[發明專利]一種乳腺腫瘤的建模與診斷方法在審
| 申請號: | 201610094313.7 | 申請日: | 2016-02-20 |
| 公開(公告)號: | CN105574356A | 公開(公告)日: | 2016-05-11 |
| 發明(設計)人: | 周棟 | 申請(專利權)人: | 周棟 |
| 主分類號: | G06F19/00 | 分類號: | G06F19/00 |
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| 地址: | 311800 浙江省紹*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 乳腺 腫瘤 建模 診斷 方法 | ||
【技術領域】
本發明涉及乳腺腫瘤診斷技術領域,特別是基于聚類分析與軟測量建模的 乳腺腫瘤診斷方法的技術領域。
【背景技術】
目前,乳腺腫瘤已經成為世界上婦女發病率最高的癌癥,研究表明,乳腺 惡性腫瘤若能早期發現、早期診斷、早期治療,可以取得良好的效果。現有的 研究與診斷方法,尤其是對乳腺圖像的分析日趨成熟。醫學研究表明,乳腺腫 瘤病灶組織的細胞核顯微圖像與正常組織的細胞核顯微圖像不同,但是用一般 的圖像處理技術很難對其進行區分。因此,運行科學的方法,根據乳腺腫瘤病 灶組織的細胞核顯微圖像來對乳腺腫瘤進行良性、惡性的診斷顯得十分重要。
本發明是獲取乳腺腫瘤病灶組織的細胞核顯微圖像數據庫的數據,將細胞 核圖像的量化特征作為輸入,來建立與腫瘤性質的關系,即是可以根據該細胞 核顯微圖像的量化特征來診斷乳腺腫瘤是良性還是惡性。
【發明內容】
本發明的目的就是解決現有技術中的問題,提出一種乳腺腫瘤的建模與診 斷方法,可以根據組織細胞核顯微圖像的量化特征來直觀的診斷腫瘤性質。
為實現上述目的,本發明提出了一種乳腺腫瘤的建模與診斷方法,所述方 法利用傳播仿射聚類方法(AP)來對數據庫的細胞核顯微圖像進行樣本分類, 再通過偏最小二乘算法(PLS)對聚類結果進行軟測量建模,最后利用開關連接 的方式得到多模型的輸出,即乳腺腫瘤的性質,具體步驟包括:
(a)數據預處理:確定樣本數量與樣本維數,劃分訓練樣本與測試樣本, 對所有樣本中的數據進行“3σ”篩選;
(b)聚類分析:利用AP算法自動對訓練樣本進行聚類分析,得到聚類中 心與每一類的樣本集;
(c)軟測量建模:通過PLS對聚類獲得的每一類樣本集進行軟測量建模, 分別獲得對應的輸出結果,即良性為“0”,惡性為“1”;
(d)多模型連接:利用測試樣本測試(c)步驟中建立的多模型,并計算 各測試樣本的隸屬度作為多模型開關連接的判斷依據。
作為優選,所述(a)步驟中,樣本維數為10,組織細胞核顯微圖像的量化 特征分別為細胞核半徑、質地、周長、面積、光滑性、緊密度、凹陷度、凹陷 點數、對稱度、斷裂度。
作為優選,所述(b)步驟中,傳播仿射聚類算法(AP)不需要初始化確定 聚類數與聚類中心,可以對訓練樣本實現自動分類。
作為優選,所述(d)步驟中,測試樣本測試多模型時,各個子模型的輸出 可能不同,在最后診斷腫瘤性質時,需計算測試樣本與聚類中心的隸屬度,隸 屬度最大所對應的輸出結果即是最終的診斷結果。
本發明的有益效果:本發明通過采集病灶組織細胞核顯微圖像的量化特征, 來建立與腫瘤性質之間的關系,建模方法直觀,而利用傳播仿射聚類算法(AP) 與偏最小二乘算法(PLS)來建模的多模型使得最終的診斷結果精度高,大大降 低了誤診率。
本發明的特征及優點將通過實施例進行詳細說明。
【具體實施方式】
本發明一種乳腺腫瘤的建模與診斷方法,具體步驟包括:
步驟一、確定樣本數量與樣本維數,劃分訓練樣本與測試樣本,對所有樣 本中的數據進行“3σ”篩選;
步驟二、利用AP算法自動對訓練樣本進行聚類分析,得到聚類中心與每一 類的樣本集;
步驟三、通過PLS對聚類獲得的每一類樣本集進行軟測量建模,分別獲得 對應的輸出結果,即良性為“0”,惡性為“1”;
步驟四、利用測試樣本測試(c)步驟中建立的多模型,并計算各測試樣本 的隸屬度作為多模型開關連接的判斷依據。
其中,步驟二的傳播仿射聚類算法(AP)避免了傳統聚類算法中需要事先 確定初始聚類數目和聚類中心的問題,且所得聚類中心必定是樣本中的點,防 止產生沒有實際意義的聚類中心。
仿射聚類算法的基本步驟為:
1、設置參考度P,計算相似度矩陣,令S(i,i)=p,i=1,2,…n,初始化阻尼系 數lam=median(S),證據矩陣R(i,k)=0,A(i,k)=0,(i=1,2,…,n;k=1,2,…,n)。
2、根據下列公式,更新證據矩陣R(i,k)及A(i,k):
R(i,k)=S(i,k)-max[A(i,j)+S(i,j)]j∈(1,2,…k-1,k+1,…,n)
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G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的,例如:基因型–表型關聯,不均衡連接,種群遺傳學,結合位置鑒定,變異發生,基因型或染色體組的注釋,蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用





