[發明專利]與宮頸癌發生相關聯的SNP及其用于檢測宮頸癌易感人群的方法

有效

• 申請號: 201310230764.5
• 申請日: 2013-06-08
• 公開（公告）號: CN103361344A
• 公開（公告）日: 2013-10-23
• 發明（設計）人: 馬丁;王世宣;周劍峰;李雙;鄧東銳
• 申請（專利權）人: 深圳市奧尼克斯基因技術有限公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及婦科腫瘤學和分子遺傳學領域，具體地說，本發明涉及與宮頸癌發生相關聯的SNP以及這些SNP用于檢測宮頸癌易感人群的方法。?

背景技術

宮頸癌是危害婦女健康的惡性腫瘤之一，其在世界范圍內的死亡率占到女性惡性腫瘤性疾病的第三位?¹。每年世界上大約50萬新的宮頸癌確診患者，同時每年有26萬8千余人死于宮頸癌²，而上述80％的病例發生在發展中國家³。中國的宮頸癌發病率和死亡率均高居世界的第二位³。目前，宮頸癌的發病率在某些地區出現上升趨勢，且患者趨于年輕化。隨著社會經濟的日益發展，宮頸癌這一危害廣大婦女的惡性疾病越來越受到社會各界的關注。對于宮頸癌的發病機制的研究一直是學界的熱點之一。近年來的流行病學和分子生物學研究揭示了宮頸癌的發生同高危型人類乳頭瘤病毒(HPV)的持續感染存在直接關系^4，5。然而宮頸癌作為一種惡性腫瘤，其發病機制相對復雜，是遺傳與環境相互作用的共同結果，除了高危型HPV的持續感染外，遺傳因素在宮頸癌的發生中起到不容忽視的重要作用^6，7。因此，宮頸癌易感基因的研究是闡明宮頸癌發病機制的重要線索。?

迄今為止，在惡性腫瘤性疾病相關基因的識別和定位方面所取得的成就并不顯著和系統，原因主要在于腫瘤性疾病具有較強的遺傳異質性，其發病存在環境和基因交互作用的復雜性，遺傳模式的不確定性，以及目前針對惡性腫瘤易感基因研究方法的局限性等?，F在，人們已經意識到基因缺陷是很多惡性腫瘤發生的重要原因。以宮頸癌為例，攜帶疾病易感基因的婦女比不攜帶疾病易感基因的婦女更可能罹患宮頸癌。當前，如何從遺傳角度檢測宮頸癌易感基因，判定個體的宮頸癌易感性，并進一步作出風險預測和診斷，是廣大醫療衛生人員和科技工作者面臨的難題和挑戰。盡管國內外對于宮頸癌的易感基因研究已開展多年，但是目前尚未取得全面、系統、詳盡的研究成果。?

發明內容

本發明的目的之一是通過全基因組病例/對照關聯分析研究揭示與宮頸癌發生相關聯的SNP；目的之二是根據上述SNP的遺傳變異提出一種判定宮頸癌易感人群的方法。?

本發明是通過以下技術方案實現的：?

與宮頸癌發生相關聯的SNP，其特征在于位于人類染色體4q12上的rs13117307多態性位點為T；位于人類染色體6p21.32上的rs4282438多態性位點為G，rs9277952多態性位點為A，rs2116260多態性位點為T，rs3129275多態性位點為A，rs3117008多態性位點為C，rs9391756多態性位點為A，rs213210多態性位點為T，其中與宮頸癌發生獨立相關的SNP為rs4282438和rs9277952；位于人類染色體17q12上的rs8067378多態性位點為G。一種與宮頸癌發生相關聯的SNP于檢測宮頸癌易感人群的方法，其特征是通過以下步驟實現：?

(1)基因組DNA提取，用微量DNA提取試劑盒提取基因組DNA；?

(2)Taqman?PCR擴增含SNP位點的目的片段；?

(3)PCR產物熒光采集與基因分型；?

(4)結果判定，根據這一易感基因內SNP位點的差異確定宮頸癌的易感人群。?

本發明內容表明，位于人類染色體4q12上的rs13117307，位于人類染色體6p21.32上的rs4282438、rs9277952、rs2116260、rs3129275、rs3117008、rs9391756、rs213210(其中與宮頸癌發生獨立相關的SNP為rs4282438和rs9277952)和位于人類染色體17q12上的rs8067378是與宮頸癌發生相關聯的SNP，上述SNP的多態性位點與正常人存在差異，因此與宮頸癌的易感性相關聯。即rs13117307多態性位點為?T、rs4282438多態性位點為G、rs9277952多態性位點為A和rs8067378多態性位點為G的人群為宮頸癌的易感人群。?