[發明專利]用于樣品處理的組合物和方法

有效

• 申請號: 201480047858.1
• 申請日: 2014-06-26
• 公開（公告）號: CN105492607B
• 公開（公告）日: 2019-07-02
• 發明（設計）人: 本杰明·辛德森;克里斯多佛·辛德森;邁克爾·史諾-萊文;凱文·奈斯;米爾娜·雅羅什;唐納德·馬斯克利耶;瑟奇·薩克森諾夫;蘭登·梅里爾;安德魯·普萊斯;保羅·哈登伯爾;媛·李
• 申請（專利權）人: 10X基因組學有限公司
• 主分類號: C12N15/10
• 分類號: C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6869
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 鄭霞

1.一種對樣品材料進行條形碼化的方法，其包括：

(a)提供珠子，其包含與之關聯的多個核酸條形碼分子，所述多個核酸條形碼分子包含共同條形碼序列；

(b)將所述珠子與樣品材料的組分共同分配至分區；

(c)將所述多個核酸條形碼分子中的核酸條形碼分子從所述珠子釋放至所述分區內；以及

(d)將所述核酸條形碼分子附接至所述分區內的樣品材料的一種或多種組分或其片段。

2.根據權利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少1,000個與之關聯的核酸條形碼分子，所述至少1,000個核酸條形碼分子具有共同條形碼序列。

3.根據權利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少10,000個與之關聯的核酸條形碼分子，所述至少10,000個核酸條形碼分子具有共同條形碼序列。

4.根據權利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少100,000個與之關聯的核酸條形碼分子，所述至少100,000個核酸條形碼分子具有共同條形碼序列。

5.根據權利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少1,000,000個與之關聯的核酸條形碼分子，所述至少1,000,000個核酸條形碼分子具有共同條形碼序列。

6.根據權利要求1所述的方法，其中所述多個核酸條形碼分子可釋放地偶聯至該珠子。

7.根據權利要求1所述的方法，其中所述珠子包括凝膠珠子。

8.根據權利要求1所述的方法，其中所述分區包含小滴。

9.根據權利要求6所述的方法，其中所述(b)包括使包含珠子的第一水性流體與包含樣品材料的組分的第二水性流體在不混溶流體內的小滴中組合。

10.根據權利要求1所述的方法，其中(c)包括降解所述珠子。

11.根據權利要求6所述的方法，其中(c)包括降解所述珠子，以將所述核酸條形碼分子釋放至所述分區內。

12.根據權利要求6所述的方法，其中(c)包括切割所述核酸條形碼分子與所述珠子之間的化學聯接。

13.根據權利要求6所述的方法，其中所述珠子的交聯和所述珠子與所述多個核酸條形碼分子之間的聯接中的至少一種包括二硫鍵，并且其中(c)包括使所述珠子暴露于還原劑。

14.根據權利要求13所述的方法，其中所述還原劑是二硫蘇糖醇(DTT)或三(2-羧基乙基)膦(TCEP)。

15.根據權利要求1所述的方法，其中所述樣品材料的組分包含一個或多個模板核酸分子，并且其中(d)包括將所述核酸條形碼分子附接至所述一個或多個模板核酸分子的一個或多個片段。

16.根據權利要求1所述的方法，其中所述樣品材料的組分包含一個或多個模板核酸分子，所述多個核酸條形碼分子還包含與所述一個或多個模板核酸分子的至少一部分互補的引物序列，并且(d)包括延伸所述核酸條形碼分子以復制所述一個或多個模板核酸分子的至少一部分。

17.根據權利要求1所述的方法，其中所述樣品材料的組分包含單細胞的內含物。

18.根據權利要求17所述的方法，其中所述單細胞包括癌細胞。

19.根據權利要求17所述的方法，其中所述單細胞包括細菌細胞。