[發(fā)明專利]SYBR GreenⅠ熒光定量PCR檢測類豬圓環(huán)病毒P1的引物有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210436587.1 | 申請日: | 2012-11-06 |
| 公開(公告)號: | CN102888471A | 公開(公告)日: | 2013-01-23 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 溫立斌;何孔旺;高曉靜;王小敏;李彬;郭容利;俞正玉;茅愛華;倪艷秀;張雪寒;呂立新;周俊明;胡屹屹;汪偉;葉青;祝昊丹;于洋;沈江萍;周萍 | 申請(專利權(quán))人: | 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
| 代理公司: | 南京經(jīng)緯專利商標代理有限公司 32200 | 代理人: | 張素卿 |
| 地址: | 210014 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | sybr green 熒光 定量 pcr 檢測 圓環(huán) 病毒 p1 引物 | ||
1.一種類豬圓環(huán)病毒P1的SYBR?Green?I實時熒光定量PCR檢測引物,其特征在于,
上游引物:?5'?AAGACCCCCCACTTAAACCC?3'?;
下游引物:?5'?GAGAGGCGGGTGTTGAAGAT?3'
其目的擴增片段為119?bp。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的引物,其用于類豬圓環(huán)病毒P1的SYBR?Green?I實時熒光定量PCR檢測方法為:
(1)定量標準質(zhì)粒的構(gòu)建與制備
以提取的類豬圓環(huán)病毒P1?DNA為模板,用上游引物和下游引物進行PCR擴增含有靶序列的基因片段,PCR反應(yīng)體系為?2×PCR?TaqMix?12.5μL、50μmol/L權(quán)利要求1所述的上游引物0.25μL、50μmol/L的下游引物0.25μL、DNA模板2.5μL、無菌雙蒸水9.5μL,總反應(yīng)體系為25μL;
反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變形30s,56℃退火30s,72℃延伸30s,35個循環(huán),72℃延伸10?min;
PCR反應(yīng)結(jié)束后,產(chǎn)物于質(zhì)量比2%瓊脂糖凝膠中進行電泳;
PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳鑒定后,通過膠回收純化目的片段,然后將權(quán)利要求1所述的目的片段119?bp與pMD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,進行測序鑒定,重組質(zhì)粒用質(zhì)粒小提試劑盒進行提純,獲得定量標準質(zhì)粒;
(2)抽提樣品病毒DNA,與標準質(zhì)粒按照以下定量PCR反應(yīng)體系和程序進行擴增:
PCR反應(yīng)體系為:12.5μL??2×UltraSYBR?Mix,?10μM正向引物、反向引物各0.025μL,待測樣品的DNA?2μL,補充雙蒸水至25μL;
PCR反應(yīng)程序為:95℃?10min;?95℃?15?sec,?60℃?30?sec,進行40個循環(huán);
待測樣品的結(jié)果判定:當(dāng)待測樣品實時熒光定量PCR檢測結(jié)果有“S”型擴增曲線,Ct值≤34.0且?Tm值介于82.0℃——83.0℃之間時,判定待測樣品中含有類豬圓環(huán)病毒P1。
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