[發(fā)明專利]一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201410471164.2 | 申請日: | 2014-09-16 |
| 公開(公告)號: | CN104232772B | 公開(公告)日: | 2017-03-29 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 陳放;李佛生;毛強;詹誠;唐琳 | 申請(專利權(quán))人: | 四川大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 成都玖和知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙)51238 | 代理人: | 黎祖琴 |
| 地址: | 610065 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 快速 靈敏 檢測 分子 rna 方法 | ||
1.一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)提取、純化待檢測小分子RNA;
(2)探針設(shè)計:根據(jù)待檢測小分子RNA的堿基序列設(shè)計探針,所述探針用生物素或地高辛進行標記;
(3)液相雜交:將所述待檢測小分子RNA與所述探針在緩沖液中進行雜交,并消化掉未雜交的單鏈序列,然后進行凝膠電泳;
(4)轉(zhuǎn)膜:將電泳后的凝膠上的雜交產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到固相支持物上;
(5)抗體孵育:將步驟(4)所得到的含有雜交產(chǎn)物的固相支持物與特異性抗體進行孵育雜交;
(6)信號檢測:檢測步驟(5)所得的固相支持物上的信號。
2.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,還包括線性回歸方程制作步驟:采用一系列濃度梯度的已知miRNA分別進行所述步驟(3)-(6)的操作,然后以已知miRNA的濃度為X軸,顯色濃度為Y軸建立曲線坐標。
3.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,所述固相支持物為尼龍膜、纖維素膜和PVDF膜中的任何一種,優(yōu)選尼龍膜。
4.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(2)中,探針設(shè)計時,根據(jù)待檢測小分子RNA的堿基序列,設(shè)計成DNA形式,根據(jù)此設(shè)計反向互補的寡核苷酸,并在5’端隨機增加2個核苷酸后,再用生物素或地高辛標記。
5.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(3)中所述凝膠為含1×TBE的?10%-15%的聚丙烯酰胺凝膠;步驟(3)中,雜交反應(yīng)體系于95℃變性0.5?min以上,然后在42-65℃雜交0.5?min以上。
6.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(3)中,用核酸外切酶消化了未雜交上的多余單鏈;雜交緩沖液中,磷酸根濃度為0-0.5?M,Na+濃度為0-1.5?M,EDTA濃度為0-0.5?M,pH為6.0-9.5。
7.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(4)中,轉(zhuǎn)膜時,根據(jù)凝膠的大小裁剪6張同樣大小的濾紙,及1張固相支持物,按照從下到上依次為3層濾紙、凝膠、固相支持物、3層濾紙的順序?qū)R擺放,然后將上述的濾紙、凝膠、固相支持物的“三明治”結(jié)構(gòu)夾在兩層濕潤的固相支持物中間。
8.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(5)中,先將含有雜交產(chǎn)物的固相支持物加入封閉液后在20-37℃下孵育1?min以上,棄封閉液,然后加入稀釋的抗體,在20-37℃下孵育5?min以上。
9.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(3)中,雜交反應(yīng)體系于95℃變性5?min,然后在42℃雜交1h;步驟(5)中,先將含有雜交產(chǎn)物的固相支持物加入封閉液后在37℃下孵育5?min,棄封閉液,然后加入稀釋的抗體,在37℃下孵育30?min。
10.如權(quán)利要求1所述的一種快速靈敏檢測小分子RNA的方法,其特征在于,步驟(6)中,采用CDP-Star檢測方法或者X壓片方法進行信號檢測。
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