[發(fā)明專利]以CA19-9 cDNA片段為模板制備RNA探針的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610083165.9 | 申請日: | 2016-02-05 |
| 公開(公告)號: | CN105567845B | 公開(公告)日: | 2020-05-01 |
| 發(fā)明(設計)人: | 徐學明;魯隼;馮俊清 | 申請(專利權)人: | 廣州復能基因有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6811 | 分類號: | C12Q1/6811;C12Q1/6886;C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司: | 中科專利商標代理有限責任公司 11021 | 代理人: | 張瑩 |
| 地址: | 510663 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | ca19 cdna 片段 模板 制備 rna 探針 方法 | ||
1.一種以CA19-9 cDNA為模板一步反應制備RNA探針的方法,其特征在于,包括以下步驟:
A.針對CA19-9 mRNA序列篩選多個靶序列,對于每個靶序列設計至少一對引物,所述引物的PCR擴增產物為多重DNA片段,所述多重DNA片段能包括所有靶序列,每個引物末端添加RNA聚合酶結合序列;
B.從CA19-9 cDNA質粒中,采用步驟A的所述引物,通過PCR擴增得到所述多重DNA片段,純化后混合,作為模板;
C.加入RNA聚合酶和帶有生物素標記的UTP進行反應,將UTP摻入產物,純化后得到100-500nt理想長度的RNA探針,
所述步驟A中,所述篩選包括:篩選2-50個無內含子和重復序列的特定目標序列區(qū)域,根據(jù)需要可選擇同源區(qū)域序列,作為靶序列,
所述靶序列為2個,所述引物如下:
CA19-9-1F:TCACAGCCTCACTTCTAACCTTCT
CA19-9-1R:ccgGAATTCTAATACGACTCACTATAGACGGTTGCCATCCACTCTTTCAC
CA19-9-2F:GCTCCTGCTCACAGCCTCACTTC
CA19-9-2R:ccgGAATTCTAATACGACTCACTATAGTTTGACGGTTGCCATCCACTCTT。
2.根據(jù)權利要求1所述的以CA19-9 cDNA為模板制備RNA探針的方法,其特征在于,所述RNA聚合酶是T7 RNA聚合酶,引物的5′端加上T7啟動子序列。
3.根據(jù)權利要求1所述的以CA19-9 cDNA為模板制備RNA探針的方法,其特征在于,所述RNA聚合酶是SP6 RNA聚合酶,引物的5′端分別加上SP6啟動子序列。
4.根據(jù)權利要求1所述的以CA19-9 cDNA為模板制備RNA探針的方法,其特征在于,所述RNA聚合酶是T3 RNA聚合酶,引物的5′端分別加上T3啟動子序列。
5.根據(jù)權利要求1所述的以CA19-9 cDNA為模板制備RNA探針的方法,其特征在于,所述RNA聚合酶是Trc RNA聚合酶,引物的5′端分別加上Trc啟動子序列。
6.一種快速檢測胰腺癌相關的CA19-9表達的試劑盒,其特征在于:包括根據(jù)權利要求1所述的方法所制備的RNA探針。
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