[發明專利]采用EST-SSR標記進行花椰菜品種鑒定的方法在審
| 申請號: | 201310409457.3 | 申請日: | 2013-09-09 |
| 公開(公告)號: | CN104419762A | 公開(公告)日: | 2015-03-18 |
| 發明(設計)人: | 趙新;劉莉莉;王永;王超楠;蘭青闊;李梅;陳銳;朱珠;郭永澤;景海春 | 申請(專利權)人: | 天津市農業質量標準與檢測技術研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 300195 *** | 國省代碼: | 天津;12 |
| 權利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 采用 est ssr 標記 進行 花椰菜 品種 鑒定 方法 | ||
1.用于花椰菜品種鑒定的EST-SSR引物,其特征在于,包括5對EST-SSR引物:
HYC33上游引物序列:5'-AGACTTCGTCGATCCACCTG-3’,HYC33下游引物序列:5'-GACCTCGTCCTCCTCTTCCT-3’BC5上游引物序列:5'-CAAGAGTCCAAAAGCCGAAC-3’,BC5下游引物序列:5’-CCTTGCTTGCATCAGTTTCA-3’;HYC10上游引物序列:5’-CATGAAAGGCGAAGAGAAGC-3’,HYC10下游引物序列:5'-ACACACCCAAGGCTTGTAGG-3’;BC20上游引物序列:5’-CCACCATCGCTTCTCAGATT-3’,BC20下游引物序列:5'-GTCTCGTCAGGCCTCTTTTG-3’;BC28上游引物序列:5'-TAACTTCTCCCCCGTCCTCT-3’,BC28下游引物序列:5'-GAGATGGCTACAGTGGCTCC-3’。
2.一種采用EST-SSR標記進行花椰菜品種鑒定的方法,其特征在于包括如下步驟:
(1)采用權利要求1所述的EST-SSR引物對供試品種樣品模板DNA進行PCR擴增,其中的PCR擴增反應的總體積為10μL,擴增反應體系為:2×Master?Mixes5μL,上游和下游引物10μmol/L各0.25μL,供試品種花椰菜雜交種基因組DNA模板,濃度100ng/μL,1μL,雙蒸水補足10μL;PCR反應程序為95℃預變性2min;32個擴增循環,94℃40sec,56℃45sec,72℃1min;72℃延伸7min,4℃保存;
(2)對PCR擴增產物進行凝膠電泳,非變性聚丙烯酰胺凝膠濃度為8%,凝膠組分為:去離子水21mL,10×TBE3mL,40%PAG6mL,TEMED30μL,10%過流酰胺300μL;設定電壓250V,電泳1h,關閉電源,進行染色;染色過程:銀染8~10min,迅速水洗,NaOH顯色數分鐘,直至條帶清晰即可,再次水洗;
(3)通過分析EST-SSR結果,比較13份花椰菜品種間多態性位點的差異,確定引物的多態率及多態信息量;在相同遷移率位置上進行“1,0”標注,構建13份花椰菜品種的SSR分析譜帶數據,通過數據分析5對引物是否可對13份花椰菜品種進行完全的區分,同時構建13份花椰菜品種的指紋圖譜。
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