[發明專利]一種人巨細胞病毒核酸定量檢測引物和探針、試劑盒及其用途有效
| 申請號: | 201410007284.7 | 申請日: | 2014-01-08 |
| 公開(公告)號: | CN103805713A | 公開(公告)日: | 2014-05-21 |
| 發明(設計)人: | 魏超;林家旺;魏劭 | 申請(專利權)人: | 廈門安普利生物工程有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廈門市精誠新創知識產權代理有限公司 35218 | 代理人: | 方惠春 |
| 地址: | 361000 福建省*** | 國省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 巨細 病毒 核酸 定量 檢測 引物 探針 試劑盒 及其 用途 | ||
1.一種人巨細胞病毒核酸定量檢測的引物和探針,其特征在于,所述引物為SEQ?ID?NO:1和SEQ?ID?NO:2的序列;所述探針的序列從5’端起,與靶序列互補的5-10個堿基的單鏈堿基序列;中間13-20個堿基的環狀結構序列;3’端的5-10個堿基序列;所述5’端的與靶序列互補的5-10個堿基的單鏈堿基序列與3’端的5-10個堿基序列部分匹配成頸結構;所述探針成頸環結構,同時探針TM值=(頸環TM值+7)±1,探針5’端有18-25個堿基能夠和靶基因完全匹配,探針序列約23-32bp;所述探針5’端標記熒光基團,3’端標記非熒光淬滅基團。
2.權利要求1的人巨細胞病毒核酸定量檢測的引物和探針,其特征在于,所述探針序列為SEQ?ID?NO:4的序列。
3.權利要求1或2的人巨細胞病毒核酸定量檢測的引物和探針,其特征在于,所述探針序列5’端標記FAM基團,3’端標記Dabcyl非熒光淬滅基團。
4.一種人巨細胞病毒核酸定量檢測試劑盒,其特征在于,包括權利要求1-3的任一引物和探針。
5.權利要求4的人巨細胞病毒核酸定量檢測試劑盒,其特征在于,還包括如下成分,樣本提純試劑,PCR擴增試劑、參考品試劑。
6.權利要求5的人巨細胞病毒核酸定量檢測試劑盒,其特征在于,所述樣本提純試劑為裂解液、洗滌液和重復洗滌液;所述裂解液成分為HCl、二氧化硅、Triton?X-100、EDTA·2Na、異硫氰酸胍;所述洗滌液為HCl、Triton?X-100、EDTA·2Na、異硫氰酸胍;所述重復洗滌液為HCl、Triton?X-100、EDTA·2Na;所述PCR擴增試劑為HCMV?PCR反應管和HCMV反應緩沖液;所述參考品試劑為HCMV陰性對照、HCMV臨界陽性對照,HCMV強陽性對照和HCMV定量標準品;優選的,所述裂解液為10mMPH7.0HCl、1重量‰二氧化硅、1體積‰Triton?X-100、10mM?EDTA·2Na、2M異硫氰酸胍;所述洗滌液為10mMPH7.0HCl、1體積‰Triton?X-100、1mM?EDTA·2Na、2M異硫氰酸胍;所述重復洗滌液為10mMPH7.0HCl、1體積‰Triton?X-100、1mM?EDTA·2Na;所述HCMV?PCR反應管含有2U?Taq酶、0.01U?UNG酶、0.1mM?EDTA·2Na、25微升石蠟油;HCMV反應緩沖液為10pM?HCMV引物,5pM?HCMV探針、20mMPH9.0HCl、50mM?KCl、1.5mM?MgCl2、0.1mM?EDTA·2Na、0.2mM?dNtps。
7.一種應用權利要求1-3任一引物和探針或權利要求4的試劑盒進行人巨細胞病毒核酸定量檢測方法,其特征在于,包括如下步驟,
樣品制備;制備得到純化的核酸;
PCR擴增和熒光值讀取,采用權利要求1-3任一引物和探針或權利要求4的試劑盒;
結果判定。
8.權利要求7的人巨細胞病毒核酸定量檢測方法,其特征在于,所述樣品制備為取0.5mL離心管加入裂解液100μL,然后加入待測樣本50μL,混懸,室溫靜置10分鐘進行裂解;10000g離心25秒,去上清;加入150μL洗滌液對所得到的沉淀進行洗滌,混懸,10000g離心25秒,去上清;加入150μL重復洗滌液,混懸,10000g離心25秒,去上清備用,純化得到的沉淀即為核酸;所述裂解液為10mMPH7.0HCl、1重量‰二氧化硅、1體積‰Triton?X-100、10mM?EDTA·2Na、2M異硫氰酸胍;所述洗滌液為10mMPH7.0HCl、1體積‰Triton?X-100、1mM?EDTA·2Na、2M異硫氰酸胍;所述重復洗滌液為10mMPH7.0HCl、1體積‰Triton?X-100、1mM?EDTA·2Na。
9.權利要求8的人巨細胞病毒核酸定量檢測方法,其特征在于,所述PCR擴增程序為,38℃5分鐘,95℃10分鐘;進入以下循環:95℃15秒,58℃50秒,共40循環;所述熒光值讀取為在PCR擴增每個循環的58℃,30秒時。
10.權利要求8的人巨細胞病毒核酸定量檢測方法,其特征在于,所述結果判定為:
如果檢測樣本中病毒載量為5.0×102Copies/mL≤HCMV?DNA≤5.0×108Copies/mL判斷為陽性,直接報告定量結果;
如果檢測樣本中病毒載量為>5.0×108Copies/mL,判斷為陽性,報告為>5.0×108Copies/mL;
如果檢測樣本中病毒載量為0Copies/ml,判斷為陰性,報告為0.0Copies/ml;
如果檢測樣本中病毒載量為<5.0×102Copies/mL,Copies數僅供參考,建議重新檢測。
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