[發(fā)明專利]同時(shí)檢測(cè)遲緩愛(ài)德華氏菌和鮰愛(ài)德華氏菌的熒光探針PCR方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201410441438.3 | 申請(qǐng)日: | 2014-09-01 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN104164514A | 公開(kāi)(公告)日: | 2014-11-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 郭書(shū)林;陳信忠;賈鵬;龔艷清;楊俊萍;陳炳穎;孔繁德 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 廈門出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京科億知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 湯東鳳 |
| 地址: | 361009 福建*** | 國(guó)省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 同時(shí) 檢測(cè) 遲緩 愛(ài)德華 熒光 探針 pcr 方法 | ||
1.一種同時(shí)檢測(cè)遲緩愛(ài)德華氏菌和鮰愛(ài)德華氏菌的熒光探針PCR檢測(cè)方法,所述的方法包括:利用特異性探針和引物對(duì),以細(xì)菌DNA為模板進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光PCR?反應(yīng),其特征在于:所述引物對(duì)分別為Seq?ID?No.1、Seq?IDNo.2、Seq?IDNo.3和Seq?IDNo.4?所示的序列;
Seq?ID?No.1:?5’-CTGCCAAGCAGGGACGTAA-3’
Seq?ID?No.2:?5’-CGAGGAGAGCATCTTGTCGAA-3’
Seq?ID?No.3:?5’-TCCATTCGTCTGTGCGACAA-3’
Seq?ID?No.4:?5’-AAAACACGTTCGGATGGATTG-3’
所述探針為能與遲緩愛(ài)德華氏菌或鮰愛(ài)德華氏菌的基因組DNA位于所述引物對(duì)之間的序列相同或互補(bǔ)的核苷酸序列,并且所述探針的5’端和3’端分別標(biāo)記有熒光報(bào)告基團(tuán)和熒光淬滅基團(tuán);
所述探針為Seq?ID?No.5和Seq?ID?No.6所示的序列,
Seq?ID?No.5:5’-ATCCTCAACGTCGAGAAGGCGCG-3’
Seq?ID?No.6:5’-CACTATGAGGGTGGGATCAAGGCGTTT-3’。
2.根據(jù)權(quán)利要求1?所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述Seq?ID?No.5探針5’端標(biāo)記的熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM,Seq?ID?No.6探針5’端標(biāo)記的熒光報(bào)告基團(tuán)為VIC,所述探針3’端標(biāo)記的熒光淬滅基團(tuán)為TAMRA。
3.根據(jù)權(quán)利要求1?或2?所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述實(shí)時(shí)熒光PCR?反應(yīng)的引物終濃度為0.25μmol/?dm3,探針終濃度為0.5μmol/?dm3。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的檢測(cè)方法,其特征在于:所述實(shí)時(shí)熒光PCR?的反應(yīng)條件包括:先95?℃變性1?min,然后95?℃?10?s、55℃10?s、68?℃?30?s循環(huán)40次,在68℃進(jìn)行FAM和VIC雙通道熒光采集。
5.一種用于同時(shí)檢測(cè)遲緩愛(ài)德華氏菌和鮰愛(ài)德華氏菌的試劑盒,其特征在于:所述試劑盒含有能擴(kuò)增出遲緩愛(ài)德華氏菌和鮰愛(ài)德華氏菌的基因片段的引物對(duì),所述引物對(duì)分別為Seq?ID?No.1、Seq?IDNo.2、Seq?IDNo.3和Seq?IDNo.4?所示的序列;
Seq?ID?No.1:?5’-CTGCCAAGCAGGGACGTAA-3’
Seq?ID?No.2:?5’-CGAGGAGAGCATCTTGTCGAA-3’
Seq?ID?No.3:?5’-TCCATTCGTCTGTGCGACAA-3’
Seq?ID?No.4:?5’-AAAACACGTTCGGATGGATTG-3’
所述探針為能與遲緩愛(ài)德華氏菌或鮰愛(ài)德華氏菌的基因組DNA位于所述引物對(duì)之間的序列相同或互補(bǔ)的核苷酸序列,并且所述探針的5’端和3’端分別標(biāo)記有熒光報(bào)告基團(tuán)和熒光淬滅基團(tuán);
所述探針為Seq?ID?No.5和Seq?ID?No.6所示的序列,
5’-ATCCTCAACGTCGAGAAGGCGCG-3’
5’-CACTATGAGGGTGGGATCAAGGCGTTT-3’。
6.根據(jù)權(quán)利要求5?所述的檢測(cè)試劑盒,其特征在于:所述Seq?ID?No.5探針5’端標(biāo)記的熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM,Seq?ID?No.6探針5’端標(biāo)記的熒光報(bào)告基團(tuán)為VIC,所述探針3’端標(biāo)記的熒光淬滅基團(tuán)為TAMRA。
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