[發(fā)明專(zhuān)利]一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法及裝置

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201410827322.3
• 申請(qǐng)日: 2014-12-25
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN104573404B
• 公開(kāi)（公告）日: 2018-05-04
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 周豐豐;孫國(guó)權(quán);麥國(guó)琴
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 深圳先進(jìn)技術(shù)研究院
• 主分類(lèi)號(hào): G06F19/10
• 分類(lèi)號(hào): G06F19/10
• 代理公司: 廣州三環(huán)專(zhuān)利商標(biāo)代理有限公司44202
• 代理人: 郝傳鑫,熊永強(qiáng)

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法及裝置。

背景技術(shù)

心肌病是一組由于心臟下部分腔室(即心室)的結(jié)構(gòu)改變和心肌壁功能受損導(dǎo)致心臟功能進(jìn)行性障礙的病變，其發(fā)病機(jī)理至今尚未完全明確。缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy，ICM)，是指由于冠狀動(dòng)脈粥樣硬化引起長(zhǎng)期心肌缺血，導(dǎo)致心肌局限性或彌漫性纖維化，產(chǎn)生與原發(fā)性擴(kuò)張型心肌病類(lèi)似的臨床綜合征，如心臟收縮或舒張功能受損、心臟擴(kuò)大或僵硬、心絞痛、心力衰竭或心律失常等一系列臨床表現(xiàn)。特發(fā)性心肌病(idiopathic cardiomyopathy)，可分為擴(kuò)張性心肌病、肥厚性心肌病以及縮窄性心肌病，主要是由于左心室擴(kuò)張，心室舒張末期容量增加，導(dǎo)致心肌收縮功能障礙。該病的臨床表現(xiàn)有心臟擴(kuò)大，心力衰竭，常有心律失常及栓塞發(fā)生等。

目前，生物標(biāo)志物對(duì)心肌病的診斷具有重要意義。人類(lèi)心肌病轉(zhuǎn)錄組的研究表明，有一系列的基因與心臟衰竭有關(guān)。Hannenhalli等人研究表明，與正常人相比，有1020個(gè)基因在缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy)病人中差異表達(dá)，有1002個(gè)基因在特發(fā)性心肌病(idiopathic cardiomyopathies)病人中差異表達(dá)。但是已有生物標(biāo)記物之間是獨(dú)立的，沒(méi)有考慮基因之間的相互聯(lián)系。然而，生物體本身是一個(gè)完整的系統(tǒng)，各個(gè)基因之間是存在聯(lián)系的。不考慮基因之間的聯(lián)系，很難反映心肌病患者的真實(shí)情況。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明實(shí)施例提供一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法及裝置，將共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)確定為心肌病生物標(biāo)志物，可以提高心肌病患者的識(shí)別精準(zhǔn)度。

本發(fā)明實(shí)施例提供了一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法，包括：

獲取樣本基因表達(dá)譜；

對(duì)所述樣本基因表達(dá)譜進(jìn)行分析，以獲取對(duì)應(yīng)的基因數(shù)據(jù)，各個(gè)所述基因數(shù)據(jù)包括若干基因的基因表達(dá)量；

獲取預(yù)先設(shè)定的篩選算法；

通過(guò)所述篩選算法，在所述基因數(shù)據(jù)中篩選出共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)；

確定所述共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)為心肌病生物標(biāo)志物。

相應(yīng)地，本發(fā)明實(shí)施例還提供了一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理裝置，包括：

第一獲取單元，用于獲取樣本基因表達(dá)譜；

分析單元，用于對(duì)所述樣本基因表達(dá)譜進(jìn)行分析，以獲取對(duì)應(yīng)的基因數(shù)據(jù)，各個(gè)所述基因數(shù)據(jù)包括若干基因的基因表達(dá)量；

第二獲取單元，用于獲取預(yù)先設(shè)定的篩選算法；

篩選單元，用于通過(guò)所述篩選算法，在所述基因數(shù)據(jù)中篩選出共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)；

確定單元，用于確定所述共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)為心肌病生物標(biāo)志物。

實(shí)施本發(fā)明實(shí)施例，對(duì)樣本基因表達(dá)譜進(jìn)行分析，以獲取對(duì)應(yīng)的基因數(shù)據(jù)，各個(gè)基因數(shù)據(jù)包括若干基因的基因表達(dá)量，通過(guò)預(yù)先設(shè)定的篩選算法，在基因數(shù)據(jù)中篩選出共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)，確定共表達(dá)基因?qū)?shù)據(jù)為心肌病生物標(biāo)志物，可以提高心肌病患者的識(shí)別精準(zhǔn)度。

附圖說(shuō)明

為了更清楚地說(shuō)明本發(fā)明實(shí)施例的技術(shù)方案，下面將對(duì)實(shí)施例描述中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹，顯而易見(jiàn)地，下面描述中的附圖是本發(fā)明的一些實(shí)施例，對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來(lái)講，在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下，還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。

圖1是本發(fā)明第一實(shí)施例中提供的一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法的流程示意圖；

圖2是本發(fā)明第二實(shí)施例中提供的一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法的流程示意圖；

圖3是本發(fā)明第三實(shí)施例中提供的一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法的流程示意圖；

圖4是本發(fā)明第四實(shí)施例中提供的一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理方法的流程示意圖；

圖5A是本發(fā)明實(shí)施例中提供的一種非心肌病患者對(duì)應(yīng)的共表達(dá)基因?qū)Φ男Ч疽鈭D；

圖5B是本發(fā)明實(shí)施例中提供的一種特發(fā)性心肌病患者對(duì)應(yīng)的共表達(dá)基因?qū)Φ男Ч疽鈭D；

圖6A是本發(fā)明實(shí)施例中提供的另一種非心肌病患者對(duì)應(yīng)的共表達(dá)基因?qū)Φ男Ч疽鈭D；

圖6B是本發(fā)明實(shí)施例中提供的另一種特發(fā)性心肌病患者對(duì)應(yīng)的共表達(dá)基因?qū)Φ男Ч疽鈭D；

圖7是本發(fā)明實(shí)施例中提供的一種心肌病基因數(shù)據(jù)處理裝置的結(jié)構(gòu)示意圖。

具體實(shí)施方式