蜂育種工作服務，在“蜂產業技術體系”“物種資源保護”等課題的資助下，我們對中國西域黑蜂的研究工作取得突破性進展，利用全基因組重測序技術鑒定了中國西域黑蜂特有的21個SNP位點。

全基因組測序，即對一種生物的基因組中的全部基因進行測序，測定其DNA的堿基序列。全基因組測序覆蓋面廣，能檢測個體基因組中的全部遺傳信息，準確性高。每個個體從受精卵開始就繼承了父母的DNA遺傳信息，并且攜帶一生，不易改變。全基因組測序就是通過運用新一代高通量DNA測序儀，進行10-20倍覆蓋率的個體全基因組測序，然后與該物種基因組精確圖譜比較，得到完整的個體全基因組序列，破譯個體全部的遺傳信息的過程。全基因組重測序的個體，通過序列比對，可以找到特定物種(品種)特有的大量的單核苷酸多態性(SNP)位點。

目前，研究人員通常采用線粒體DNA的SNP位點信息來鑒定蜂種信息。線粒體DNA的SNP位點檢測方法是首先提取個體基因組DNA，然后進行線粒體DNA的PCR擴增，進而測序，獲得線粒體DNA序列SNP信息。

目前存在的技術問題：

(1)SNP位點信息少；

(2)蜂種鑒別準確性低；

(3)具有片面性。

發明內容

有鑒于此，本發明提供了SNP標記及其應用、檢測方法。本發明采用全基因組測序對中國西域黑蜂大量個體進行全基因組測序，獲得了中國西域黑蜂中21個特有的SNP信息，成為鑒定中國西域黑蜂的標志SNP位點。

為了實現上述發明目的，本發明提供以下技術方案：

本發明提供了一種SNP標記，其特征在于如下所示：

本發明還提供了所述SNP標記在物種鑒定中的應用；所述物種為中國西域黑蜂。

本發明還提供了所述SNP標記在中國西域黑蜂分子標記輔助育種中的應用。

本發明還提供了所述SNP標記在物種資源遺傳多樣性中的應用。

本發明還提供了所述SNP標記在物種適應性進化中的應用。