[發明專利]has-miR-29b-3p的檢測在審
| 申請號: | 201610048023.9 | 申請日: | 2016-01-25 |
| 公開(公告)號: | CN105567826A | 公開(公告)日: | 2016-05-11 |
| 發明(設計)人: | 杜鴻;王敏;張海方;謝小芳;李愛青;周惠琴 | 申請(專利權)人: | 蘇州大學附屬第二醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 蘇州創元專利商標事務所有限公司 32103 | 代理人: | 范晴 |
| 地址: | 215004 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | has mir 29 檢測 | ||
技術領域
本發明涉及生物技術領域,具體涉及快速檢測指標技術領域,特別涉及一種檢測 microRNAhas-miR-29b-3p的試劑盒及其方法。
背景技術
血流感染是感染性疾病最嚴重的臨床表現形式之一,患者發生血流感染,會導致 住院時間的延長以及住院費用的增加,且病死率高。血流感染的診斷傳統通過血培養來鑒 定,但具有需要的血樣量多和出報告的時間長等缺點。
人體的巨噬細胞具有通過識別、吞噬并最終清除細菌的作用,在宿主抵御病原菌 感染的過程中發揮巨大作用。has-miR-29b-3p是巨噬細胞在受到細菌感染時會高表達的一 種microRNA,并且在血培養陽性患者血清中可檢測到其較對照組升高。
發明內容
本發明的目的是提供檢測has-miR-29b-3p的試劑盒,建立一種檢測has-miR-29b- 3p的方法。該方法有快速、準確、方法簡單、成本低的優點,有利用臨床使用和推廣。
為了解決現有技術中的這些問題,本發明提供的技術方案如下:
一種檢測has-miR-29b-3p的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括用于特異性擴 增has-miR-29b-3p的特異性引物對,所述引物為具有SEQIDNo:1的連續核苷酸序列和具 有SEQIDNo:2的連續核苷酸序列;
所述試劑盒中還包括RNA逆轉錄引物,其序列為SEQIDNo:3。
SEQIDNo:1:5’GGGTAGCACCATTTGAAA3’
SEQIDNo:2:5’TGCGTGTCGTGGAGTC3'
SEQIDNo:3如下所示:
5’GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACAACACTG3’
優選的技術方案是:所述試劑盒還包括與引物序列構成PCR反應體系的Pfu緩沖 液、dNTPs、MgSO4、PfuDNA聚合酶、模板DNA、熒光染料;所述PCR反應體系的終濃度組成為:
優選的技術方案是:所述熒光染料可選自DNA飽和性染料包括EvaGreen染料、PLUS染料、ResoLight染料、SYTO9染料、SYBRgreen染料;所述dNTP混合液包括10mMdATP、10mMdCTP、10mMdTTP、10mMdGTP的混合液。
本發明的第二方面是提供一種前述的試劑盒的使用方法,包括如下步驟:
(1)血清總RNA的提取:包括取血樣離心后,取上清,加入TRIzolLSReagent試劑 和冰醋酸,劇烈振蕩混勻進行勻漿;孵育后加入氯仿抽提,取水相加入異丙醇沉淀RNA,離心 沉淀RNA,去除上清液后加入乙醇清洗沉淀RNA,最后空氣干燥,加入無RNA酶的水溶解RNA備 用;
(2)逆轉錄:在SEQIDNo:3的反轉錄酶的作用下及RNA酶抑制劑存在的條件下反 應,反應條件16℃30min,42℃40min,85℃5min,最后在冰上待用或-20℃保存;
(3)熒光定量PCR(RT-PCR):使用SEQIDNo:1的引物和SEQIDNo:2的引物進行熒 光定量PCR反應,
(4)建立標準曲線,按絕對定量方法對結果進行分析。
在本發明中,術語“試劑盒”是指用于PCR反應的混合物,它包括反應所需的緩沖液 (buffer)、dNTP混合液、引物、熒光染料、MgCl2、PfuDNA聚合酶。
在本發明中,術語“引物”是指一種寡核苷酸,可以是天然的也可以是合成,它可以 作為在一定條件下誘發DNA合成的起始點,在上述條件下可以誘發合成與核酸鏈相互補的 引物擴增產物,即在四種不同的三磷酸脫氧核糖核酸及一種聚合試劑(即DNA聚合酶或逆轉 錄酶)存在下,在一種合適的緩沖液并在合適的溫度下進行上述合成。優選的引物是單股寡 脫氧核糖核苷酸。引物的合適長度取決于該引物的設計用途,但在一般在15~25個核苷酸 之間,較短的引物分子通常需要較低的溫度,從而與模板形成充分穩定的雜交復合物。引物 不必反應模板的準確序列,但必須充分互補,已與模板雜交并引發DNA合成。
本發明的采用實時熒光定量PCR檢測患者血清標本中has-miR-29b-3p表達水平, 從而快速篩查血流細菌感染患者。
本發明相對于現有技術具有如下的優點及效果:
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