[發(fā)明專利]一種侯鉤藤的分子鑒定方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201610029165.0 | 申請日: | 2016-01-14 |
| 公開(公告)號(hào): | CN105506132B | 公開(公告)日: | 2019-10-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 朱爽;王業(yè)勝;曾常青;周林;李奇威 | 申請(專利權(quán))人: | 廣東藥科大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6895 | 分類號(hào): | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州粵高專利商標(biāo)代理有限公司 44102 | 代理人: | 林瑞云 |
| 地址: | 510006 廣東省*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 鉤藤 分子鑒定 待測樣品 堿基 分子生物學(xué)水平 安全用藥 比對分析 比對結(jié)果 位點(diǎn)信息 唯一性 種植物 總DNA 比對 擴(kuò)增 位點(diǎn) 引物 匹配 中藥 | ||
1.一種侯鉤藤的分子鑒定方法,其特征在于,包括如下步驟:
S1.以待測樣品的總DNA為模板,利用引物ITS5和ITS4擴(kuò)增得到待測植物的rDNA ITS序列;
S2.將上述rDNA ITS序列與侯鉤藤的ITS序列進(jìn)行比對分析,找出匹配后的12位、86位、105位、120位、450位、547位或569位的堿基中的至少2個(gè)堿基進(jìn)行比對,根據(jù)比對結(jié)果鑒定待測樣品是否為侯鉤藤;
其中,步驟S2中所述結(jié)果鑒定的標(biāo)準(zhǔn)是,當(dāng)待測樣品的ITS區(qū)序列出現(xiàn)以下條件:
a.120位為A并且547位為T;
b.12位為A并且569位沒有T的插入;
c.105位為C并且86位為T;
d.105位為C并且450位為C;
當(dāng)滿足a、b、c、d至少一個(gè)條件時(shí),判定待測樣品是侯鉤藤,當(dāng)待測樣品的ITS區(qū)序列不符合a、b、c、d中任何一個(gè)條件時(shí),判定待測樣品不是侯鉤藤;
其中,步驟S1中所述引物ITS5的序列如SEQ ID NO.2所示,引物ITS4的序列如SEQ IDNO.3所示,所述侯鉤藤的ITS序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述侯鉤藤的分子鑒定方法,其特征在于,步驟S1所述待測樣品為茜草科鉤藤屬植物。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述侯鉤藤的分子鑒定方法,其特征在于,步驟S1所述待測樣品為新鮮采集的茜草科鉤藤屬植物的葉片。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述侯鉤藤的分子鑒定方法,其特征在于,步驟S1所述待測樣品為新鮮采集的并經(jīng)硅膠快速干燥后密封保存的茜草科鉤藤屬植物的葉片。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述侯鉤藤的分子鑒定方法,其特征在于,步驟S1的具體方法是:以待測樣品的總DNA為模板,利用引物ITS5和ITS4進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物純化后連接到載體pMD18-T,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到E.coli JM109感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行氨芐青霉素選擇,對陽性菌落進(jìn)行測序,測序引物同為ITS5和ITS4,得到rDNA ITS 序列。
6.權(quán)利要求1-5任一項(xiàng)所述侯鉤藤的分子鑒定方法在鑒定鉤藤屬植物侯鉤藤方面的應(yīng)用。
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