[發明專利]一種基于全基因組序列分析不產真菌毒素的真菌菌株安全性評價方法

無效

• 申請號: 201310301145.0
• 申請日: 2013-07-18
• 公開（公告）號: CN103361431A
• 公開（公告）日: 2013-10-23
• 發明（設計）人: 王棟;徐巖;吳榮
• 申請（專利權）人: 江南大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12Q1/02
• 代理公司: 無錫市大為專利商標事務所 32104
• 代理人: 時旭丹;劉品超

1.一種基于全基因組序列分析不產真菌毒素的真菌菌株安全性評價方法，其特征在于該方法包括以下步驟：

（1）基于真菌全基因組序列數據進行基因預測與注釋；

通過Augustus軟件與Genemark軟件工具分別對測序后全基因組序列數據進行基因預測與編碼區分析，將預測基因序列與各數據庫NR、PFAM、CDD、KEGG、COG、SwissProt及TrEMBL進行比對，獲得相應的功能注釋信息；

（2）針對各種真菌毒素合成代謝骨架途徑和特異途徑及相關基因進行全基因組比對：

所述針對的真菌毒素為：根霉素、黃曲霉毒素、雜色曲霉素、伏馬毒素、桔霉素、根瘤菌素、環匹阿尼酸、單端孢霉烯族毒素這些已報道的真菌毒素；

所述合成代謝骨架途徑和特異途徑為：包括聚酮合酶polyketide?sythnase的PKS途徑、非核糖體多肽合成酶non-ribosomal?peptide?synthetase的NRPS途徑、PKS-NRPS混合代謝、萜類化合物代謝，上述的單個或多個共同作用途徑進行全基因組比對分析；

（3）分析該真菌菌株是否具有產真菌毒素的完整的代謝途徑和關鍵基因，評價其產真菌毒素的潛在能力，進而評價該真菌在食品工業應用中發酵產品和微生物菌種的安全性。

2.權利要求1所述基于全基因組序列分析不產真菌毒素的真菌菌株安全性評價方法的應用，其特征在于基于全基因組序列數據，對于是否產真菌毒素的未知真菌微生物安全性進行評價，基于已報道的華根霉（Rhizopus?chinensis）CCTCC?M?201021、米曲霉（Aspergillus?oryzae）RIB326真菌基因組數據，分析結果表明，華根霉和米曲霉菌株基本不具備產目前已知的真菌毒素的關鍵基因或合成能力，菌種及其發酵產品是相對安全的；而其他曲霉菌株中存在著部分毒素合成關鍵基因簇，菌株的安全性存在風險；由于菌株的多樣性，存在著真菌毒素產生菌與非產生菌。