[發(fā)明專利]利用極體或胚胎的單細胞基因組測序來選擇試管嬰兒的胚胎無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310057440.6 | 申請日: | 2013-02-22 |
| 公開(公告)號: | CN104004817A | 公開(公告)日: | 2014-08-27 |
| 發(fā)明(設計)人: | 謝曉亮;喬杰;湯富酬;閆麗盈;樊偉;侯宇 | 申請(專利權(quán))人: | 哈佛大學;北京大學第三醫(yī)院;北京大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京康信知識產(chǎn)權(quán)代理有限責任公司 11240 | 代理人: | 李丙林;張英 |
| 地址: | 美國馬*** | 國省代碼: | 美國;US |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 利用 胚胎 單細胞 基因組 測序來 選擇 試管嬰兒 | ||
1.通過分析一個供體女性的卵母細胞的極體來確定供體女性基因組單體型的方法,其特征在于,該方法包括如下步驟:
(1)獲取卵細胞,體外受精;
(2)從卵母細胞中分離出第一極體和第二極體;
(3)對第一極體和第二極體分別進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增,然后進行基因組高通量測序;
(4)將測序結(jié)果與人類參考基因組數(shù)據(jù)庫以及單堿基多態(tài)性位點(SNP)數(shù)據(jù)庫比對,找出雜合的單堿基多態(tài)性位點,并解析出女性供體的單體型。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增的步驟包括裂解細胞,再用MALBAC技術(shù)對單細胞基因組DNA進行擴增。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述解析出女性供體的單體型的步驟為根據(jù)第一極體和/或第二極體中雜合SNP位點的連鎖關(guān)系解析出女性供體的單體型。
4.一種在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的的方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)獲取卵細胞,體外受精;
(2)從卵母細胞中分離出第一極體和第二極體;
(3)對第一極體和第二極體分別進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增,然后進行基因組高通量測序;
(4)由第一極體和第二極體的測序結(jié)果鑒定出第一極體和第二極體中所有23條染色體的拷貝數(shù)是0個、1個、2個、3個、還是4個拷貝;并選擇其第一極體和第二極體中所有23條染色體中每號染色體在兩個極體中拷貝數(shù)總和均為3的卵細胞進行胚胎移植。
5.一種在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的的方法,其特征在于該方法包括以下步驟:
(1)獲取卵細胞,體外受精;
(2)從卵母細胞中分離出第一極體和第二極體;
(3)對第一極體和第二極體分別進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增,然后進行基因組高通量測序;
(4)根據(jù)第一極體和第二極體的測序結(jié)果鑒定出第一極體和第二極體中所有23條染色體中的染色體易位、倒位等染色體異常情況;并選擇根據(jù)其第一極體和第二極體中染色體異常情況推斷出卵細胞本身染色體并無異常的卵細胞進行胚胎移植。
6.一種在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)獲取卵細胞,體外受精;
(2)從卵母細胞中分離出第一極體和第二極體;
(3)對第一極體和第二極體分別進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增,然后進行基因組高通量測序;
(4)結(jié)合第一極體和第二極體的測序結(jié)果鑒定出卵細胞中含有產(chǎn)生遺傳疾病的點突變的卵細胞,并將其排除掉,不用于胚胎移植。
7.一種在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)獲取卵細胞,體外受精;
(2)從卵母細胞中分離出第一極體和第二極體;
(3)對第一極體和第二極體分別進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增,然后進行基因組高通量測序;
(4)結(jié)合第一極體和第二極體的測序結(jié)果鑒定出第一極體和第二極體中所有來自女性供體的基因序列多態(tài)性以及相應的等位基因,并選擇根據(jù)其第一極體和第二極體中基因序列多態(tài)性以及相應的等位基因情況推斷出卵細胞本身具有特定等位基因以及相應的特定表型性狀的卵細胞進行胚胎移植。
8.根據(jù)權(quán)利要求4至7中任一項所述的在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的方法,其特征在于,所述進行單細胞全基因組非指數(shù)擴增的步驟包括裂解細胞,再用MALBAC技術(shù)對單細胞全基因組DNA進行擴增。
9.根據(jù)權(quán)利要求4所述的在體外受精過程中篩選卵細胞用于著床前胚胎移植的方法,其特征在于,步驟(4)中先由權(quán)利要求1-3任一項所述的方法確定供體女性基因組單體型,再將單體型信息和第一極體和第二極體的測序結(jié)果結(jié)合鑒定出第一極體和第二極體中所有23條染色體的拷貝數(shù)是0個、1個、2個、3個、還是4個拷貝。
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