[發明專利]對治療性化合物敏感性降低的乙型肝炎變異株、變異株的檢測及其用途

在審

• 申請號: 201610030881.0
• 申請日: 2009-04-03
• 公開（公告）號: CN105648110A
• 公開（公告）日: 2016-06-08
• 發明（設計）人: 陳繼明;陳立怡;黎青龍;袁孟峰
• 申請（專利權）人: 香港大學
• 主分類號: C12Q1/70
• 分類號: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 彭昶

1.HBV基因組中的寡核苷酸組在制備用于測定HBV的基因型的試劑盒中的用途，其中所述寡核苷酸組包括以下基因型的核苷酸：基因型A：T451和T586；基因型B：A321、T324和G408；基因型C：A491和G633；基因型D：T289、A290和T867；基因型E：C705、C706、T837、C840和C843；基因型F：A628、T837和A838；基因型G：T306、T936和G939；以及基因型H：T493、A494、A838、A840、G841和C842。

2.權利要求1的用途，所述試劑盒還用于測定從患者生物樣品中提取的HBV是否對LMV、ADV和/或對其它核苷/核苷酸類似物、干擾素或其它抗HBV藥劑或其組合的敏感性下降，并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBVDNA聚合酶中的以下的突變的核苷酸：rtL80I、rtL82M、rtF166L、rtQ215S和rtM204I/V/S+/-rtL180M。

3.權利要求1的用途，所述試劑盒還用于測定從患者生物樣品中提取的HBV是否對LMV、ADV和對其它核苷/核苷酸類似物、干擾素和/或其它抗HBV藥劑或其組合的敏感性下降，并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBV核心啟動子和/或前核心區中的選自以下的突變的核苷酸：A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A和G1899A。

4.權利要求1的用途，所述試劑盒還用于測定HBV對抗體的反應性例如疫苗逃逸、免疫球蛋白療法逃逸或抗HBV血清學檢測逃逸或其組合是否降低的試劑盒中的用途，并且其中所述寡核苷酸組還包括編碼HBV包膜蛋白中的選自以下的突變的核苷酸：sQ101、sL104、sC107、sS/T114、sT115、sT116、sC121、sK/R122、sT123、sC124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。

5.權利要求3的用途，其中所述寡核苷酸組包括編碼所述核心啟動子和/或前核心區中的突變的核苷酸，所述突變包括：A1752G/T、T1753C、T1754C、C1856T、C1862T、G1898A和G1899A。

6.權利要求4的用途，其中所述寡核苷酸組包括編碼HBV包膜蛋白中的突變的核苷酸，所述突變包括：sQ101、sL104、sC107、sS/T114、sT115、sT116、sC121、sK/R122、sT123、sC124、sI/T126、sQ129、sG130、sN/T131、sF/Y134、sP135、sS136、sC137、sC138、sC139、sT/S140、sK141、sP142、sN146、sC147、sT148、sP153、sS154、sS155、sA157、sF/L158、sA/G159、sW163、sS167和sA/D168。

7.權利要求1-6中任一項的用途，其中所述試劑盒同時檢測HBV變異株的多個突變和/或基因型，其中可用肉眼觀察結果。

8.權利要求7的用途，其中所述試劑盒包含：

a)寡核苷酸陣列，用于分析含有可變序列的靶序列；

b)具有足夠大小和間距的斑點的陣列，可供肉眼觀測各個斑點；和

c)含有生物素標記的核苷酸和酶的反應試劑。

9.權利要求8的用途，其中所述酶是反轉錄酶或DNA聚合酶。

10.權利要求8的用途，其中延伸的每個寡核苷酸可通過由鏈霉抗生物素堿性磷酸酶或辣根過氧化物酶催化的比色反應來檢測。

11.權利要求10的用途，其中在比色反應中的底物是BCIP/NBT或4-氯-1-萘酚。

12.一種用于檢測HBV變異株的突變和/或基因型的試劑盒，其中所述試劑盒包含具有用于檢測所述HBV變異株的突變和/或基因型的核苷酸序列的載玻片，其中所述核苷酸序列是權利要求1-6中任一項所使用的寡核苷酸組。