[發(fā)明專利]多重PCR檢測(cè)腸道新發(fā)原蟲試劑盒及檢測(cè)方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201510093500.9 | 申請(qǐng)日: | 2015-03-02 |
| 公開(公告)號(hào): | CN104726566B | 公開(公告)日: | 2017-02-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 沈玉娟;曹建平;劉華;袁忠英;姜巖巖;尹建海;王燕娟 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/90 |
| 代理公司: | 上海浦一知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司31211 | 代理人: | 王函 |
| 地址: | 200025 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 多重 pcr 檢測(cè) 腸道 原蟲 試劑盒 方法 | ||
1.一種多重PCR檢測(cè)腸道新發(fā)原蟲試劑盒,其特征在于,其用于同時(shí)檢測(cè)隱孢子蟲、賈第蟲、環(huán)孢子蟲和微孢子蟲,該試劑盒包括如下引物:
隱孢子蟲的特異性引物:
Cry-F:5’-TCAGCTTTAGACGGTAGGGTATTGG-3’,SEQ?ID?NO.1;
Cry-R:5’-CGAGCTTTTTAACTGCAACAACTTT-3’,SEQ?ID?NO.2;
賈第蟲的特異性引物:
Gia-F:5’-AGTGTTGAGATGCTTCAGGACATG-3’,SEQ?ID?NO.3;
Gia-R:5’-GCACGCTTAGCCTTCTTGGC-3’,SEQ?ID?NO.4;
環(huán)孢子蟲的特異性引物:
Cycl-F:5’-GACAGTTGGGGGCATTCGTATTTA-3’,SEQ?ID?NO.5;
Cycl-R:5’-CCCCCAGAACCCAGAGACTTTGAT-3’,SEQ?ID?NO.6;
微孢子蟲的特異性引物:
Micro-F:5’-ACGGAGGCGAAGGCGACACT-3’,SEQ?ID?NO.7;
Micro-R:5’-CTTGCGAGCGTACTATCCCCAGAG-3’,SEQ?ID?NO.8。
2.一種隱孢子蟲、賈第蟲、環(huán)孢子蟲和微孢子蟲的多重PCR檢測(cè)方法,其特征在于,具體步驟包括如下:
(1)隱孢子蟲、賈第蟲、環(huán)孢子蟲和微孢子蟲的蟲體DNA提取;
(2)引物設(shè)計(jì)與篩選;所述設(shè)計(jì)的引物序列為:
隱孢子蟲的特異性引物:
Cry-F:5’-TCAGCTTTAGACGGTAGGGTATTGG-3’,SEQ?ID?NO.1;
Cry-R:5’-CGAGCTTTTTAACTGCAACAACTTT-3’,SEQ?ID?NO.2;
賈第蟲的特異性引物:
Gia-F:5’-AGTGTTGAGATGCTTCAGGACATG-3’,SEQ?ID?NO.3;
Gia-R:5’-GCACGCTTAGCCTTCTTGGC-3’,SEQ?ID?NO.4;
環(huán)孢子蟲的特異性引物:
Cycl-F:5’-GACAGTTGGGGGCATTCGTATTTA-3’,SEQ?ID?NO.5;
Cycl-R:5’-CCCCCAGAACCCAGAGACTTTGAT-3’,SEQ?ID?NO.6;
微孢子蟲的特異性引物:
Micro-F:5’-ACGGAGGCGAAGGCGACACT-3’,SEQ?ID?NO.7;
Micro-R:5’-CTTGCGAGCGTACTATCCCCAGAG-3’,SEQ?ID?NO.8;
(3)質(zhì)粒構(gòu)建;
(4)建立多重PCR方法,對(duì)所設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行PCR反應(yīng)條件優(yōu)化,得到最佳多重PCR模式;
(5)按照步驟(4)的PCR反應(yīng)條件進(jìn)行PCR擴(kuò)增特異性驗(yàn)證;
(6)按照步驟(4)的PCR反應(yīng)條件進(jìn)行PCR敏感性驗(yàn)證;
(7)按照建立的多重PCR方法對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè)和可行性驗(yàn)證。
3.如權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,步驟(3)具體為:將隱孢子蟲、賈第蟲、環(huán)孢子蟲和微孢子蟲進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物回收連接到pMD19-T載體,第二天進(jìn)行轉(zhuǎn)化;以單菌落為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,每個(gè)培養(yǎng)板各挑取5個(gè)菌落,每個(gè)樣本接1個(gè)陽性箘落,37℃,過夜培養(yǎng),提取質(zhì)粒進(jìn)行PCR鑒定,并將PCR結(jié)果正確的質(zhì)粒送測(cè)序。
4.如權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,步驟(4)中,所述的PCR反應(yīng)條件優(yōu)化具體方法為:退火溫度根據(jù)引物合成后參考溫度,選取57℃、60℃進(jìn)行PCR,根據(jù)擴(kuò)增效果確定退火溫度,最后確定最佳的多重PCR模式。
5.如權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于,步驟(4)中,退火溫度為60℃。
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