[發明專利]一對靶向綿羊DKK2基因的sgRNA有效
| 申請號: | 201410069919.6 | 申請日: | 2014-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN103805605B | 公開(公告)日: | 2016-11-30 |
| 發明(設計)人: | 趙金山;李和剛;柳楠;程明;劉開東;劉積鳳 | 申請(專利權)人: | 青島農業大學;青島市畜牧獸醫研究所 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12N15/11;C40B40/08 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一對 靶向 綿羊 dkk2 基因 sgrna | ||
技術領域
本發明屬于基因工程技術領域,具體而言,涉及一對靶向識別綿羊DKK2基因的sgRNA及其應用。
背景技術
ZFN和TALEN打靶技術是目前研究較為成熟的兩種定點突變技術,但是這兩種技術構建程序較為繁瑣,每一個位點需要構建一對相應的核酸酶。而CRISPR/Cas9系統對特異位點的識別靠小的crRNA的引導,CRISPR區可以有一系列的crRNA組成,每個針對特異位點的crRNA只有幾十個堿基,整個載體較小,相對于ZFN和TALEN載體,更加容易構建(CRISPR/Cas9新型基因打靶系統的研究進展.江蘇農業學報.李輝等,2013)。
(CRISPR)/CRISPR-associated(Cas)是細菌和古細菌一種不斷進化適應的免疫防御機制。CRISPR/Cas9利用一段小RNA來識別并剪切DNA以降解外來核酸分子。Cong等(Multiplex?Genome?Engineering?Using?CRISPR/Cas?Systems.Science.2013)及Mali等(RNA-guided?human?genome?engineering?via?Cas9.Science.2013)證明Cas9系統能在293T、K562、iPS等多種細胞中,進行有效的靶向酶切,非同源重組(NHEJ)、同源重組(HR)效率在3-25%之間,與TALEN酶切效果相當。他們還證明,多個靶點可以同時進行靶向酶切。但是,隨后的研究表明,Cas9存在較為明顯的脫靶效應(High-frequency?off-target?mutagenesis?induced?by?CRISPR-Cas?nucleases?in?human?cells.Nature?Biotechnology.Fu?et?al,2013;High-throughput?profiling?of?off-target?DNA?cleavage?reveals?RNA-programmed?Cas9nuclease?specificity.Nature?Biotechnology.Pattanayak?et?al,2013)。麻省理工學院Feng?Zhang團隊使用雙切刻技術將Cas9的特異性提高了50倍以上(Double?nicking?by?RNA-guided?CRISPR?Cas9for?enhanced?genome?editing?specificity.Cell.Ran?et?al,2013),維護了Cas9在基因打靶技術領域的地位。借助于這一技術,動植物基因功能研究及育種等等都將得到迅猛的發展。
DKK基因家族是WNT信號通路的抑制因子,而WNT信號轉導調控毛囊的生長發育。DKK2是DKK基因家族的重要成員。DKK2的高度過表達導致小鼠幾乎無毛;DKK2相對較低水平的過表達,小鼠被毛出現,但是結構異常(Wnt?and?dkk?determine?hair?follicle?spacing?through?a?reaction-diffusion?mechanism.Science.Sick?et?al,2006)。Foxnl::Dkk2中度過表達小鼠,單位面積的毛囊數量下降了30%,毛囊呈束狀排布。Sick等使用反應-擴散模型還預測,DKK的表達量下降或降解加速會導致毛囊間距降低(Wnt?and?dkk?determine?hair?follicle?spacing?through?a?reaction-diffusion?mechanism.Science.Sick?et?al,2006)。與這一預測相一致的是,抑制BMP信號導致毛囊密度增加(Makin?gwaves?with?hairs.J?Invest?Dermatol.Plikus?et?al,2004),而抑制BMP可能降低DKK2表達(The?Wnt?antagonist?Dickkopf-1is?regulated?by?Bmp?signaling?and?c-Jun?and?modulates?programmed?cell?death.EMBO?J.Grotewold?et?al,2002)。
由此可見,DKK2是細毛羊育種的重要候選基因。在細胞或個體水平上對綿羊DKK2基因進行敲除或修飾,可解析綿羊DKK2基因的功能,為細毛羊的羊毛細度育種服務。
發明內容
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