[發(fā)明專利]用于辣椒品種匯豐2號種子純度鑒定的SSR引物組及方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201510706031.3
• 申請日: 2015-10-26
• 公開（公告）號: CN105368935B
• 公開（公告）日: 2018-08-28
• 發(fā)明（設計）人: 徐曉美;王恒明;程雪麗;李穎;孫保娟;謝大森
• 申請（專利權）人: 廣東省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 胡輝

本發(fā)明公開了一種用于辣椒品種匯豐2號種子純度鑒定的SSR引物組及方法。包括SSR分子標記L0143和L0622，以及它們對應的引物對。利用上述任一引物對，可將‘匯豐2號’辣椒雜交種與其母本、父本區(qū)分開來，快速檢測出雜交種子的純度。此外，該引物組還可用于辣椒品種‘粵紅1號’、‘匯豐1號’、和‘匯豐5號’種子真?zhèn)涡澡b定。本方法具有快速、準確、低成本和操作簡單等優(yōu)點，能夠替代傳統(tǒng)雜交種子純度鑒定的方法，具有較高的商業(yè)應用價值。

技術領域

本發(fā)明涉及分子標記技術，具體涉及利用SSR分子標記檢測辣椒品種‘匯豐2號’種子純度的引物組及方法。

背景技術

‘匯豐2號’是一個雜交一代辣椒品種，中早熟，具有耐貯運，品質佳等特性，同時抗疫病并且耐熱、耐寒、耐澇和耐旱能力強，深受消費者和戶喜愛（王恒明, 李穎, 郭漢權,等. 早中熟優(yōu)質辣椒新品種‘匯豐2號’[J]. 園藝學報, 2010, 02期:337-338.）。由于辣椒是一種常見的異花授粉作物，以自交為主，同時存在一定的天然雜交（< 50%）。因此在F₁制種時即使是其他方法制種（如雄性不育的利用），也需要人工輔助授粉。在F₁ 代雜交種制種過程中由于生物學混雜和人工操作混雜等原因造成雜交種純度降低的現(xiàn)象時有發(fā)生，給種子生產(chǎn)者、經(jīng)營者和農(nóng)戶造成巨大經(jīng)濟損失。因此，在制種后和銷售前對辣椒F₁ 代雜種子進行純度鑒定是必不可少的。

目前辣椒種子純度鑒定通常采用田間小區(qū)種植，以形態(tài)觀察的辦法，但由于辣椒生育期長，形態(tài)學鑒定通常需要60-120天，周期長，受環(huán)境影響大，準確性較低且耗費人力、財力，所以其應用受到限制。隨著分子生物技術的迅猛發(fā)展，使從DNA水平準確、可靠地對種子純度進行鑒定成為現(xiàn)實。簡單序列重復（Simple Sequence Repeat，SSR）是一類廣泛分布于基因組上的DNA序列，根據(jù)其在不同材料間產(chǎn)生不同的重復次數(shù)從而產(chǎn)生多態(tài)SSR標記。SSR標記是一種共顯性標記，具有多態(tài)性好、重復性高、操作簡便等優(yōu)點，被認為是一種發(fā)展前景看好的 DNA 指紋技術，目前已廣泛運用于水稻、玉米等作物種子純度鑒定，隨著其它小作物基因組學的迅速發(fā)展，利用SSR分子標記檢測種子純度的方法也在黃瓜、甘藍等蔬菜作物中得以應用。

發(fā)明內容

本發(fā)明的目的在于提供用于鑒定辣椒品種‘匯豐2號’種子純度的SSR分子標記、SSR引物組及方法。

本發(fā)明所采取的技術方案是：

一種用于鑒定辣椒品種‘匯豐2號’種子純度的SSR分子標記L0143，其定位于辣椒第1號染色體上，包括母本L0143-1和父本L0143-2，其大小分別為141bp和149bp。

優(yōu)選的，所述SSR分子標記L0143，其母本L0143-1的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，父本L0143-2的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。

用于 PCR 擴增上述SSR分子標記L0143的引物對。

優(yōu)選的，用于 PCR 擴增SSR分子標記L0143的引物對，其序列如下所示：

L0143F：ATGGAGCACCATACTCAAACAACC（SEQ ID NO.3）；

L0143R：GTTTACATCTCCCGACTGAAACTCCG（SEQ ID NO.4）。

一種用于鑒定辣椒品種‘匯豐2號’種子純度的SSR分子標記L0622，其定位于辣椒第6號染色體上，包括母本L0622-1和父本L0622-2，其大小分別為196bp和208bp。

優(yōu)選的，所述SSR分子標記L0622，其母本L0622-1的核苷酸序列如SEQ ID NO：5所示，父本L0622-2的核苷酸序列如SEQ ID NO：6所示。

用于 PCR 擴增上述SSR分子標記L0622的引物對。