[發明專利]指示肉蓯蓉生藥材總苷含量范圍的快速檢測方法及試劑盒有效
| 申請號: | 201510648363.0 | 申請日: | 2015-10-09 |
| 公開(公告)號: | CN105274218B | 公開(公告)日: | 2018-10-19 |
| 發明(設計)人: | 宋述慧;陳婷婷;李語麗;王西亮;姚富文 | 申請(專利權)人: | 中國科學院北京基因組研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京同輝知識產權代理事務所(普通合伙) 11357 | 代理人: | 趙慧;魏忠暉 |
| 地址: | 100101 北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 肉蓯蓉 基因 藥材 總苷 實時熒光定量PCR 快速檢測 試劑盒 二代測序技術 標準參考 產品開發 高效快速 技術鑒定 快速指示 內參基因 特異性強 引物序列 應用提供 負相關 靈敏度 分級 蓯蓉 協同 | ||
1.一種指示肉蓯蓉生藥材總苷含量范圍的快速檢測方法,其特征在于:采用實時熒光定量PCR法測定肉蓯蓉生藥材中下述引物序列所對應基因的表達:
SEQ1:正向引物GCAGCGCCATTATTTGAAC,反向引物AGAGGGGACATGAATCACC;
SEQ2:正向引物GCAGACATGGATGCCCTAC,反向引物TAATTTGGCTGCTCCAAGC;
SEQ3:正向引物GACGGCCAAGCTCTTAGTG,反向引物CTTCCAACATAGCCCACG;
SEQ4:正向引物CCCTTTACGCTCGTTTGG,反向引物TGAATCAAAGACGGTGGAAC;
其中基因SEQ2為與總苷含量呈正相關,基因SEQ1和基因SEQ3呈負相關;基因SEQ4為內參基因;
其包括下述步驟:
(1)RNA提取及cDNA反轉:提取待測肉蓯蓉的總RNA,RNA經純化后進行逆轉錄反應;
(2)PCR擴增:對提取RNA的SEQ1、SEQ2和SEQ3進行RT-qPCR反應,SEQ4作為內參基因;
(3)計算總苷含量:
A、將生藥材分別分為3個等級,內蒙古阿拉善盟右旗為G1 0~2.5%、G2 2.5%~6.8%和G3 6.8%~14.6%,內蒙古阿拉善盟左旗為G1 0~1.2%、G2 1.2%~2.5%和G3 2.5%~6.0%;
B、根據PCR擴增得到的CT值,采用式(Ⅰ)計算SEQ1、SEQ2和SEQ3三個基因的ΔCT;記為分別與SEQ1、SEQ2、SEQ3對應的n1、n2、n3;
nx=2-ΔCT=2-(CT(所測基因)-CT(內參基因)) (Ⅰ)
其中,x=1、2、3,分別對應SEQ1、SEQ2、SEQ3;
C、將n1、n2、n3分別與Ni1、Ni2、Ni3按照公式(Ⅱ)計算Pi;
其中,i=1、2、3,分別對應G1、G2、G3;
內蒙古阿拉善盟右旗中:N11=0.04、N12=3.33、N13=0.38,N21=0.01、N22=8.02、N23=0.06,N31=0、N32=21.33、N33=0.02;
內蒙古阿拉善盟左旗中:N11=0.02、N12=1.63、N13=0.01,N21=0.01、N22=4.50、N23=0.04,N31=0、N32=9.64、N33=0.01;
D、比較P1、P2、P3,總苷含量處于最小Pi所對應的Gi的范圍內。
2.根據權利要求1所述的指示肉蓯蓉生藥材總苷含量范圍的快速檢測方法,其特征在于,所述步驟(2)PCR擴增的反應條件為:95℃、2min,95℃、15s,然后56℃、30m,72℃、30s;共40個循環。
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