[發明專利]基于證據的轉換算法特別用于評估生物標志物的用途

在審

• 申請號: 201580049562.8
• 申請日: 2015-07-17
• 公開（公告）號: CN107076735A
• 公開（公告）日: 2017-08-18
• 發明（設計）人: D·蘭迪斯
• 申請（專利權）人: 杰諾瓦診斷公司
• 主分類號: G01N33/50
• 分類號: G01N33/50;G06F19/24
• 代理公司: 隆天知識產權代理有限公司72003
• 代理人: 王芝艷,吳小瑛

相關申請的交叉引用

本申請要求于2014年7月18日提交的美國臨時申請號62/026,241的優先權，該申請的內容通過引用整體并入本文。

發明領域

本發明涉及評估受試者(例如，人類患者)可能由于內部驅動或外部施加的事件(例如，不足的飲食、暴露于毒素、識別的疾病狀態、其他醫學病況或其他類型的干擾)而具有的各種生理需求的方法。所述方法的方面是計算機輔助的，并且可以用于評估受試者對營養或藥物支持的需求。因此，本發明的特征在于配置成執行本文方法的計算機系統以及含有用于執行方法的程序代碼的計算機可讀介質，所述方法包括評估受試者對營養或藥物支持的需求的方法。作為分析的一部分，本發明還包括生物轉換曲線(translation curve)的生成，并且通過本方法獲得的信息可以擴展到包括依賴于與給定生物標志物相關的多個分析物的復雜分析的治療方法。在另一方面，本發明的特征在于針對給定受試者(例如，人類患者)或受試者組(例如，暴露于類似條件的家畜群(a herd of livestock)或作物(crop of plants))定制的藥物或生理學上可接受的組合物。

發明背景

包括硫胺素(維生素B1)、核黃素(維生素B2)、煙酸(維生素B3)、吡哆醇(維生素B6)、葉酸(維生素B9)、生物素(維生素B7)和鈷胺素(維生素B12)的B族維生素用作整個身體的酶途徑的輔因子或共底物，并因此是最重要的營養生物標志物之一。高劑量的B族維生素可以部分地補償常見的單核苷酸多態性(SNP)，所述SNP導致這些途徑中的酶表現出降低的結合親和力和因此更低的反應速率(Ames et al.,Am.J.Clin.Nutr.75:616-658,2002；Ames et al.,于Nutrigenomics:Discovering the Path to Personalized Nutrition 277-293,2006)。對先天的代謝錯誤(IEM)的研究揭示了維生素輔因子和依賴于它們的酶之間的親密關系。例如，已證明向患有遺傳性酶缺陷的患者施用超生理量的相應的維生素輔因子至少部分恢復了酶功能(Ames,Arch.Biochem.Biophys.423(1):227-234,2004)。雖然在文獻中討論的許多IEM代表完全酶功能障礙的極端和/或罕見實例，但是已經顯示相同的機制在具有部分酶損傷的個體中起作用。一個很好的例子是編碼亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)的基因，它是同型半胱氨酸和葉酸代謝的核心。已經顯示許多SNP影響MTHFR，并且其中一些在普通人群中相對常見，影響高達20％的個體(Leclerc et al.,NCBI Bookshelf ID NBK6561)。高同型半胱氨酸水平與心血管疾病有關(Wald et al.,BMJ 325:1-7,2002)并且，因此影響MTHFR的SNP可能是研究最多的；我們已經看到這種突變與同型半胱氨酸水平相關的顯著性在葉酸和核黃素耗盡的病況下被放大(Scott,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 98(6):14754-14756,2001；McNulty et al.,Circulation 113:74-80,2006；和Weisberg et al.,Atherosclerosis 156:409-415,2011)。

發明概述

在第一方面，本發明的特征在于生成功能需求分數的方法，其指示個體受試者(或患者)是否處于特定生理狀態或者是否具有特定生理需求。如下文進一步描述的，這些狀態和需求在本文中稱為“生物標志物”，并且評估分析物(例如，生成與相應生物標志物相關的生物轉換曲線)的方法構成本發明的第二方面。

生成功能需求分數的方法可以包括以下步驟：(a)提供來自受試者的樣品；(b)測量樣品中與生物標志物相關的多個分析物；(c)對于高于或低于指定正常限度的每個分析物，指定反映分析物和生物標志物之間的關系強度的分配的關系分數；(d)通過對每個分配的關系分數求和生成總分配的關系分數；和(e)使用總分配的關系分數來生成功能需求分數。