[發(fā)明專利]分析染色體易位的方法及其系統(tǒng)

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201280023177.2
• 申請日: 2012-03-12
• 公開（公告）號: CN103534359A
• 公開（公告）日: 2014-01-22
• 發(fā)明（設(shè)計）人: M.法雷爾;T.M.格羅甘;H.尼塔;張文軍
• 申請（專利權(quán)）人: 文塔納醫(yī)療系統(tǒng)公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京市柳沈律師事務(wù)所 11105
• 代理人: 岑曉東

發(fā)明領(lǐng)域

本公開內(nèi)容涉及用于分析染色體易位的系統(tǒng)和方法，并且具體地涉及通過原位雜交對染色體易位的分析。

發(fā)明背景

基于對取自患病生物體的組織或細胞樣品的判讀來對疾病進行診斷、預(yù)后和確定治療已在過去數(shù)年中急劇擴張。除了傳統(tǒng)的組織學染色技術(shù)和免疫組化測定法外，現(xiàn)在還使用原位技術(shù)如原位雜交和原位聚合酶鏈式反應(yīng)來幫助診斷人的疾病狀態(tài)。如此，存在多種不僅能評估細胞形態(tài)學而且能評估細胞和組織內(nèi)特定大分子存在的技術(shù)。

分子細胞遺傳技術(shù)如生色原位雜交（CISH）將染色體的視覺評估（染色體組型分析）與分子技術(shù)組合。分子細胞遺傳學方法基于核酸探針與其在細胞內(nèi)的互補核酸的雜交。針對特定染色體區(qū)域的探針會識別中期染色體上或分裂間期細胞核內(nèi)（例如組織樣品中）的其互補序列并與之雜交。已開發(fā)出用于多種診斷和研究目的的探針。

序列探針與特定染色體區(qū)域或基因中的單拷貝DNA序列雜交。這些是用于鑒定與感興趣的綜合征或狀況有關(guān)的染色體關(guān)鍵區(qū)域或基因的探針。在分裂中期染色體上，這類探針與每條染色單體雜交，每條染色體通常給出兩個較小的離散信號。

序列探針如重復消減探針或獨特序列探針（參見例如U.S.2011/0160076）的雜交已使得與大量疾病和綜合征有關(guān)的染色體異常的檢測成為可能，所述疾病和綜合征包括組成性遺傳異常，如微缺失綜合征（microdeletion?syndrome）、染色體易位、基因擴增和非整倍性綜合征、新生性疾病以及病原體感染。最通常地，將這些技術(shù)應(yīng)用于顯微鏡載玻片上的標準細胞遺傳制備物。另外，這些規(guī)程可以對經(jīng)福爾馬林固定的、經(jīng)石蠟包埋的組織的載玻片、血液或骨髓涂片以及直接固定的細胞或其它核分離物使用。

可以將從這些測定法獲得的信息用于診斷患者中的疾病，確定患有疾病的患者的預(yù)后，還有用于確定患有疾病的患者的治療過程。在許多情況中，可以將特定標志物的存在與預(yù)測的藥物功效相關(guān)聯(lián)。

非小細胞肺癌（NSCLC）是一種在肺組織中形成惡性（癌）細胞的疾病。NSCLC實際上是一組肺癌，其以在癌癥中發(fā)現(xiàn)的細胞種類以及該細胞在顯微鏡下看上去如何命名。三種主要類型的非小細胞肺癌是鱗狀細胞癌、大細胞癌和腺癌。NSCLC是最常見的肺癌種類。

鱗狀細胞癌是一種在鱗狀細胞中開始的癌癥，所述鱗狀細胞是看上去像魚鱗的薄的、平坦的細胞。這也稱作表皮樣癌。大細胞癌是可以在數(shù)種類型的大細胞中開始的癌癥。腺癌是一種在作為肺泡襯里并生成如粘液等物質(zhì)的細胞中開始的癌癥。其它不太常見的非小細胞肺癌類型為：多形性、類癌腫瘤、唾液腺癌和未分類的癌。

吸香煙、煙斗或雪茄是NSCLC的最常見起因。人在生命中開始吸煙越早，人吸得越頻繁和人吸得年數(shù)越長，則風險越大。如果人停止吸煙，則風險隨著歲月流逝而變低。

經(jīng)常同時進行檢測、診斷并分期非小細胞肺癌的測試和規(guī)程。一般使用下列測試和規(guī)程：胸部x射線；CBC；尋找癌細胞的痰測試；骨掃描；胸的CT掃描；胸的MRI；正電子發(fā)射斷層攝影術(shù)（PET）掃描；和胸腔穿刺術(shù)。在一些情況中，采用活組織檢查并分析。如果活組織檢查揭示肺癌的存在，那么將進行更多的成像測試來確定癌癥階段。階段指腫瘤的大小和其已擴散的程度。非小細胞肺癌被分成5個階段：0期-癌癥尚未擴散超出肺的內(nèi)部襯里；I期-癌癥較小且還未擴散到淋巴結(jié)；II期-癌癥已擴散到初始腫瘤附近的一些淋巴結(jié)；III期-癌癥已擴散到附近組織或擴散到遠處的淋巴結(jié)；IV期-癌癥已擴散到身體的其它器官如另一個肺、腦或肝。

有許多用于非小細胞肺癌的不同類型的治療。治療依賴于癌癥階段。外科手術(shù)經(jīng)常是對患有尚未擴散到超出附近淋巴結(jié)的非小細胞肺癌的患者的一線治療。外科醫(yī)生可以除去：肺葉之一（葉切除術(shù)）；僅肺的小部分（楔形（wedge）或段(segment)切除）；完整的肺（全肺切除術(shù)）。一些患者需要化療?；熓褂盟幬飦須⑺腊┘毎⑹剐碌陌┘毎Ｖ股L。當癌癥擴散時（IV期），經(jīng)常使用單獨的化療。

在一些情況中，進行遺傳分析來確定NSCLC的最佳治療過程。例如，在EGFR基因中具有特定突變的一些患者響應(yīng)EGFR酪氨酸激酶抑制劑如吉非替尼（gefitinib）。另一個例子是，7%的具有EML4-ALK易位的NSCLC可以受益于在臨床試驗中的ALK抑制劑。