[發(fā)明專利]一種目標(biāo)基因捕獲方法及其應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210434984.5 | 申請(qǐng)日: | 2012-11-02 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102925428A | 公開(公告)日: | 2013-02-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 肖珊;李萍;陶曄;林芹;胡秋萍 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12N15/10 | 分類號(hào): | C12N15/10;C40B40/08 |
| 代理公司: | 上海光華專利事務(wù)所 31219 | 代理人: | 許亦琳;余明偉 |
| 地址: | 201203 上海市浦東新*** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 目標(biāo) 基因 捕獲 方法 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種目標(biāo)基因捕獲方法,包括:將打斷成2-4k的基因組DNA片段與載體連接獲得重組載體;重組載體電轉(zhuǎn)化GB05RedTrfA+pSC101β感受態(tài)細(xì)胞,培養(yǎng)獲得重組載體細(xì)菌文庫(kù);制備帶篩選標(biāo)記的待捕獲目標(biāo)基因的雙鏈DNA重組片段;將重組片段與重組載體細(xì)菌文庫(kù)中的陽(yáng)性克隆重組,篩選陽(yáng)性克隆獲得含有目標(biāo)基因片段的細(xì)菌克隆。
2.如權(quán)利要求1所述目標(biāo)基因捕獲方法,具體包括下列步驟:
1)獲取基因組DNA,將基因組DNA打斷成片段大小主要為2-4k的片段,使用瓊脂糖凝膠電泳回收大小為2-4k的片段,對(duì)回收片段進(jìn)行末端補(bǔ)平;
2)將打斷并補(bǔ)平末端的片段與含有氨芐抗性的載體連接獲得重組載體;
3)將步驟2)獲得的重組載體電轉(zhuǎn)入用GB05RedTrfA+pSC101β做的感受態(tài)細(xì)胞,并在合適的條件下在固體培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)感受態(tài)細(xì)胞直至長(zhǎng)出大量含有重組載體的克隆,得到重組載體細(xì)菌文庫(kù);
4)制備兩翼為待捕獲目標(biāo)基因的同源臂,中間插入篩選標(biāo)記的雙鏈DNA重組片段;
5)將步驟4)制備的重組片段與重組載體細(xì)菌文庫(kù)中的陽(yáng)性克隆重組,利用所述雙鏈DNA重組片段中的篩選標(biāo)記篩選獲得含有目標(biāo)基因片段的細(xì)菌克隆。
3.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟1)中,采用CTAB法、SDS法、苯酚抽提法、濃鹽法或煮沸法獲取基因組DNA。
4.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟1)中,使用DNA打斷儀將基因組DNA打斷成大小為2-4K的片段。
5.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟1)中,所述含有氨芐抗性的載體選自PUC19載體、PUC18載體或pMD18-T載體。
6.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟3)中,培養(yǎng)溫度約30℃。
7.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟4)中,所述同源臂的長(zhǎng)度為40-60bp,所述篩選標(biāo)記與步驟2)所采用的含有氨芐抗性的載體及步驟3)所選用的感受態(tài)細(xì)胞GB05RedTrfA+pSC101β中的抗性標(biāo)記進(jìn)行區(qū)分。
8.如權(quán)利要求7所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,所述篩選標(biāo)記為卡那霉素抗性篩選標(biāo)記。
9.如權(quán)利要求2所述目標(biāo)基因捕獲方法,其特征在于,步驟5)中,重組具體步驟為:利用含有氨芐抗性的培養(yǎng)基培養(yǎng)步驟3)獲得的重組載體細(xì)菌文庫(kù)中的陽(yáng)性克隆,然后以鼠李糖誘導(dǎo)步驟4)制備的重組片段與所述陽(yáng)性克隆重組,最后用重組片段中的篩選標(biāo)記篩選獲得含有目標(biāo)基因片段的細(xì)菌克隆。
10.一種基因組DNA文庫(kù),采用包括下列步驟的方法制得:將打斷成2-4k的基因組DNA片段與含有氨芐抗性的載體連接獲得重組載體;重組載體電轉(zhuǎn)化GB05RedTrfA+pSC101β感受態(tài)細(xì)胞,培養(yǎng)獲得重組載體細(xì)菌文庫(kù)。
11.如權(quán)利要求10所述基因組DNA文庫(kù),其特征在于,所述基因組DNA文庫(kù)采用權(quán)利要求2-6任一權(quán)利要求所述目標(biāo)基因捕獲方法中的步驟1)-步驟3)制得。
12.權(quán)利要求1-9任一權(quán)利要求所述目標(biāo)基因捕獲方法或權(quán)利要求10或11所述基因組DNA文庫(kù)在基因研究領(lǐng)域的用途。
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