[發明專利]含HD到NG毒性因子模式的avrBs3/pthA家族基因jva1

有效

• 申請號: 201410083596.6
• 申請日: 2014-03-10
• 公開（公告）號: CN103882035A
• 公開（公告）日: 2014-06-25
• 發明（設計）人: 張燕;夏更壽
• 申請（專利權）人: 張燕
• 主分類號: C12N15/31
• 分類號: C12N15/31
• 代理公司: 浙江永鼎律師事務所 33233
• 代理人: 張健

技術領域

本發明涉及生物技術中的基因克隆、基因表達技術領域，具體涉及一個含HD到NG毒性因子模式的avrBs3/pthA家族基因jva1。

背景技術

水稻（Oryzasativa）是世界性重要的糧食作物^[1]，也是谷類生物學的模式植物^[2,3]。水稻白葉枯病（Bacterialblightofrice）是水稻三大病害之一，其病原物為水稻黃單胞菌Xanthomonasoryzaepv.oryzae（Xoo）,Xoo有很多不同的小種，已經報導的Xoo小種有30多個^[4]。

與其它黃單胞屬的細菌一樣，水稻白葉枯病菌Xoo含有致病性所必須的Ш型泌出系統（T3S）,T3S跨過細菌雙層膜，很可能直接穿過植物細胞壁^[5,6]。細菌的效應分子蛋白通過T3S泌出并且進入植物細胞^[7]，這些效應分子作用于不同的植物生理過程，抑制植物防衛反應，調節植物轉錄過程，增強細菌毒性^[8-9]。AvrBs3/pthA是最大的T3S泌出的效應分子家族，在植物細胞內以類植物基因轉錄因子（Transcriptionactivator-likeeffector,TALE）的方式起作用^[10-14]。

AvrBs3/pthA家族成員具有五個典型的結構特征，存在于三個區域內：1）N端與T3S泌出有關的序列；2）中間部分是負責與DNA特異性結合的區域，含有隨機重復單元，重復單元由30-42個氨基酸殘基組成，重復數在1.5-33.5之間^[15]。AvrBs3中間重復單元由102bp編碼的34個氨基酸殘基組成，已經克隆一些含有34個氨基酸殘基重復單元的AvrBs3類似的成員，其重復數是5.5-25.5個^[16-20]。重復單元的氨基酸序列高度保守，只有12和13位氨基酸殘基有變化，12和13位氨基酸殘基稱為重復可變雙殘基（repeatvariabledi-residue,RVD），RVD的序列決定了與重復單元相結合的DNA序列特異性，即重復單元中這些氨基酸殘基對RVD與靶標DNA序列之間確定了結合法則^[21-22]。3）另外三個特征是C端的亮氨酸拉鏈（leucinezipper，LZ）結構、三個核定位信號（nuclearlocalizationsignal，NLS）和酸性轉錄激活區（acidictranscriptionalactivationdomain，AAD）^[23-25]。

自1983年第一個avrBs3/pthA家族成員基因avrBs3被克隆以來^[26]，多個Xoo不同菌株的該家族成員得到克隆，avrXa7、avrXa10、avrXa5、aB3.5、aB3.6、aB4.3和aB4.5（PXO86）^[27-28]，pthXo1（PXO99^A）、pthXo2（JXOI^A）、pthXo3（PXO61）、pthXo1-2及pthXo2-2（PXO71）、avrXa7-2（KXO85^A）^[29]，avrXa3（JXOШ）^[30]。尤其隨著當今測序技術的飛速發展，全基因組序列的獲得和分析，對該家族成員在不同菌株中的組成及特征，了解更多更全面。然而，不同的Xoo菌株中該家族成員組成、特征及功能存在差異，因此，仍然有很多Xoo菌株的avrBs3/pthA家族成員序列組成及功能有待闡明。

發明內容

本發明提供了一種含HD到NG毒性因子模式的avrBs3/pthA家族基因jva1，是Xoo日本小種JXOV菌株中一個avrBs3/pthA家族成員基因，解決了目前對于日本小種JXOV中avrBs3/pthA家族成員基因了解不夠的問題，尤其是在jva1中間區域含有12.5個重復單元，并且含有HD到NG毒性因子重復模式。

本發明的有益效果是：該jva1基因屬于JXOV菌株avrBs3/pthA家族成員基因，具有HD到NG毒性因子八個重復模式，有利于推動病原物毒性機制的研究，可以用于研究avrBs3/pthA家族成員基因起毒性作用的分子機制，也可以用來找到水稻中相對應的抗白葉枯病基因，為抗病育種提供基礎，從而指導生產實踐。

附圖說明

圖1是本發明的Jva1氨基酸序列具有的AvrBs3/pthA家族成員五個特征示意圖；